| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,198,343 | C→A | 100% | S90Y (TCT→TAT) | yehL → | putative ABC superfamily transporter ATP‑binding subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,198,343 | 0 | C | A | 95.4% | 715.4 / 22.6 | 241 | S90Y (TCT→TAT) | yehL | putative ABC superfamily transporter ATP‑binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/9); new base A (108/121); total (110/131) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.94e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
GCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAGCGCT > CP009273/2198198‑2198487 | gCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAAtatc > 1:121198/1‑148 (MQ=255) cGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATatct < 2:2641753/148‑1 (MQ=255) ggCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATAtctt < 1:1017676/148‑1 (MQ=255) gCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATAtcttc > 2:1978163/1‑148 (MQ=255) cccGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATAtcttct < 1:426567/148‑1 (MQ=255) cGTCCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCttcttt < 2:224957/148‑1 (MQ=255) gTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCttctttc < 1:619690/148‑1 (MQ=255) gTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCttctttc > 1:1328478/1‑148 (MQ=255) gTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCttctttc < 1:1492534/148‑1 (MQ=255) cTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGa < 2:1609055/148‑1 (MQ=255) tttATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAAt > 1:1886714/1‑148 (MQ=255) ttATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAAtt > 2:591698/1‑148 (MQ=255) tATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTa < 2:1848821/148‑1 (MQ=255) aTCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTAc < 1:633568/148‑1 (MQ=255) aTCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTAc > 1:3444819/1‑148 (MQ=255) ccTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTg > 1:3288998/1‑148 (MQ=255) ccTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTg > 1:2313092/1‑148 (MQ=255) cTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTgg < 1:1763470/148‑1 (MQ=255) tGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCa < 1:2887479/148‑1 (MQ=255) tGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCa < 1:1085118/148‑1 (MQ=255) ggCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCaa < 1:877934/148‑1 (MQ=255) acgaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGc > 2:3299667/1‑148 (MQ=255) cgaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCt > 2:1992203/1‑148 (MQ=255) gaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTATCCCCACCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAAAATCTTCTTTCTGAATTACAGGCAACCGCTa > 1:3521959/1‑148 (MQ=255) gaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTa > 1:2055762/1‑148 (MQ=255) aGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTAtt > 1:1865444/1‑148 (MQ=255) aGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTAtt > 2:3421940/1‑148 (MQ=255) gcgcAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTa > 2:2924994/1‑148 (MQ=255) gcAAAATATCACCCGGAAAGTGGTGAATAGCCCCGCCGCTGTAGTACGTTTGTTAGTCACTCGTGCTACCGGCCGCGGTTTGCTGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAgc < 2:2280407/148‑1 (MQ=255) aaTATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCCAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAgcggcg > 1:662184/1‑148 (MQ=255) atatCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGa > 2:3542540/1‑148 (MQ=255) atatCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGa < 2:2292550/148‑1 (MQ=255) atatCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGa < 1:2925076/148‑1 (MQ=255) atCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATg > 2:1491439/1‑148 (MQ=255) aGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCg > 2:2185898/1‑148 (MQ=255) aGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCg < 2:2357698/148‑1 (MQ=255) ccGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCggg < 1:2658793/148‑1 (MQ=255) ccGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCggg > 1:572248/1‑148 (MQ=255) ccGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCggg > 1:2514903/1‑148 (MQ=255) ccGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCggg < 1:1564124/148‑1 (MQ=255) cGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGt < 1:482137/148‑1 (MQ=255) gTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGtt < 2:1836161/148‑1 (MQ=255) aGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAAcc < 2:790515/148‑1 (MQ=255) ggtgATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATc > 2:166392/1‑148 (MQ=255) ggtgATTAGACCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATc < 2:1159661/148‑1 (MQ=255) ttAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAggg > 2:1094838/1‑148 (MQ=255) ttAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAggg > 1:1147296/1‑148 (MQ=255) gCCCCTCCGCTGTCGAACGTATTTTAGTCACTATTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGTGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCgg < 2:1782558/148‑1 (MQ=255) gCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCgg > 1:2789048/1‑148 (MQ=255) ccccTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCggg > 2:664750/1‑148 (MQ=255) ccccTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCggg < 1:1207626/148‑1 (MQ=255) cccTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCTAAATTTCTTATTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCgggg < 1:1139464/148‑1 (MQ=255) cccTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCgggg < 1:2284882/148‑1 (MQ=255) ccTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGc < 2:325314/148‑1 (MQ=255) cGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCt < 1:1020925/148‑1 (MQ=255) cGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCt < 1:3136370/148‑1 (MQ=255) aCGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGaa < 1:473086/148‑1 (MQ=255) aCGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGaa < 2:1184607/148‑1 (MQ=255) cGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAACATCTTCTNTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAg < 1:1811978/148‑1 (MQ=255) gTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACTGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGa < 2:3125303/148‑1 (MQ=255) gTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGa < 2:161329/148‑1 (MQ=255) tATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGGGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGat > 1:2852911/1‑148 (MQ=255) gTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatcaa < 1:2231174/148‑1 (MQ=255) tAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatcaaat > 2:632970/1‑148 (MQ=255) tCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatcaaatcaa < 2:125111/148‑1 (MQ=255) cACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAg > 1:2343614/1‑148 (MQ=255) cACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAg < 2:2410558/148‑1 (MQ=255) aCTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGt > 2:3305574/1‑148 (MQ=255) ctctTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTa > 1:357606/1‑148 (MQ=255) ctctTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTa < 1:994754/148‑1 (MQ=255) tGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGc < 2:137021/148‑1 (MQ=255) tACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTgg < 1:1950404/148‑1 (MQ=255) aCCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGa < 2:3099919/148‑1 (MQ=255) aCCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATAAAGTATGGCTGGa > 1:3026058/1‑148 (MQ=255) cGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAAc < 1:3254548/148‑1 (MQ=255) cGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAAc < 1:551412/148‑1 (MQ=255) ggTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGccc < 2:1231123/148‑1 (MQ=255) ttGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGc < 1:2576753/148‑1 (MQ=255) gATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCtt < 1:2539170/148‑1 (MQ=255) gTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTatc < 1:271540/148‑1 (MQ=255) ttGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTatca > 1:3185626/1‑148 (MQ=255) ggtggGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTatcaat < 1:1236110/148‑1 (MQ=255) ggtggGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTatcaat < 1:678111/148‑1 (MQ=255) gggggAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCAt < 1:1445250/148‑1 (MQ=255) ggggAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATg < 2:3085057/148‑1 (MQ=255) ggggAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATg > 1:1621360/1‑148 (MQ=255) ggggAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATg > 1:335745/1‑148 (MQ=255) gAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTc < 1:815976/148‑1 (MQ=255) aaCCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTcc > 1:803742/1‑148 (MQ=255) aaCCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTcc > 1:2591046/1‑148 (MQ=255) ccGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGt > 2:2871785/1‑148 (MQ=255) gggTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCa < 1:3221548/148‑1 (MQ=255) ggTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCaa < 2:520187/148‑1 (MQ=255) ggTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCaa > 2:553581/1‑148 (MQ=255) cGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGaa < 1:527983/148‑1 (MQ=255) cGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGaa < 1:2342510/148‑1 (MQ=255) gCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAg > 2:275126/1‑148 (MQ=255) cAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAgc > 1:1683895/1‑148 (MQ=255) cAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAgc > 1:1683825/1‑148 (MQ=255) aaTATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAGCGCt > 2:23285/1‑148 (MQ=255) | GCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAGCGCT > CP009273/2198198‑2198487 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |