Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,884,059 | G→A | 5.3% | intergenic (‑56/+149) | fadD ← / ← yeaY | acyl‑CoA synthetase (long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase)/Slp family lipoprotein, RpoE‑regulated |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,884,059 | 0 | G | A | 5.3% | 1359.8 / 41.1 | 378 | intergenic (‑56/+149) | fadD/yeaY | acyl‑CoA synthetase (long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase)/Slp family lipoprotein, RpoE‑regulated |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (166/192); new base A (7/13); total (173/205) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.64e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 |
Only 100 of 380 total aligned reads displayed.
ACTGCTCAAACATATCTACCAGAGATTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTAAAAACAAGCAAT > CP009273/1883910‑1884208 | tGCTCAAACATATCTACCCGAGATTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGCTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACCTGcc < 2:3240729/150‑1 (MQ=255) tGCTCAAACATATCTACCAGAGATTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTAAATTCTTCACCTATAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCTACCCCAAATGATTTACATGcc < 2:3439549/150‑1 (MQ=255) tCAAACATATCTACCAGAGATTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGtt < 2:3593023/150‑1 (MQ=255) tCAAACATATCTACCAGAGATTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGtt > 2:1904200/1‑150 (MQ=255) cATATCTACCAGAGATTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACat < 1:1415519/150‑1 (MQ=255) tatCTACCAGAGATTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACataa < 2:1195352/150‑1 (MQ=255) cgaCCAGAGATTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAatat < 2:4236086/148‑1 (MQ=255) tACCAGAGATTGATACCGGTCCTGGTTGATCTCCGTCGGAACTTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAAACTTCTTCATTTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATAtt < 2:2931972/150‑1 (MQ=255) tACCAGAGATTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATAtt < 2:2775729/150‑1 (MQ=255) tACCAGAGATTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATAtt < 1:3079851/150‑1 (MQ=255) tACCAGAGATTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCAAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATAtt < 2:1798626/150‑1 (MQ=255) ccAGAGATTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTaa > 2:2153274/1‑150 (MQ=255) cAGAGATTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAAc > 1:3212600/1‑150 (MQ=255) agagATTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATACCGTTAACATAATATTAACt < 2:1757899/150‑1 (MQ=255) gagaTTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACtc < 2:3133037/150‑1 (MQ=255) agaTTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTTACtca > 2:3663790/1‑150 (MQ=255) agaTTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACtca > 2:923438/1‑150 (MQ=255) gaTTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATACCGTTAACATAATATTAACtcat < 1:1597400/150‑1 (MQ=255) aTTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATACCGTTAACATAATATTAACtcatc > 1:2088932/1‑150 (MQ=255) tGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTcatcat > 2:4384680/1‑150 (MQ=255) aTAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATAc < 1:1855332/150‑1 (MQ=255) aaCGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATACCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCa < 2:5063306/150‑1 (MQ=255) ggTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCt < 1:849602/150‑1 (MQ=255) gTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCtt < 2:3919109/150‑1 (MQ=255) gTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCtt < 1:3760793/150‑1 (MQ=255) cAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGa < 1:2120583/150‑1 (MQ=255) aGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGAt > 2:149581/1‑150 (MQ=255) aGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGAt < 2:1978083/150‑1 (MQ=255) aGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGAt > 1:2718047/1‑150 (MQ=255) gggTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATa < 2:4530500/150‑1 (MQ=255) ggTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATaa < 1:15694/150‑1 (MQ=255) gATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTAc > 1:706158/1‑150 (MQ=255) cGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACg < 1:4820668/150‑1 (MQ=255) ggAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGaaaa > 2:460118/1‑150 (MQ=255) ggAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATACCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGaaat > 2:4377776/1‑149 (MQ=255) aCGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGt < 1:1315606/150‑1 (MQ=255) aCGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGt < 2:600097/150‑1 (MQ=255) aCGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGt < 1:340096/150‑1 (MQ=255) aTAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGcgcg > 1:355519/1‑150 (MQ=255) tAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCACCGAACAGGTTGCGAAGCGCGt > 1:3331677/1‑150 (MQ=255) cGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCAc > 1:959097/1‑150 (MQ=255) cGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATACCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCAc > 1:2310811/1‑150 (MQ=255) tAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACtatt < 1:1905701/150‑1 (MQ=255) cAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTatttattt < 2:3248695/150‑1 (MQ=255) aaaCCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTAtttt > 2:2238681/1‑150 (MQ=255) aaaCCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTAtttt < 2:1071898/150‑1 (MQ=255) aaaCCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTAtttt > 1:4082973/1‑150 (MQ=255) aaaCCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGAGAAGCGCGTCACtatttagatt > 2:3370122/1‑146 (MQ=255) aaaCCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAAATACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTAtttt > 2:960203/1‑150 (MQ=255) aaCCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTAttttt < 1:2378934/150‑1 (MQ=255) aCCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTa < 2:3959447/150‑1 (MQ=255) cttcttCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATc > 1:4549599/1‑150 (MQ=255) ttcttcAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCt < 1:587958/150‑1 (MQ=255) ttcttcAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCt < 2:5019287/150‑1 (MQ=255) tcAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTAc < 1:2175218/150‑1 (MQ=255) aTTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGt > 2:2642148/1‑150 (MQ=255) ttcttcACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTa < 1:1929144/150‑1 (MQ=255) cttcACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAg > 1:1683553/1‑150 (MQ=255) tcACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGaa > 1:5258538/1‑150 (MQ=255) ccTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGc < 1:4384680/150‑1 (MQ=255) ccTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGc < 1:2544630/150‑1 (MQ=255) ccTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGc > 1:243168/1‑150 (MQ=255) cactAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGACGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCa > 2:887550/3‑150 (MQ=255) tAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGaa < 2:536653/150‑1 (MQ=255) aaTGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACa > 2:2467330/1‑150 (MQ=255) aaTGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACa < 1:2598275/150‑1 (MQ=255) aTGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAg > 2:4753279/1‑150 (MQ=255) tGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATACCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGc < 1:7721/150‑1 (MQ=255) tgtTAGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGAc < 2:5220688/150‑1 (MQ=255) gtcgtcATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGcc < 1:2027183/150‑1 (MQ=255) gtcgtcATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGcc > 2:5419343/1‑150 (MQ=255) gtcATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCt < 2:4082973/150‑1 (MQ=255) gtcATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCt < 2:1352316/150‑1 (MQ=255) cATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGt > 1:1017206/1‑150 (MQ=255) aTCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGtt > 1:3132121/1‑150 (MQ=255) aTCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGtt > 1:3901276/1‑150 (MQ=255) aTCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGtt > 1:1181534/1‑150 (MQ=255) aTCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGtt > 2:1822261/1‑150 (MQ=255) aaCCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGtttcttt > 2:3034054/1‑150 (MQ=255) aCCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCATCTTGATAATTACCCAACGAATAGGTTGCGAAGAGCGTCACTATTTATTTTTTTCTTTACCGTAAGTATGCATAAACAGCGGACCAGACGCTGtttctttt > 2:386767/1‑150 (MQ=255) aCCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGtttctttt < 2:4449113/150‑1 (MQ=255) cccAAATGATATACATACCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGtttctttttc < 2:1869551/150‑1 (MQ=255) cAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGtttctttttctt > 1:3618643/1‑150 (MQ=255) cAAATGATATACATACCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGtttctttttctt < 1:3578436/150‑1 (MQ=255) aaTGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTa < 1:5155983/150‑1 (MQ=255) aaTGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTa < 1:218499/150‑1 (MQ=255) tGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTaaa > 2:2704434/1‑150 (MQ=255) gATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTaaaa < 1:4830023/150‑1 (MQ=255) gATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTaaaa > 1:1727259/1‑150 (MQ=255) tataCATACCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAACGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTAAAAAc < 2:753262/150‑1 (MQ=255) ataCATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTAAAAACa > 1:5440189/1‑150 (MQ=255) ataCATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTAAAAACa > 2:4157313/1‑150 (MQ=255) taCATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTAAAAACaa > 1:266949/1‑150 (MQ=255) taCATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTAAAAACaa > 2:1662319/1‑150 (MQ=255) aCATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTAAAAACAAg < 2:2651967/150‑1 (MQ=255) aCATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTAAAAACAAg < 1:1502719/150‑1 (MQ=255) aCATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTAAAAACAAg > 2:1440454/1‑150 (MQ=255) tGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTAAAAACAAGCaa > 1:4130439/1‑150 (MQ=255) tGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTAAAAACAAGCaa < 1:4221843/150‑1 (MQ=255) tGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTAAAAACAAGCaa < 1:2975364/150‑1 (MQ=255) | ACTGCTCAAACATATCTACCAGAGATTGATAACGGTCAGGGTTGATCTCCGTCGGAACGTCCGCGGGATAACGGTTAAGCCAAACCTTCTTCAATTCTTCACCTCTAAAATGCGTGTTCGTCGTCATCGCAACCCCAAATGATATACATGCCGTTAACATAATATTAACTCATCATACCAGCTTGATAATTACCCAACGAAAAGGTTGCGAAGCGCGTCACTATTTATTTTTATCTTTACCGTAAGAATGCAGAAACAGCGGACCAGCCGCTGTTTCTTTTTCTTTAAAAACAAGCAAT > CP009273/1883910‑1884208 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |