Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,138,039 | C→A | 63.5% | I431I (ATC→ATA) | yegE → | putative diguanylate cyclase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,138,039 | 0 | C | A | 63.5% | 109.3 / 270.8 | 214 | I431I (ATC→ATA) | yegE | putative diguanylate cyclase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/45); new base A (67/69); total (100/114) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.93e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.62e-01 |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
CGCAATGGCGATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGAGTGCGTGCTG > CP009273/2137893‑2138186 | cAATGGCGATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAAct > 2:1873154/1‑148 (MQ=255) aaTGGCGATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAActc < 1:3453447/148‑1 (MQ=255) aTGGCGATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCActct > 1:2216043/1‑148 (MQ=255) gCGATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGc > 1:2606582/1‑148 (MQ=255) gATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTa < 1:2830784/148‑1 (MQ=255) gATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTa < 1:1051630/148‑1 (MQ=255) aTGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTaa > 1:2055769/1‑148 (MQ=255) tgttgtCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAAc > 2:3448684/1‑148 (MQ=255) gttgtCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACg < 2:1490937/148‑1 (MQ=255) gttgtCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACg > 2:2964248/1‑148 (MQ=255) tgtCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGaa > 2:1706564/1‑148 (MQ=255) gggCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAgcggg > 1:40952/1‑148 (MQ=255) gggCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAgcggg < 1:3523321/148‑1 (MQ=255) cGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAgcgggcgg < 1:2167190/148‑1 (MQ=255) gTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGcgggcggg < 2:1601003/148‑1 (MQ=255) cttgcCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTg < 1:88471/148‑1 (MQ=255) cGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATc < 1:664970/148‑1 (MQ=255) ctcACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCtgg < 1:2521319/148‑1 (MQ=255) ctcACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCtgg < 2:2677009/148‑1 (MQ=255) cACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCtggga > 1:1102782/1‑148 (MQ=255) aCTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCtgggag > 2:1145480/1‑148 (MQ=255) gTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCtgggagtggg < 2:1804311/148‑1 (MQ=255) gcgcCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCtgggagtgggag < 2:1318283/148‑1 (MQ=255) cacaCGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGTTTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTCGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGTGTGGGAGTTGa < 2:2344976/148‑1 (MQ=255) acGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGc < 2:2155263/148‑1 (MQ=255) cGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGcc < 1:2809826/148‑1 (MQ=255) aTGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGaa > 2:305474/1‑148 (MQ=255) tGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAat < 1:2294520/148‑1 (MQ=255) cACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATAtt < 1:2907558/148‑1 (MQ=255) cgccgcTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATAtttt < 1:2964248/148‑1 (MQ=255) gccgcTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATAttttt < 1:2268838/148‑1 (MQ=255) ccgcTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTa < 1:3332439/148‑1 (MQ=255) ccgcTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTa < 2:517093/148‑1 (MQ=255) ctctATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCt > 2:1420282/1‑148 (MQ=255) ctctATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCt > 2:3193082/1‑148 (MQ=255) tctATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTg > 2:3214780/1‑148 (MQ=255) tctATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTg > 1:1823381/1‑148 (MQ=255) ctATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTgg < 1:3361997/148‑1 (MQ=255) aTTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGa < 1:3269364/148‑1 (MQ=255) aTTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGa < 1:1690682/148‑1 (MQ=255) tttATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATa < 1:193317/148‑1 (MQ=255) tttATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATa > 1:902741/1‑148 (MQ=255) ttATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATaa < 1:3479897/148‑1 (MQ=255) aTCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGc < 1:2068816/148‑1 (MQ=255) aTCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGc > 1:2110182/1‑148 (MQ=255) cGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCgg < 2:602369/148‑1 (MQ=255) cGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCgg < 2:602443/148‑1 (MQ=255) cGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCgg < 1:2685427/148‑1 (MQ=255) gCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGa < 1:1323166/148‑1 (MQ=255) cTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGAt > 2:481390/1‑148 (MQ=255) tCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATg < 1:3397947/148‑1 (MQ=255) tCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATg > 2:2205117/1‑148 (MQ=255) cAGATTGAAGACATTTACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGt < 2:169550/148‑1 (MQ=255) aGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGtt < 1:3041668/148‑1 (MQ=255) aGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGtt < 1:2105058/148‑1 (MQ=255) gATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTc > 2:3308453/1‑148 (MQ=255) gATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGCGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTc < 2:872803/148‑1 (MQ=255) aGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTg > 2:1774151/1‑148 (MQ=255) aGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTg < 1:91162/148‑1 (MQ=255) aGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTg > 2:2684581/1‑148 (MQ=255) gACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGt > 2:631633/1‑148 (MQ=255) aCATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTa > 1:2520819/1‑148 (MQ=255) aCATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTa < 1:143797/148‑1 (MQ=255) cATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTAt < 2:2086924/148‑1 (MQ=255) aTTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATg > 1:2894939/1‑148 (MQ=255) ttAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGACTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGa > 2:3038537/1‑148 (MQ=255) ttAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGa > 2:1301450/1‑148 (MQ=255) ttAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGa > 2:738593/1‑148 (MQ=255) aaCGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGaaa > 1:705489/1‑148 (MQ=255) aaCGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGaaa < 1:1267514/148‑1 (MQ=255) cGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAAtt > 1:1051914/1‑148 (MQ=255) gAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATtc < 2:629994/148‑1 (MQ=255) aGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGTTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATtcc > 2:3351417/1‑148 (MQ=255) aGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATtcc > 1:533847/1‑148 (MQ=255) gCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATtcct < 1:187429/148‑1 (MQ=255) gCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATtcct < 2:2894402/148‑1 (MQ=255) aaaaCGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCca > 1:3336565/1‑148 (MQ=255) aaCGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCcaca > 1:1479439/1‑148 (MQ=255) aCGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACat > 1:125288/1‑148 (MQ=255) aCGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACat < 2:1329544/148‑1 (MQ=255) cGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACata > 2:338561/1‑148 (MQ=255) gCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACatat < 1:641711/148‑1 (MQ=255) cACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATc > 1:3242441/1‑148 (MQ=255) cACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATc > 1:2988002/1‑148 (MQ=255) aCCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCa < 1:789747/148‑1 (MQ=255) aCCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCa < 1:960620/148‑1 (MQ=255) ccGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCaa < 1:470508/148‑1 (MQ=255) gTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACt < 2:2606582/148‑1 (MQ=255) aaTCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGc < 2:1486424/148‑1 (MQ=255) cAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAgg > 1:2339168/1‑148 (MQ=255) cTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGt < 1:3079870/148‑1 (MQ=255) cTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGt < 2:2572990/148‑1 (MQ=255) gATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTAc > 1:1070812/1‑148 (MQ=255) tGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGa < 1:2578690/148‑1 (MQ=255) tGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGTGAGTGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTTGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGACCTGGCAGGTGTGGTACGa < 2:2005823/148‑1 (MQ=255) tGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGa < 2:2110182/148‑1 (MQ=255) aGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGAgtg > 2:3532296/1‑148 (MQ=255) aGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGAgtg > 2:1336169/1‑148 (MQ=255) cATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGAgtgcgtg > 2:1325923/1‑148 (MQ=255) tCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGAGTGCGtgct > 1:2420584/1‑148 (MQ=255) | CGCAATGGCGATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGAGTGCGTGCTG > CP009273/2137893‑2138186 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |