| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,936,686 | 0 | G | T | 5.2% | 724.6 / 11.8 | 190 | intergenic (‑182/‑10) | ygdI/csdA | DUF903 family verified lipoprotein/cysteine sulfinate desulfinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (85/95); new base T (7/3); total (92/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
AGTATTGATTAACAGGCTAAAATTAACGCCTAACACTATTCAGCATATGTTACTTACGCGGCTTCGCCAGGATATCCAGATAATTCTGATGGTTAGCACTCTCCTTGTATCAAAGTGAATTTTGCGTCACGATCGGTGCATCAAGCCGAGGAGTACCATGAACGTTTTTAATCCCGCGCAGTTTCGCGCCCAGTTTCCCGCACTACAGGATGCGGGCGTCTATCTCGACAGCGCCGCGACCGCGCTTAAACCTGAAGCCGTGGTTGAAGCCACCCAACAGTTTTACAGTCTGAG > CP009273/2936539‑2936832 | aGTATTGATTAACAGGCTAAAATTAACGCCTAACACTATTCAGCATATGTTACTTACGCGGCTTCGCCAGGATATCCAGATAATTCTGATGGTTAGCACTCTCCTTGTATCAAAGTGAATTTTGCGTCACGATCGGTGCATCAAGCCg < 2:2344579/148‑1 (MQ=255) gTATTGATTAACAGGCTAAAATTAACGCCTAACACTATTCAGCATATGTTACTTACGCGGCTTCGCCAGGATATCCAGATAATTCTGATGGTTAGCACTCTCCTTGTATCAAAGTGAATTTTGCGTCACGATCGGTGCATCAAGCCga < 2:2672721/148‑1 (MQ=255) gTATTGATTAACAGGCTAAAATTAACGCCTAACACTATTCAGCATATGTTACTTACGCGGCTTCGCCAGGATATCCAGATAATTCTGATGGTTAGCACTCTCCTTGTATCAAAGTGAATTTTGCGTCACGATCGGTGCATCAAGCCga < 2:3178318/148‑1 (MQ=255) gTATTGATTAACAGGCTAAAATTAACGCCTAACACTATTCAGCATATGTTACTTACGCGGCTTCGCCAGGATATCCAGATAATTCTGATGGTTAGCACTCTCCTTGTATCAAAGTGAATTTTGCGTCACGATCGGTGCATCAAGCCga 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cGAGGAGTACCATGAACGTTTTTAATCCCGCGCAGTTTCGCGCCCAGTTTCCCGCACTACAGGATGCGGGCGTCTATCTCGACAGCGCCGCGACCGCGCTTAAACCTGAAGCCGTGGTTGAAGCCACCCAACAGTTTTACAGTCTGAg < 2:1663157/148‑1 (MQ=255) | AGTATTGATTAACAGGCTAAAATTAACGCCTAACACTATTCAGCATATGTTACTTACGCGGCTTCGCCAGGATATCCAGATAATTCTGATGGTTAGCACTCTCCTTGTATCAAAGTGAATTTTGCGTCACGATCGGTGCATCAAGCCGAGGAGTACCATGAACGTTTTTAATCCCGCGCAGTTTCGCGCCCAGTTTCCCGCACTACAGGATGCGGGCGTCTATCTCGACAGCGCCGCGACCGCGCTTAAACCTGAAGCCGTGGTTGAAGCCACCCAACAGTTTTACAGTCTGAG > CP009273/2936539‑2936832 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |