| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,736,714 | C→A | 100% | R325S (CGC→AGC) | yfiN → | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase with an N‑terminal periplasmic domain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,736,714 | 0 | C | A | 96.8% | 675.4 / 11.7 | 218 | R325S (CGC→AGC) | yfiN | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase with an N‑terminal periplasmic domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/5); new base A (128/83); total (130/88) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
CCCGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCA > CP009273/2736568‑2736858 | cccGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCg < 2:3566969/148‑1 (MQ=255) ccGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGc > 2:2091372/1‑148 (MQ=255) ccGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGc < 1:2014388/148‑1 (MQ=255) cGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGcc < 2:2642554/148‑1 (MQ=255) cGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGcc < 2:3449242/148‑1 (MQ=255) cGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATAAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGcc > 1:3551647/1‑148 (MQ=255) gAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCt < 2:689230/148‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCt < 2:248868/148‑1 (MQ=255) aaCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGggc > 2:885391/1‑148 (MQ=255) cGTCGGCGTTACTATTTCTTTATGGCGAAAATTTCAAATAAATCAAAGATACCTTGTGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTTAATGAAATAGCAAAACGGTTAGCTCAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCAGgtcgg > 2:815477/1‑148 (MQ=255) cGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGggcgg > 2:2784212/1‑148 (MQ=255) gCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATg > 2:519590/1‑148 (MQ=255) ttACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAAt < 1:582130/148‑1 (MQ=255) cTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCg > 2:2616289/1‑148 (MQ=255) tATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGc > 1:633588/1‑148 (MQ=255) aTTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCt > 1:1948104/1‑148 (MQ=255) aTTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCt < 1:1008563/148‑1 (MQ=255) ttCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTAt > 1:3391460/1‑148 (MQ=255) tggtGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTg > 1:2845014/4‑148 (MQ=255) aTGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGct < 2:225929/148‑1 (MQ=255) aTGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGct > 1:975199/1‑148 (MQ=255) aTGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGct > 2:1358840/1‑148 (MQ=255) gCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTa > 1:1477861/1‑148 (MQ=255) cGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTat > 1:1167662/1‑148 (MQ=255) cGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTat > 2:3107280/1‑148 (MQ=255) tAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTatgat > 1:1876166/1‑148 (MQ=255) tttCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTa < 1:1324577/148‑1 (MQ=255) ttCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTAc > 2:290008/1‑148 (MQ=255) ttCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTAc > 2:1403250/1‑148 (MQ=255) cAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAg < 2:1698654/148‑1 (MQ=255) aaaTACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGt < 1:3139507/148‑1 (MQ=255) aaTACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTc > 2:2832561/1‑148 (MQ=255) aTACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCg < 2:668613/148‑1 (MQ=255) tACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCgg > 1:482310/1‑148 (MQ=255) tACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCgg > 1:482786/1‑148 (MQ=255) cATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGaa > 1:2510015/1‑148 (MQ=255) tCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATc > 1:2964145/1‑148 (MQ=255) cAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCt > 2:1652102/1‑148 (MQ=255) aTGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGa < 1:289663/148‑1 (MQ=255) tGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGaa > 2:923508/1‑148 (MQ=255) tGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGaa > 2:2980696/1‑148 (MQ=255) aCCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgc > 2:1300747/1‑148 (MQ=255) tGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgcagc > 2:819849/1‑148 (MQ=255) gggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGcagcag < 2:632232/148‑1 (MQ=255) gggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGcagcag < 2:635231/148‑1 (MQ=255) gggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGcagcag > 2:3487696/1‑148 (MQ=255) gTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGat < 1:318397/148‑1 (MQ=255) tCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGata > 1:2056296/1‑148 (MQ=255) tCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGata > 2:2234311/1‑148 (MQ=255) tCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGata > 1:2388714/1‑148 (MQ=255) aTGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTCTGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATg > 2:3264124/1‑148 (MQ=255) aTGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATg > 2:2520288/1‑148 (MQ=255) tGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGt > 2:1209685/1‑148 (MQ=255) tGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGt < 1:2625215/148‑1 (MQ=255) gCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGtt > 1:2488816/1‑148 (MQ=255) cGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAACCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGTCATTAAGCATACAGCCTGGGCGTCGATTTATTCGATATGGTGGTCTATGTTGTACTGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGTTATGTTCAGc < 1:3052268/148‑1 (MQ=255) gggCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCa < 1:2524364/148‑1 (MQ=255) agagTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGGGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGacac > 2:899540/1‑148 (MQ=255) gagTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGAcaca > 1:2652954/1‑148 (MQ=255) agTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACaa < 2:382571/148‑1 (MQ=255) agTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTACCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACaa < 2:1487537/148‑1 (MQ=255) agTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTGAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACaa < 1:431469/148‑1 (MQ=255) gattgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCttt < 2:2277070/148‑1 (MQ=255) tgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAt > 1:2588412/1‑148 (MQ=255) gaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAtc > 2:895626/1‑148 (MQ=255) aTCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTcc > 2:2684989/1‑148 (MQ=255) tCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTccc > 2:1150430/1‑148 (MQ=255) tCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTccc > 1:1799590/1‑148 (MQ=255) tCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTccc > 2:1723357/1‑148 (MQ=255) tCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTccc > 2:1150319/1‑148 (MQ=255) cAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGtt > 1:1110669/1‑148 (MQ=255) aaaCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTg > 1:1617739/1‑148 (MQ=255) aaCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGa < 1:52177/148‑1 (MQ=255) gTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCtt > 1:3450750/1‑148 (MQ=255) ttAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTc > 2:2484859/1‑148 (MQ=255) ttAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTc > 2:34960/1‑148 (MQ=255) ttAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTc < 1:836921/148‑1 (MQ=255) tAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCa > 2:1895252/1‑148 (MQ=255) tAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCa > 2:2593169/1‑148 (MQ=255) aGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCAt < 1:916005/148‑1 (MQ=255) gCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACATCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATa < 2:1095011/148‑1 (MQ=255) cTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATaa < 2:1948104/148‑1 (MQ=255) aaTTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATgg > 2:111597/1‑148 (MQ=255) aaTTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATgg < 1:1535623/148‑1 (MQ=255) tttGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGcc > 1:484134/1‑148 (MQ=255) ttGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCa > 2:3378526/1‑148 (MQ=255) ttGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCa > 2:1610625/1‑148 (MQ=255) ttGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCa > 1:779304/1‑148 (MQ=255) tGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCAt < 2:3341286/148‑1 (MQ=255) gggCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGa < 1:2613195/148‑1 (MQ=255) cTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGacca < 1:1358840/148‑1 (MQ=255) aCATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATg > 1:3329367/1‑148 (MQ=255) aTAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGAc > 2:1265313/1‑148 (MQ=255) aTAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGAc < 2:1516242/148‑1 (MQ=255) aaaGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACAt > 1:1202982/1‑148 (MQ=255) aaaGCATACATCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACAt < 2:975199/148‑1 (MQ=255) cATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAg > 1:2153036/1‑148 (MQ=255) cATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAg > 1:2119281/1‑148 (MQ=255) tACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCa > 1:2765328/1‑148 (MQ=255) tACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCa < 2:1759395/148‑1 (MQ=255) | CCCGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCA > CP009273/2736568‑2736858 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |