Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 235,019 | C→A | 26.9% | V69L (GTA→TTA) | ykfM ← | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 235,019 | 0 | C | A | 26.9% | 361.9 / 32.4 | 227 | V69L (GTA→TTA) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (77/80); new base A (31/39); total (108/119) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.66e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
ATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAA > CP009273/234872‑235165 | tCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACa < 2:1033904/148‑1 (MQ=255) tCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACa < 2:1996479/148‑1 (MQ=255) tCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACa < 1:812514/148‑1 (MQ=255) gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAata < 2:2237508/148‑1 (MQ=255) aCAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTGTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAatat > 1:427993/1‑148 (MQ=255) aaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTa < 2:2662216/148‑1 (MQ=255) ggAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaaa < 1:2351021/148‑1 (MQ=255) aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAg > 2:1054111/1‑148 (MQ=255) aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAg < 2:832021/148‑1 (MQ=255) aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTaaaaat > 2:1053715/1‑147 (MQ=255) gCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAgg < 2:295350/148‑1 (MQ=255) cTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGa < 1:493109/148‑1 (MQ=255) cTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGa < 2:2146954/148‑1 (MQ=255) cTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGa < 1:1498995/148‑1 (MQ=255) ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGaaaa > 1:2170096/1‑148 (MQ=255) tAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGaaaaa > 2:1858866/1‑147 (MQ=255) aaaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACg > 2:568801/1‑148 (MQ=255) aaGGTGATATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGa < 2:2889099/148‑1 (MQ=255) aGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGAc > 2:3283784/1‑148 (MQ=255) ggTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTTAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAAATAAATTAATATTTTAAAAGTAAAAAGACa > 1:2125947/1‑148 (MQ=255) ggTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAAATACAAGAAAATTTAAAAATGAAAACGACa > 1:838178/1‑148 (MQ=255) tgatATTACGATATATATTATTAAAAATATAAGATTTAGCTGTTTTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTTTTTTATTATCTTAAGTAAATTTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATg < 2:49872/145‑1 (MQ=255) tGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTTTAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATTTAAAAGACAtt > 1:2766194/1‑147 (MQ=255) tGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACAtt > 1:2656083/1‑147 (MQ=255) cGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATACTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACAGaa > 1:1866056/1‑148 (MQ=255) tAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGca > 1:563627/1‑148 (MQ=255) tAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAAAca > 2:1546467/1‑148 (MQ=255) tAGATATTATAAAAAATATACGAGTTCGGTTTTTTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGAATACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGca < 1:2679564/148‑1 (MQ=255) agatattatTAAAAATATAATTGTTAGCTTTATTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACATTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATGTTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGcac < 2:2765421/145‑1 (MQ=255) gCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGcaca > 1:3211628/1‑148 (MQ=255) cTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACAg > 2:1298147/1‑148 (MQ=255) attattAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCGAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTTTTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa < 2:3164508/148‑1 (MQ=255) aTTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACCTGAAACCGAAGCACAGaa > 2:2667387/1‑148 (MQ=255) aTTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa > 2:891334/1‑148 (MQ=255) attAAAAATATAAGAGTTTGCTTTATTTTTATGTCTGTGGCGAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTATGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCa < 2:1637011/146‑1 (MQ=255) aaaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa > 2:1116714/1‑148 (MQ=255) aaaTTTAATAGTTAGCTTTTTTGTTTTGTTTGTGGCGAATTTGACTACATTCTTTTTTTTGTTTAAGAATTATTTTTTTATCTTAATTAAATTTAATTTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAtt < 2:2405158/148‑1 (MQ=255) aaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAtt < 2:3208063/148‑1 (MQ=255) aaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAtt > 2:1759306/1‑148 (MQ=255) aaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGTATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGACAACGACATGAAAACCAAGCACCGAATCAACaata > 2:2984144/1‑145 (MQ=255) tatttAGCTTTATTTTTATGTCTGTGGCGAAATTGAATACCTTCTTTTTTTTCATTAAGAATGATTTTATTAACTTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATc < 2:3102993/145‑1 (MQ=255) atttAGCTTTATTGTTTTGTCTGGGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCa < 2:1394739/146‑1 (MQ=255) gTTAGATGTTTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCAt < 2:131244/148‑1 (MQ=255) gCTGTTTTTTTTTGTCTGGGGCGATTTTGAATCCGTTCTTTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTATTTTCTTTATTAATATTAAATTATTATATAAAAATCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaaaa < 1:1280228/148‑1 (MQ=255) gCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAAATATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAAAGAATAATTAAAAAGGAAAACCACATTAAAACCAAGCACAGAATAAACAATCTCCAATAaaaaaa > 1:1909454/1‑148 (MQ=255) gCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAAACGAAGCACAGAATAAACAATCTCCAATCATaaaa > 1:3516820/1‑148 (MQ=255) ttATTGTTTTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTGTTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat < 2:778415/147‑1 (MQ=255) gTATTGTTTTGTCTGGGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat < 2:72133/148‑1 (MQ=255) gTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATAATTAAAAAGGAAAAACAAATGAAAACGAAGCACAGAAACAACAATCTCAAAACAAAAAaaat > 1:1467550/1‑148 (MQ=255) tATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAAATAAATTAATATTTAAAAATGAAAAAAAAAAGAAAACCAACCACACAAACAACATTCAACAATAAAAAAATAtt > 1:1016704/1‑148 (MQ=255) tATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTTATAATGATTTTATTATAGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAATTAAAAAGACAAGAAACAGAATCAAAGAATCAACAATCTCCAATCATAAAATAtt > 2:3319405/1‑148 (MQ=255) tATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGAATCAAAATTCTCCAATAAAAAAATAtt > 2:1825621/1‑148 (MQ=255) aTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATTAAACCGAAGCACAGAATCAACATTATCCAATAATAAAATAttt > 2:2281935/1‑148 (MQ=255) aTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg < 2:1496741/148‑1 (MQ=255) tCTGTGGCTAAATTGACTACCTTGTTTTTTTTTATTAACATTGTTTTTTTTATCGTAATTAAATTTAAATTAATATTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGc < 1:1680049/148‑1 (MQ=255) ctttgGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATAAAAATTAAATGAATATTAAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCa < 2:613360/145‑1 (MQ=255) tgGCTAATTTGACTACCTTTGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTATGAAAATTTAATTTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAttt < 1:2938078/148‑1 (MQ=255) tgGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAttt > 2:3508000/1‑148 (MQ=255) gCGAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTTTTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTtta < 2:3037892/148‑1 (MQ=255) gCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTtta < 2:3232056/148‑1 (MQ=255) taatttGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATAAAAATTAAATTAATATTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttatt < 1:3041398/144‑1 (MQ=255) aTTGACTACCTGCGTTTTTTTTATTAAGATTGTTTTTTTTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAACGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 1:1698355/148‑1 (MQ=255) tcaCTACCTTCGTTTTTTTGATTAACAATCATTTTATTAACTAAATAAAAATAAAATAAATATTAAAAAAGCAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGa < 1:2141650/146‑1 (MQ=255) tGACTACCTTGGTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGa < 1:1766707/148‑1 (MQ=255) tGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAAAGAATATTTAAAAATGAAAAACACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTAAACAATAATAAAATATTTACGTGGAGCATTTTattattta > 2:343304/1‑146 (MQ=255) gACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGaa < 2:2752592/148‑1 (MQ=255) aCTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATCTCCAATCATAAAAAATTTACGTGGAGCATTTTATTATTGAat > 2:1734238/1‑148 (MQ=255) tACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAATTAAAAAGACATGAAACCGAAGCACAGAAAAAAAAATATCCAATAATAAAAAATTTAAGTGGATCATTTTATTATTTAatat > 2:2539553/1‑148 (MQ=255) aaCCTTCTTTTTTTTGATAAAGAATGATTTTATTATCGTAATAAAAATTAAATTAATATTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAatat < 1:2488919/147‑1 (MQ=255) ttatttttttttATTAATATTTTTTTTATTATCTTAATTAAAATTACATCAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATagag < 1:3358634/144‑1 (MQ=255) ttCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCGTAATTAAATTTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATagag < 1:2368232/148‑1 (MQ=255) ttCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATAAAAATTACATTAATATTAAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATagag < 1:1488517/148‑1 (MQ=255) tcttttttttGATTAACAATGATTTTATTATCGTAATTAAATTTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 2:958398/145‑1 (MQ=255) tttttttttATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGtt < 1:572858/147‑1 (MQ=255) ttttttTATTAAGAATGATTTTATTTTCTTAAGTAAATTTAAATTAATTTTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTa < 1:2568105/148‑1 (MQ=255) ttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTa > 2:596936/1‑148 (MQ=255) ttttttATTAATAATTTTTTTATTATCTTAATTAAATTTACATTAATATTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTaa < 1:2520220/148‑1 (MQ=255) ttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTc > 1:1677397/1‑148 (MQ=255) tGATAAAGAATGATTTTATTATCGTAATAAAAATTACATGAAAATTAAAAAACGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTcc < 1:1825548/148‑1 (MQ=255) ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt > 1:366437/1‑148 (MQ=255) tAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa > 2:6698/1‑148 (MQ=255) tAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa > 1:632296/1‑148 (MQ=255) aaTTATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaaa < 2:1902776/148‑1 (MQ=255) aaTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaaa > 1:2539856/1‑148 (MQ=255) aaTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaaa > 2:3313568/1‑148 (MQ=255) ttaTTTTATTATCTTAATTAAAATAAAATTAATATTAAAAAAGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc < 1:1248130/146‑1 (MQ=255) tGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc > 2:2330678/1‑148 (MQ=255) ttttATTATCTTAAGTAAATTTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAACATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACaaa < 2:1172664/148‑1 (MQ=255) ttttATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACaaa > 2:96475/1‑148 (MQ=255) ttatattaattaaAATTAAATTAATATATAAAAATTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTACAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGc < 1:3407180/142‑1 (MQ=255) tatCGTAATTAAATTTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCa < 2:2496342/148‑1 (MQ=255) tatCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCa < 2:2203480/148‑1 (MQ=255) tCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAtt > 1:899461/1‑148 (MQ=255) tCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAtt > 1:3182895/1‑148 (MQ=255) aattaaAATTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAAt < 1:2783256/145‑1 (MQ=255) aagtaaAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAAt > 2:2047249/1‑148 (MQ=255) ttaaAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGc < 2:3204571/147‑1 (MQ=255) ttACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGaa > 1:2192649/1‑148 (MQ=255) tACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGaaa > 1:1365489/1‑148 (MQ=255) aCATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGaaaa < 2:1467550/148‑1 (MQ=255) | ATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAA > CP009273/234872‑235165 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |