| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,243,768 | C→T | 100% | intergenic (+33/‑153) | yqjK → / → yqjF | uncharacterized protein/putative quinol oxidase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,243,768 | 0 | C | T | 98.4% | 596.7 / 0.2 | 190 | intergenic (+33/‑153) | yqjK/yqjF | uncharacterized protein/putative quinol oxidase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/3); new base T (87/99); total (87/103) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.40e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
CTGGACGATTCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATCCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACAATCAGCAGCCTGAGTGGCGCAGTGG > CP009273/3243621‑3243912 | ggACGATTCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATtcc > 1:818988/1‑148 (MQ=255) gACGATTCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCt < 1:574241/148‑1 (MQ=255) aCGATTCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTc > 1:2183792/1‑148 (MQ=255) aCGATTCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTc > 2:2054314/1‑148 (MQ=255) ttCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGGGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTGTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATCCCTCAAAt < 1:2437173/148‑1 (MQ=255) ttCGCAATACTAATAGGGTGGTCCGCTGGGCCAGACGGGTTTTTGGCGTTTGGAGCGCCTGGCGTGTGTTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATCCCTCAAAt < 1:648962/148‑1 (MQ=255) tCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAAtt > 2:1129667/1‑148 (MQ=255) gCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAAtttt < 2:1511026/148‑1 (MQ=255) ccATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAAttttt > 2:1925971/1‑148 (MQ=255) aTCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTg > 1:2554416/1‑148 (MQ=255) tCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGa > 2:3340864/1‑148 (MQ=255) tCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGa > 2:3340108/1‑148 (MQ=255) cTAATATGCTGGCCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAg < 1:1231623/148‑1 (MQ=255) aaTATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGAt < 1:350775/148‑1 (MQ=255) atatGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGAtt < 1:328790/148‑1 (MQ=255) tatGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGAttt > 1:424822/1‑148 (MQ=255) tatGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGAt < 2:1403878/146‑1 (MQ=255) gctgggccgctgggccAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCGGGCGTCGGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTg < 2:2196719/148‑1 (MQ=255) gCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTg < 2:1263930/148‑1 (MQ=255) gCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACGTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTg < 2:635344/148‑1 (MQ=255) ccGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGtt > 1:2781687/1‑148 (MQ=255) gCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGtttt < 1:2221753/148‑1 (MQ=255) cTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTc < 2:2035833/148‑1 (MQ=255) tGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTcc < 2:1718740/148‑1 (MQ=255) ggggCCAGACGGGGTTTTGGCGTTTGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTcc < 1:734794/147‑1 (MQ=255) gggCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCt < 1:2625343/148‑1 (MQ=255) gggCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCt > 1:452502/1‑148 (MQ=255) gggCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCt > 1:451449/1‑148 (MQ=255) ggCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAACACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCtt < 2:2270436/148‑1 (MQ=255) ggCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCtt < 2:2428048/148‑1 (MQ=255) ggCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCtt > 2:1749261/1‑148 (MQ=255) gCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTg < 2:2197938/148‑1 (MQ=255) aGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTa < 1:1946974/148‑1 (MQ=255) gACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTaa > 2:191047/1‑148 (MQ=255) aCGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAAc > 2:2642267/1‑148 (MQ=255) cgcgGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACa < 2:2365048/148‑1 (MQ=255) cgcgGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACa < 2:1853297/148‑1 (MQ=255) gcgGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACaa < 2:1165864/148‑1 (MQ=255) gcgGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACaa < 2:1139573/148‑1 (MQ=255) cgGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAat > 1:135334/1‑148 (MQ=255) ggTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAatc < 1:263163/148‑1 (MQ=255) ggTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAatc < 1:1198435/148‑1 (MQ=255) ggTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAatc < 1:517847/148‑1 (MQ=255) tttttGGCTTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAatca < 1:407994/147‑1 (MQ=255) gTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAatca > 2:1938208/1‑148 (MQ=255) ttttGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAatcat > 1:1630796/1‑148 (MQ=255) tttGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAatcatc > 2:338987/1‑148 (MQ=255) ggCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCAtt < 2:1746198/148‑1 (MQ=255) gCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTc > 1:1134305/1‑148 (MQ=255) gcgcCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGttt < 1:86479/148‑1 (MQ=255) gcgcCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGttt < 1:2901879/148‑1 (MQ=255) ccTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATg < 2:1331269/148‑1 (MQ=255) tCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATtctct < 1:1505140/148‑1 (MQ=255) cTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATtctctc < 2:9545/148‑1 (MQ=255) gTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCAt < 1:1064323/148‑1 (MQ=255) gTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCAt > 1:171598/1‑148 (MQ=255) gTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCAt > 1:172079/1‑148 (MQ=255) gACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCa < 1:1012034/148‑1 (MQ=255) gACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCa < 2:1558324/148‑1 (MQ=255) ccTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAacg < 1:848753/148‑1 (MQ=255) cTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAacga > 1:2485384/1‑148 (MQ=255) gcagcaACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTa < 2:2554416/148‑1 (MQ=255) gcagcaACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTa > 1:3258510/1‑148 (MQ=255) cagcaACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTGTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTaa < 2:1536879/148‑1 (MQ=255) 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tATTCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACAATCAGCAGCCTGAGTGGCGCAGTgg > 1:2778101/1‑148 (MQ=255) | CTGGACGATTCGCCATCCTAATATGCTGGTCCGCTGGGCCAGACGCGGTTTTGGCGTATGGAGCGCCTGGCGTCTGGTTAAAACGACCCTCAAGCAGCAACAGCTTCGCGGTTAACTTCCCTCTGGCCGGAGCCATTCCGGCCTTATCCCTCAAATTTTTTGAAGATTTTTGACAGTTTTCCTTGCTAACAATCATCATTCACCACGTTTATGATTCTCTCCATCGACAGCAACGACGCTAATACCGCGCCATTGCACAAAAAAACAATCAGCAGCCTGAGTGGCGCAGTGG > CP009273/3243621‑3243912 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |