Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 108,648 | Δ1 bp | 100% | coding (439/744 nt) | zapD ← | FtsZ stabilizer |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 108,648 | 0 | G | . | 99.4% | 893.4 / ‑1.7 | 166 | coding (439/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base . (75/90); total (75/91) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Polymorphic indel expands or contracts a homopolymer stretch. |
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
CACCGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACG > CP009273/108501‑108787 | ccGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTggg > 2:3180710/1‑148 (MQ=255) ccGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTggg > 1:1418398/1‑148 (MQ=255) ccGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTggg > 2:1435001/1‑148 (MQ=255) cGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTgggt < 1:1014759/148‑2 (MQ=255) ttATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTgggtag > 2:3384081/1‑145 (MQ=255) tATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTgggtaga > 1:302279/1‑144 (MQ=255) tATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTgggtaga > 1:852415/1‑144 (MQ=255) tCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATg > 1:1839730/1‑148 (MQ=255) ccTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGc > 1:2159795/1‑148 (MQ=255) ccTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGc > 1:2749340/1‑148 (MQ=255) aTAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGcc < 1:1124863/148‑1 (MQ=255) tAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCa > 1:1083281/1‑148 (MQ=255) aaaaaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCaa > 2:1140820/1‑148 (MQ=255) aaaaaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCaa < 1:2588963/148‑1 (MQ=255) aaaaaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATAAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCaa < 1:1437201/148‑1 (MQ=255) aaaaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCaaa < 1:3366493/148‑1 (MQ=255) aaaaCCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCaaa < 2:3460281/148‑1 (MQ=255) aTTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCa < 1:432673/148‑1 (MQ=255) ttCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCaa < 1:1115185/148‑1 (MQ=255) tCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAAt > 2:2365383/1‑148 (MQ=255) tCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAAt > 2:2365347/1‑148 (MQ=255) tCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGACTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAAt > 2:1662357/1‑148 (MQ=255) tCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGACTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCAAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGAAAt > 2:514506/1‑148 (MQ=255) cAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATg > 2:1050731/1‑148 (MQ=255) gCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAg < 2:317497/148‑1 (MQ=255) tGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGt < 2:3453916/148‑1 (MQ=255) gtttgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTaa > 2:2631463/1‑148 (MQ=255) gtttgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTaa < 1:1386640/148‑1 (MQ=255) tttgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTaaa < 1:2271832/148‑1 (MQ=255) tgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATc > 2:2746487/1‑148 (MQ=255) tgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATc > 2:1033632/1‑148 (MQ=255) tgtttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATc > 2:2746874/1‑148 (MQ=255) tttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCaa < 2:2979180/148‑1 (MQ=255) ttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCaaa < 1:763624/148‑1 (MQ=255) ttACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCaaa < 1:763674/148‑1 (MQ=255) tACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAg < 2:638360/148‑1 (MQ=255) aCGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGc < 2:1559269/148‑1 (MQ=255) aCGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGc < 2:1559223/148‑1 (MQ=255) aCGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGc < 2:3301947/148‑1 (MQ=255) aaGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCa > 1:381764/1‑148 (MQ=255) gggggCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAAc > 2:1518336/1‑148 (MQ=255) ggggCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACa < 1:2408935/148‑1 (MQ=255) gggCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAg < 1:529020/148‑1 (MQ=255) cGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAgccgc < 1:2941042/148‑1 (MQ=255) 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aaTTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGc > 2:1322882/1‑148 (MQ=255) ttAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTc > 1:478153/1‑148 (MQ=255) tAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCa > 1:421258/1‑148 (MQ=255) tAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGAGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCa > 1:392187/1‑148 (MQ=255) aaaTCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAg < 1:1351680/148‑1 (MQ=255) 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aTGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCAc < 1:1511962/148‑1 (MQ=255) tAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCaga > 2:41304/1‑148 (MQ=255) tAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCaga > 1:1068209/1‑148 (MQ=255) tAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCaga > 2:1976778/1‑148 (MQ=255) gTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCa < 1:3180710/148‑1 (MQ=255) 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cTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGaaa < 1:3155563/148‑1 (MQ=255) ggCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAAtt > 1:2417600/1‑148 (MQ=255) gCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTg < 1:937683/148‑1 (MQ=255) gCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTg > 2:248863/1‑148 (MQ=255) gCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTg > 1:2961066/1‑148 (MQ=255) gCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTg > 1:2470347/1‑148 (MQ=255) cAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGc > 2:846150/1‑148 (MQ=255) cAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGc < 1:280483/148‑1 (MQ=255) tCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCg < 2:852415/148‑1 (MQ=255) aGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATa > 2:2782983/1‑148 (MQ=255) 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ggCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGaa > 1:2928154/1‑148 (MQ=255) gCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGaaa > 2:204688/1‑148 (MQ=255) gCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGaaa < 2:2925208/148‑1 (MQ=255) gCTGTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGaaa < 2:1418398/148‑1 (MQ=255) gTCGCGCTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTa > 2:349184/1‑148 (MQ=255) 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gcTGCGCCT‑GGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACg < 1:367034/148‑1 (MQ=255) | CACCGTTATCCTGATAAAAACCATTCAGGCTGGTTTGTTTACGGAAGGGGGCCGACTGGCGAATTAAATCCAGCACCATGGTAAGTGCCTGGGTGAGCGGGTTCAGGCTGGCAATCCAGGTTTCTACCTGGCTGTCGCGCTGCGCCTGGGGTAGATGCAGCCAAATGTGCAATGTAGGTAAATCAAAGCTGCAACAGCCGCCTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACG > CP009273/108501‑108787 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |