| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,513,440 | T→A | 7.3% | Y53N (TAT→AAT) | curA → | curcumin/dihydrocurcumin reductase, NADPH‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,513,440 | 0 | T | A | 7.3% | 1010.2 / 54.7 | 275 | Y53N (TAT→AAT) | curA | curcumin/dihydrocurcumin reductase, NADPH‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (131/124); new base A (6/14); total (137/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.48e-01 | |||||||||||
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
AACAAAAGCAGCGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATGCGTGGACGTATGAGCGATGAGCCATCTTATTCACCGCCTGTTGATATTGGCGGCGTGATGGTCGGCGGTACGGTGAGCCGTGTCGTGGAGTCGAATCATCCTGATTATCAGTCTGGCGACTGGGTGCTGGGCTACAGTGGATGG > CP009273/1513291‑1513589 | aacaaAAGCAGCGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGt < 1:4391410/150‑1 (MQ=255)aacaaAAGCAGCGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTGTATGTGTCCCTGGACCCGt > 1:2885799/1‑150 (MQ=255) accacagcagcGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGta < 2:2821215/145‑1 (MQ=255) acaaAAGCAGCGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGta < 2:511994/150‑1 (MQ=255) acaaAAGCAGCGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGta < 2:1356336/150‑1 (MQ=255) acagcagcGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTatat < 1:935465/148‑1 (MQ=255) aaaGCAGCGTAATCGACGTGGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTatat > 2:1811214/1‑150 (MQ=255) aaGCAGCGTAATCGACGTTGGGTTCTGGCCTCGCGTCCACATGGCGCACCTGTTCCGGAGAATTTCCGTCTTGAAGAAGATGATGTCGCCACACCGGGTGAAGGACAGGTGTTACTGCGCACAGTTTATTTGTCCCTGGACCCGTATATg > 2:4581094/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |