Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,071,512 | T→G | 23.9% | pseudogene (92/168 nt) | yeeW → | CP4‑44 prophage; uncharacterized protein;Phage or Prophage Related |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,071,512 | 0 | T | G | 23.9% | 271.7 / 145.6 | 201 | pseudogene (92/168 nt) | yeeW | CP4‑44 prophage; uncharacterized protein;Phage or Prophage Related |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (78/74); new base G (22/26); total (101/100) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.20e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.75e-01 |
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
CGACAATTACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAAC > CP009273/2071367‑2071659 | cgACAATTACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCactgaactga < 1:2881376/148‑1 (MQ=255) cgACAATTACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCactgaactga < 1:3149765/148‑1 (MQ=255) cgACAATTACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCactgaacgga < 2:1208924/148‑1 (MQ=255) cAATTACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATta > 2:3119034/1‑148 (MQ=255) tACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATtaataa < 2:528744/148‑1 (MQ=255) tACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATtaataa > 2:1617619/1‑148 (MQ=255) tACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATtaataa > 1:2913332/1‑148 (MQ=255) cAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAgg < 2:192132/148‑1 (MQ=255) aGAACGGTAAATAACATTACACTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGc < 2:1691748/148‑1 (MQ=255) aaCGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGTCCg < 2:914126/148‑1 (MQ=255) ggTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTg > 1:739398/1‑148 (MQ=255) tAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACg < 2:907641/148‑1 (MQ=255) aTTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTa < 1:2630591/148‑1 (MQ=255) aTTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTa < 2:2620441/148‑1 (MQ=255) ttACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTAt > 2:2524628/1‑148 (MQ=255) ttACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTAt > 2:1171778/1‑148 (MQ=255) ttACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTAt > 1:999637/1‑148 (MQ=255) ttACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTAt > 2:1118298/1‑148 (MQ=255) cccTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCa < 1:75808/148‑1 (MQ=255) tGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTc > 2:3245098/1‑148 (MQ=255) gggTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTcc < 1:1610001/148‑1 (MQ=255) gTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCcgc > 2:297978/1‑148 (MQ=255) tAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCcgcg > 1:2256028/1‑148 (MQ=255) aaGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCgt < 2:1288082/148‑1 (MQ=255) aGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCgtg > 1:146487/1‑148 (MQ=255) aGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCgtg > 1:209148/1‑148 (MQ=255) gTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCgtgg < 2:151084/148‑1 (MQ=255) aTCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCgtggtg < 1:800126/148‑1 (MQ=255) aTCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCgtggtg > 2:486758/1‑148 (MQ=255) ccGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGa > 1:1105180/1‑148 (MQ=255) ccGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGa > 2:2943177/1‑148 (MQ=255) gAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGa > 2:309323/1‑148 (MQ=255) gAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGa > 2:2023112/1‑148 (MQ=255) gAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGa < 2:1311113/148‑1 (MQ=255) gAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGa < 1:704388/148‑1 (MQ=255) gCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCg < 1:1193278/148‑1 (MQ=255) tgatgaCACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGActc < 2:650086/148‑1 (MQ=255) gatgaCACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGActct > 2:2380518/1‑148 (MQ=255) gatgaCACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGActct > 1:394556/1‑148 (MQ=255) gatgaCACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGActct < 2:252074/148‑1 (MQ=255) ggAAGCTGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAaca > 2:1024491/1‑148 (MQ=255) cGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGGCTCTACCGAAACACCGGCa < 2:1422205/148‑1 (MQ=255) gACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCaa < 1:3119030/148‑1 (MQ=255) cAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACt > 2:2068668/1‑148 (MQ=255) cAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACt < 1:2039253/148‑1 (MQ=255) aGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACtt > 1:2396910/1‑148 (MQ=255) gTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCAAATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATg < 1:55773/148‑1 (MQ=255) ttAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGc > 1:1561122/1‑148 (MQ=255) tAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGcc < 2:2913208/148‑1 (MQ=255) tAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACAATGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCAGAAAACGGTTATTAACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCAACCGAAACACCGGCAACATATGcc > 1:1137762/1‑148 (MQ=255) cggaCAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGc < 1:3172303/145‑1 (MQ=255) cGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGc > 1:2956091/1‑148 (MQ=255) gTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGcc < 1:1869755/148‑1 (MQ=255) aCAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCt < 2:731755/148‑1 (MQ=255) gcgcTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCAcc > 2:387160/1‑148 (MQ=255) gcgcTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCAcc < 1:2474761/148‑1 (MQ=255) gcgcTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCAcc > 1:2295477/1‑148 (MQ=255) cTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATAACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAAACGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGt > 1:3298547/1‑148 (MQ=255) atGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGt > 2:1548132/1‑148 (MQ=255) atGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAAAACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGt > 1:1334541/1‑148 (MQ=255) ggCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGa < 2:2396910/148‑1 (MQ=255) cacaTTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACa > 2:3396223/1‑148 (MQ=255) cacaTTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACa < 2:3300013/148‑1 (MQ=255) acaTTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACaa < 1:2725174/148‑1 (MQ=255) acaTTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACaa < 1:1007514/148‑1 (MQ=255) acaTTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACaa < 1:820910/148‑1 (MQ=255) caTTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAAt > 2:2544177/1‑148 (MQ=255) caTTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAAt < 2:2149957/148‑1 (MQ=255) aTTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATg < 2:3274526/148‑1 (MQ=255) ttGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGc > 2:456051/1‑148 (MQ=255) cGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTg < 2:3004978/148‑1 (MQ=255) cGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTg < 2:3130277/148‑1 (MQ=255) cGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTg < 2:194275/148‑1 (MQ=255) gTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGa < 1:3231089/148‑1 (MQ=255) gACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATAc < 2:3073221/148‑1 (MQ=255) aCATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACa < 2:2441568/148‑1 (MQ=255) cATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAg < 1:1786282/148‑1 (MQ=255) cATTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAg > 1:2197067/1‑148 (MQ=255) aTTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAgg > 1:602449/1‑148 (MQ=255) aTTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAgg < 1:644335/148‑1 (MQ=255) aTTGATGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAgg < 1:507061/148‑1 (MQ=255) tGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGt > 1:215212/1‑148 (MQ=255) tGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGt > 2:2749085/1‑148 (MQ=255) tGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGt > 1:1966943/1‑148 (MQ=255) tGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGt > 1:166757/1‑148 (MQ=255) tGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGt > 1:259530/1‑148 (MQ=255) aTGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGtat > 1:484101/1‑148 (MQ=255) aTGGTGTTAATATCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGtat > 2:2251782/1‑148 (MQ=255) gtgtTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGt < 1:2113994/148‑1 (MQ=255) ttAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGTCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGcc > 2:1331083/1‑148 (MQ=255) tAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCa > 1:1253482/1‑148 (MQ=255) atCACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTaa > 1:1161621/1‑148 (MQ=255) cACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAAcc > 2:1821569/1‑148 (MQ=255) cACTGAACGGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAAcc > 2:2021800/1‑148 (MQ=255) actgaacggaTTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACca > 2:2188709/1‑148 (MQ=255) ctgaactgaTTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACcac < 2:2111738/148‑1 (MQ=255) tgaactgaTTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACcaca < 1:252987/148‑1 (MQ=255) aacggaTTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGa > 1:345169/1‑148 (MQ=255) tgaTTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAAc > 2:847842/1‑148 (MQ=255) tgaTTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAAc < 1:2023112/148‑1 (MQ=255) | CGACAATTACAGAACGGTAAATAACATTACCCTGGGTAAGTATCCGGAGGCGAAATGATGACACTGGAAGCCGACAGCGTTAACGTACAGGCGCTGGATATGGGGCACATTGTCGTTGACATTGATGGTGTTAATATCACTGAACTGATTAATAAGGCCGCTGAAAACGGTTATTCACTCCGCGTGGTGGATGACCGTGACTCTACCGAAACACCGGCAACTTATGCCAGCCCTCACCAGTTGCTGTAAGACAATGCAGTGATACAGGGTATAGTGCCATTAACCACAGAAAC > CP009273/2071367‑2071659 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |