Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,246,619 | Δ1 bp | 100% | coding (350/357 nt) | yhaI → | DUF805 family inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,246,619 | 0 | C | . | 99.5% | 1126.2 / ‑1.7 | 209 | coding (350/357 nt) | yhaI | DUF805 family inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base . (64/144); total (64/145) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
CGTCGCTTACACGATACCGACCGTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATA > CP009273/3246474‑3246761 | cGTCGCTTACACGATACCGACCGTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTaaa < 2:1102577/148‑1 (MQ=255) gTCGCTTACACGATACCGACCGTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTaaat < 1:713771/148‑2 (MQ=255) gCTTACACGATACCGACCGTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTaa < 1:1109722/148‑1 (MQ=255) gCTTACACGATACCGACCGTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTaa < 2:79882/148‑1 (MQ=255) gCTTACACGATACCGACCGTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTaa < 1:1555990/148‑1 (MQ=255) cTTACACGATACCGACCGTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAAt < 2:1702017/148‑1 (MQ=255) cacGATACCGACCGTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTa < 1:1453537/148‑1 (MQ=255) cacGATACCGACCGTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTa < 2:1120348/148‑1 (MQ=255) aTACCGACCGTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAAt > 2:2203518/1‑148 (MQ=255) tACCGACCGTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAAtt > 2:2328566/1‑148 (MQ=255) gaccgaccgTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAAtt < 2:1431720/147‑1 (MQ=255) accgaccgTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTg > 2:2526621/1‑148 (MQ=255) ccgaccgTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTgg > 1:899011/1‑148 (MQ=255) gaccgTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTgggg < 1:58508/148‑1 (MQ=255) ccgTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCg > 2:2166925/1‑148 (MQ=255) gTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGat < 2:1859935/148‑1 (MQ=255) ttCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGata < 1:306130/148‑1 (MQ=255) ttCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGata < 1:302906/148‑1 (MQ=255) tCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACCGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGatat > 2:2460379/1‑148 (MQ=255) cAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATAtt < 2:1308205/148‑1 (MQ=255) aGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATAttt > 1:1027210/1‑148 (MQ=255) gTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCg > 1:3403895/1‑148 (MQ=255) ccTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGccc < 2:523398/148‑1 (MQ=255) ccTGGGCCTTGCTCTTTTTTGGTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGccc < 2:3114338/148‑1 (MQ=255) ggCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCttt > 1:952129/1‑148 (MQ=255) ggCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCttt < 1:1429744/148‑1 (MQ=255) ggCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCttt < 1:2397369/148‑1 (MQ=255) ccTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCttttt < 2:1659804/148‑1 (MQ=255) cTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTtta < 2:798211/148‑1 (MQ=255) ttGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTttat < 2:3366347/148‑1 (MQ=255) tGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTttatt > 1:1953463/1‑148 (MQ=255) tGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTttatt > 1:2362354/1‑148 (MQ=255) tGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTttatt < 2:801392/148‑1 (MQ=255) tGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTttatt < 1:1241330/148‑1 (MQ=255) gCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTttatta < 1:484035/148‑1 (MQ=255) ctctTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTaa < 2:72479/148‑1 (MQ=255) tctTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAAc < 1:2815059/148‑1 (MQ=255) tttttttGGTCAGTTTATTTGCTTTCTATTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAATGTACTTCTGGAAGAAATCGTTAAGGAAAAGATCCTAAGTTTTGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGTGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACa < 2:1789866/147‑1 (MQ=255) ctTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACa < 1:1631488/148‑1 (MQ=255) tttttGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACaat < 2:2980139/148‑1 (MQ=255) gTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAAtaataa < 2:1172572/148‑1 (MQ=255) tCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATaataaat < 1:2290624/148‑1 (MQ=255) tCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATaataaat < 1:41780/148‑1 (MQ=255) cGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAatat > 1:422505/1‑148 (MQ=255) gTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCGTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAAtatt > 1:1973596/1‑148 (MQ=255) gTTTAGTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAAtatt < 2:3492743/148‑1 (MQ=255) ttATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAAtattat < 1:2595954/148‑1 (MQ=255) ttGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTAtttt < 2:2428244/148‑1 (MQ=255) ttGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTAtttt < 1:2151716/148‑1 (MQ=255) ttGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTAtttt < 2:1577159/148‑1 (MQ=255) ggctggctCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTcc < 2:42698/148‑1 (MQ=255) ctggctCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGt < 2:209132/148‑1 (MQ=255) ggctCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTa > 2:875291/1‑148 (MQ=255) ggctCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTa < 1:3229994/148‑1 (MQ=255) ctCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTaaa < 1:3190769/148‑1 (MQ=255) tCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTaaaa < 2:550775/148‑1 (MQ=255) tCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTaaaa < 2:551765/148‑1 (MQ=255) tCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTaaaa < 2:2215327/148‑1 (MQ=255) tCGTGCTTCTGGTTATTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTaaaa < 1:2966565/148‑1 (MQ=255) cGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTaaaaa < 2:837870/148‑1 (MQ=255) gTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAg < 1:2379226/148‑1 (MQ=255) cTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGttt > 2:3044539/1‑148 (MQ=255) cTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGttt > 2:3044718/1‑148 (MQ=255) tCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTgg > 2:2240268/1‑148 (MQ=255) ggTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGaa > 1:2419160/1‑148 (MQ=255) ggTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGaa < 1:2526613/148‑1 (MQ=255) gTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAAt < 2:2011261/148‑1 (MQ=255) gTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAAt < 2:2986793/148‑1 (MQ=255) tttCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTccc < 2:1953463/148‑1 (MQ=255) ttCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCg < 2:2560622/148‑1 (MQ=255) cacaGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGac > 2:817079/1‑148 (MQ=255) caGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGacac < 2:2671932/148‑1 (MQ=255) caGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGacac < 2:2910949/148‑1 (MQ=255) gAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCa > 1:1878108/1‑148 (MQ=255) aGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAgg < 1:81079/148‑1 (MQ=255) tACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGAtt > 1:3501415/1‑148 (MQ=255) aCTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGAttt > 1:1480543/1‑148 (MQ=255) ttCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCg < 2:2356923/148‑1 (MQ=255) ttCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCg > 1:2112259/1‑148 (MQ=255) gcagcaATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTcc > 2:1622916/1‑148 (MQ=255) agcaATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTcccc < 2:1465531/148‑1 (MQ=255) caATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCa > 2:1679495/1‑148 (MQ=255) aaTCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCAt < 2:899011/148‑1 (MQ=255) tCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATAc > 1:769870/1‑148 (MQ=255) tCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATAc > 2:3174476/1‑148 (MQ=255) gTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTg < 1:462356/148‑1 (MQ=255) tACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTc < 2:515574/148‑1 (MQ=255) tACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTc < 1:1272515/148‑1 (MQ=255) ggAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCacg > 1:2337127/1‑148 (MQ=255) gAAACGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCacga < 1:2415925/148‑1 (MQ=255) aaaCGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCacgac > 2:1519299/1‑148 (MQ=255) aCGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGc < 1:1666004/148‑1 (MQ=255) aCGATCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAAATTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGc > 1:2780061/1‑148 (MQ=255) aTCCGAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAg < 2:671410/148‑1 (MQ=255) gAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCa > 2:2881992/1‑148 (MQ=255) gAAGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCa < 1:54351/148‑1 (MQ=255) aaGTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCat > 2:3104937/1‑148 (MQ=255) gTTTGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCataa > 2:133210/1‑148 (MQ=255) tttGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTATTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCaaaat > 2:2675363/1‑148 (MQ=255) ttGGTT‑AAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCataata > 1:3343150/1‑148 (MQ=255) | CGTCGCTTACACGATACCGACCGTTCAGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATA > CP009273/3246474‑3246761 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |