Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,347,778 | G→A | 100% | intergenic (‑369/‑306) | yhcC ← / → gltB | putative Fe‑S oxidoreductase, Radical SAM superfamily protein/glutamate synthase, large subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,347,778 | 0 | G | A | 100.0% | 707.9 / ‑6.7 | 217 | intergenic (‑369/‑306) | yhcC/gltB | putative Fe‑S oxidoreductase, Radical SAM superfamily protein/glutamate synthase, large subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (112/104); minor base T (1/0); total (113/104) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
TACCAATTAAGGCAGTATAAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATT > CP009273/3347633‑3347922 | tACCAATTAAGGCAGTATAAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATc < 2:2073052/148‑1 (MQ=255) aCCAATTAAGGCAGTATAAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCa < 2:1653516/148‑1 (MQ=255) cAATTAAGGCAGTATAAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCAtt > 1:663391/1‑148 (MQ=255) aTTAAGGCAGTATAAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTta < 2:1186685/148‑1 (MQ=255) ttAAGGCAGTATAAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTtaa > 1:2270984/1‑148 (MQ=255) tAAGGCAGTATAAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTtatt > 2:2221033/1‑146 (MQ=255) ggCAGTATAAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATaaa < 2:3193879/148‑1 (MQ=255) gCAGTATAAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAg > 1:2697700/1‑148 (MQ=255) cAGTATAAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGa < 2:345904/148‑1 (MQ=255) cAGTATAAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGa > 2:13970/1‑148 (MQ=255) cAGTATAAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAAACCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGa > 2:1793900/1‑148 (MQ=255) ataAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAAttt < 2:1725266/148‑1 (MQ=255) aaTGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTgcg > 1:1659740/1‑148 (MQ=255) aTGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTgcgc > 2:2489100/1‑148 (MQ=255) tGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCt > 2:291628/1‑148 (MQ=255) tGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCt > 2:1581509/1‑148 (MQ=255) ttttGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACGTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGca < 2:2543559/148‑1 (MQ=255) ttGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGcaca < 1:436537/148‑1 (MQ=255) ttGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGcaca < 2:1307077/148‑1 (MQ=255) tGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACAt < 1:2998242/148‑1 (MQ=255) tGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACAt < 1:146613/148‑1 (MQ=255) gtcgtcAGTTCAAGGCAGGATAAGGTTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACAtt < 2:1549600/148‑1 (MQ=255) gtcgtcAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACAtt < 2:1151134/148‑1 (MQ=255) tcgtcAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACAttt < 1:1072279/148‑1 (MQ=255) cgtcAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTc < 1:672101/148‑1 (MQ=255) tcAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTg < 2:748244/148‑1 (MQ=255) cAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGt > 1:1211849/1‑148 (MQ=255) ttCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTAcc > 2:1407426/1‑148 (MQ=255) tCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCa > 2:898090/1‑148 (MQ=255) aGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATa > 1:629427/1‑148 (MQ=255) aGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGAACATTTCTGTACCAATa > 1:1902112/1‑148 (MQ=255) ggCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACAGTTCTGTACCAATaa > 2:637570/1‑148 (MQ=255) gATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTg > 1:101277/1‑148 (MQ=255) aTAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGc > 1:2490966/1‑148 (MQ=255) tAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGcc > 1:174106/1‑148 (MQ=255) aaGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCa < 1:2040184/148‑1 (MQ=255) aGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCAt < 1:507508/148‑1 (MQ=255) aaCACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGAcc < 1:1039567/148‑1 (MQ=255) acacacCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCt > 2:1754148/1‑148 (MQ=255) cacacCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTg > 2:528473/1‑148 (MQ=255) acCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTAt > 1:3106994/1‑148 (MQ=255) tttATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAg > 1:873081/1‑148 (MQ=255) tttATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAg > 2:94428/1‑148 (MQ=255) tGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCttt < 2:2972294/148‑1 (MQ=255) gACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTc < 1:3409246/148‑1 (MQ=255) gACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTc < 2:2270984/148‑1 (MQ=255) aCAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATGTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTcc > 2:2286227/1‑148 (MQ=255) cAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAATAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGAGCTGTATCAGCTTTccc > 1:1561172/1‑148 (MQ=255) aGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCg > 2:1362799/1‑148 (MQ=255) cAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATa > 1:966823/1‑148 (MQ=255) aGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATaa < 1:1847265/148‑1 (MQ=255) gAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGt > 2:351883/1‑148 (MQ=255) gAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGt < 2:2339544/148‑1 (MQ=255) gAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGt < 1:3215467/148‑1 (MQ=255) ttGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTgg < 2:663391/148‑1 (MQ=255) aCTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGaaa < 1:3438596/148‑1 (MQ=255) tGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATc > 2:858632/1‑148 (MQ=255) gTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATcc > 1:3175446/1‑148 (MQ=255) gTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATcc < 1:2457813/148‑1 (MQ=255) ttCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGc < 2:449673/148‑1 (MQ=255) ctctAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTg > 2:2845104/1‑148 (MQ=255) ctAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCAGCTGGa < 2:1434793/148‑1 (MQ=255) ctAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCAGTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGa > 1:3028032/1‑148 (MQ=255) aaCGACTTCCCATTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATATCAATCATATAATAAAGAATTTTGCGCTAAATAACATTTATTTACCAATAATCTTGCCAATTGAACTGTATCAGCTATCCCTATAAGTTGGAAATACGcagttag > 2:1902135/1‑142 (MQ=255) aCGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGc < 1:1373389/148‑1 (MQ=255) gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCtt > 1:528194/1‑148 (MQ=255) gACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCtt < 2:423844/148‑1 (MQ=255) cTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTc > 1:3557770/1‑148 (MQ=255) cTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTc > 1:644679/1‑148 (MQ=255) cccTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTgg < 2:2419419/148‑1 (MQ=255) tttAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGa < 1:1931109/148‑1 (MQ=255) tAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATGTTGCGCGAAAGCACATTTCTGTACCAATACGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGagc < 2:2697700/148‑1 (MQ=255) ccTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGagcagc < 1:11013/148‑1 (MQ=255) ccTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGagcagc < 1:10656/148‑1 (MQ=255) aaaGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGc > 1:521890/1‑148 (MQ=255) aaaGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGc > 1:2763215/1‑148 (MQ=255) aGATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGATGGAAGCTTTCTTGATGTGAAGCATGCtc > 1:2875712/1‑148 (MQ=255) gATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCtca > 2:3064161/1‑148 (MQ=255) gATAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCtca > 1:2378826/1‑148 (MQ=255) aTAAAATCCATTATAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTAGCGCTAAAGCACCGATCTGTACCAAAAAGATAGCCATATGACCGGAATCAGCTTACCCGATCAGATGGAAATCCGCAGGCAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCtcat > 2:2130278/1‑148 (MQ=255) tAAAATCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCtcatc > 1:10242/1‑148 (MQ=255) aaaaTCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCtcatca > 2:254723/1‑148 (MQ=255) tCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATAtt > 2:2314131/1‑148 (MQ=255) tCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATAtt > 1:3250464/1‑148 (MQ=255) tCCATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATAtt > 2:521986/1‑148 (MQ=255) cATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTa > 2:1103347/1‑148 (MQ=255) cATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTa < 1:2180708/148‑1 (MQ=255) cATTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTa < 1:3452752/148‑1 (MQ=255) aTTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTAt > 1:1649947/1‑148 (MQ=255) aTTTTAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTAt < 1:898090/148‑1 (MQ=255) tttAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGc < 2:801947/148‑1 (MQ=255) tAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAg > 1:311691/1‑148 (MQ=255) tAATTTCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAg > 2:3505240/1‑148 (MQ=255) agttCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTa > 1:2061254/3‑148 (MQ=255) tttCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTaa < 2:12987/148‑1 (MQ=255) tttCAATCATTTAATAAAGAATTGTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTaa < 2:13149/148‑1 (MQ=255) ttCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAAt < 1:291628/148‑1 (MQ=255) ttCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAAt > 1:2488165/1‑148 (MQ=255) ttCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAAt > 1:1347569/1‑148 (MQ=255) tCAATCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTGTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAAtt > 1:2399984/1‑148 (MQ=255) | TACCAATTAAGGCAGTATAAAATGCTGGTTTTGTCGTCAGTTCAAGGCAGGATAAGGGTTAACACACCTTTATGACAGTCAGGAATTGACTGTTTCTCTAACGACTTCCCTTTTAGCCTTAAAGATAAAATCCATTTTAATTTCAGTCATTTAATAAAGAATTTTGCGCTAAAGCACATTTCTGTACCAATAAGCTTGCCATTTGACCTGTATCAGCTTTCCCGATAAGTTGGAAATCCGCTGGAAGCTTTCTGGATGAGCAGCCTGCTCATCATATTTATGCAGTAATT > CP009273/3347633‑3347922 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |