| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,519,657 | G→T | 100% | intergenic (‑149/‑171) | nudE ← / → yrfF | adenosine nucleotide hydrolase; substrates include Ap3A, Ap2A, ADP‑ribose, NADH/inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,519,657 | 0 | G | T | 100.0% | 688.6 / NA | 212 | intergenic (‑149/‑171) | nudE/yrfF | adenosine nucleotide hydrolase; substrates include Ap3A, Ap2A, ADP‑ribose, NADH/inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (102/110); total (102/110) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
GGGATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCT > CP009273/3519512‑3519801 | gggATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGa > 2:210543/1‑148 (MQ=255) ggATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGaa < 2:183074/148‑1 (MQ=255) gATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAAt < 2:3215819/148‑1 (MQ=255) aTCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAAtt > 1:249425/1‑148 (MQ=255) cTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTg < 2:3335962/148‑1 (MQ=255) tGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTg > 1:3234860/1‑148 (MQ=255) gCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTTAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGa < 2:2102647/148‑1 (MQ=255) cTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGat < 1:192518/148‑1 (MQ=255) gtgAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTCAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGatat > 2:696565/1‑148 (MQ=255) tgAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATAtt > 2:1582635/1‑148 (MQ=255) aaaTCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTcc < 2:280313/148‑1 (MQ=255) aaTCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCg < 2:973960/148‑1 (MQ=255) aaTCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCg < 2:1114860/148‑1 (MQ=255) aTCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGc < 2:932826/148‑1 (MQ=255) aTCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGc < 1:2432717/148‑1 (MQ=255) aTCAGCGGTTATTGTGAGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATTTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGc < 1:1534659/148‑1 (MQ=255) tCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGcc < 2:3355265/148‑1 (MQ=255) tCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGcc < 1:694937/148‑1 (MQ=255) cAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCt < 2:103948/148‑1 (MQ=255) ttATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCagag > 2:2079357/1‑148 (MQ=255) ttATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCagag > 1:1040061/1‑148 (MQ=255) tATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAgg < 2:1815432/148‑1 (MQ=255) ttGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGt < 2:3234860/148‑1 (MQ=255) gtgCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGttt < 1:2256231/148‑1 (MQ=255) tgCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTg < 2:777196/148‑1 (MQ=255) cGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCt < 2:826092/148‑1 (MQ=255) gATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTa < 2:658393/148‑1 (MQ=255) atatCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTAt > 1:2166603/1‑148 (MQ=255) atatCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTAt > 1:371565/1‑148 (MQ=255) tatCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATg < 1:2570240/148‑1 (MQ=255) atCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGa < 2:1193208/148‑1 (MQ=255) tCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGAt < 1:2396418/148‑1 (MQ=255) tCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGAt < 2:2625390/148‑1 (MQ=255) ggACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCa < 2:16133/148‑1 (MQ=255) acacGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGc > 2:3387346/1‑148 (MQ=255) gCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGtt < 2:196427/148‑1 (MQ=255) cTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTa < 2:296937/148‑1 (MQ=255) cTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTa < 2:3170188/148‑1 (MQ=255) ttCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACt < 2:2885298/148‑1 (MQ=255) ttCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACt < 2:14816/148‑1 (MQ=255) ttCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACt > 1:965900/1‑148 (MQ=255) tCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACtg < 1:1094056/148‑1 (MQ=255) cAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAt > 1:1910112/1‑148 (MQ=255) cAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAt < 1:2928259/148‑1 (MQ=255) cAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAt < 2:1804423/148‑1 (MQ=255) aaTGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGAtg < 1:1012310/148‑1 (MQ=255) aTGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAtgt > 2:2725997/1‑148 (MQ=255) aTGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAtgt > 2:2923810/1‑148 (MQ=255) aTGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAtgt > 2:518713/1‑148 (MQ=255) gtgAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGc > 2:1673048/1‑148 (MQ=255) gtgAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGc > 2:1654841/1‑148 (MQ=255) tgAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCt > 2:1324995/1‑148 (MQ=255) tgAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCt < 1:221883/148‑1 (MQ=255) aaTTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTa > 1:694887/1‑148 (MQ=255) aaTTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTa < 1:1980555/148‑1 (MQ=255) aaTTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTa > 1:1284445/1‑148 (MQ=255) aTTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTaa < 2:2779330/148‑1 (MQ=255) aTTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTaa < 2:2437349/148‑1 (MQ=255) tGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAatg < 1:465814/148‑1 (MQ=255) tGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAatg > 1:3216561/1‑148 (MQ=255) gCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAatga < 2:1848393/148‑1 (MQ=255) gCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAatga < 1:335365/148‑1 (MQ=255) cATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGCTGTGCTTAatgat > 2:1831937/1‑148 (MQ=255) cATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAatgat > 2:3292431/1‑148 (MQ=255) aTGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAatgatg < 1:850394/148‑1 (MQ=255) tATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCa > 2:225113/1‑148 (MQ=255) aTTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACGGTGATGTGCTTAATGATGCTCaa < 2:567627/148‑1 (MQ=255) aCATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTa > 1:527369/1‑148 (MQ=255) aCATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTa > 1:2318991/1‑148 (MQ=255) aTGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAATTCAATAGTTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGAGGTTACTGTTATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACtac > 1:2413623/1‑146 (MQ=255) taaataaTCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGa < 1:3131693/148‑1 (MQ=255) aaataaTCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATATTTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATAAGCGGTTACTGTGATGTGATTAATGATGCTAAAGTTAAACTACACGCTAGACGAt > 1:993515/1‑148 (MQ=255) ataatCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAg > 2:2353333/1‑148 (MQ=255) aatCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGcc > 1:468583/1‑148 (MQ=255) tCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCaa > 2:1399823/1‑148 (MQ=255) caaatcaaatAAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAATTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGa > 2:1785508/1‑148 (MQ=255) aatcaaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAAt > 1:721178/1‑148 (MQ=255) atcaaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATc > 2:1046910/1‑148 (MQ=255) caaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCAt < 1:1582635/148‑1 (MQ=255) aatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGt > 2:1564248/1‑148 (MQ=255) aatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGt > 2:1345044/1‑148 (MQ=255) aatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGt < 1:1324995/148‑1 (MQ=255) atTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTa > 2:2664299/1‑148 (MQ=255) atTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTa > 1:3379476/1‑148 (MQ=255) ttAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTAt < 1:6022/148‑1 (MQ=255) tAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGACTCATGTAtt > 1:3185489/1‑148 (MQ=255) tAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTAtt > 1:1780200/1‑148 (MQ=255) tAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTAtt < 2:476357/148‑1 (MQ=255) tAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTAtt > 1:1412976/1‑148 (MQ=255) aaaGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATtgt > 2:1091949/1‑148 (MQ=255) aGTCAAGAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTgtgt < 1:2265005/148‑1 (MQ=255) gTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTc > 1:2979390/1‑148 (MQ=255) cAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCg > 2:1302362/1‑148 (MQ=255) taTAGGTTGAATTAACTCGTTGATTTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTACACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCgg < 1:2386942/147‑1 (MQ=255) aGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGc > 2:546858/1‑148 (MQ=255) ggTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCg > 2:1842176/1‑148 (MQ=255) aTAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGAcc < 2:2379700/148‑1 (MQ=255) tAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCa > 1:283707/1‑148 (MQ=255) tAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCa > 1:223553/1‑148 (MQ=255) cTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGc < 1:210543/148‑1 (MQ=255) | GGGATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGCCT > CP009273/3519512‑3519801 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |