| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,587,029:1 | +G | 100% | coding (101/699 nt) | ypfH ← | palmitoyl‑CoA esterase activity, uncertain physiological substrate |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,587,029 | 1 | . | G | 99.0% | 860.5 / 0.6 | 210 | coding (101/699 nt) | ypfH | palmitoyl‑CoA esterase activity, uncertain physiological substrate |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base G (96/112); total (97/113) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
ATCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGA > CP009273/2586882‑2587170 | aTCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAt‑tt > 1:1442958/1‑148 (MQ=255) tCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAt‑ttg > 2:706838/1‑147 (MQ=255) tCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAt‑ttg > 2:1570682/1‑147 (MQ=255) cGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAt‑ttgc < 2:40440/148‑3 (MQ=255) gCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TT‑gcc > 2:3132201/1‑148 (MQ=255) gCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TT‑gcc < 1:2133356/148‑1 (MQ=255) gCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TT‑gcc < 1:2030792/148‑1 (MQ=255) tCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TT‑gccccc < 2:878564/148‑2 (MQ=255) tCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TT‑gccccc < 1:2916392/148‑2 (MQ=255) ccACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TT‑gccccca > 2:1450564/1‑146 (MQ=255) ccACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCAGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TT‑gccccca > 1:1945373/1‑146 (MQ=255) acGCGCCTCGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGc < 2:925021/148‑1 (MQ=255) cTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCgg < 2:2275325/148‑1 (MQ=255) ggCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGt < 1:699766/148‑1 (MQ=255) ggCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATGACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGt < 1:3365861/148‑1 (MQ=255) cGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTa > 1:2175602/1‑148 (MQ=255) cGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTa < 1:527035/148‑1 (MQ=255) aTTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATc > 1:1787323/1‑148 (MQ=255) tCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCg > 2:3429934/1‑148 (MQ=255) cTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGa > 1:2057811/1‑148 (MQ=255) cTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGa > 1:1542630/1‑148 (MQ=255) ccGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGacac > 1:10531/1‑148 (MQ=255) ccGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGacac > 2:3502062/1‑148 (MQ=255) ccGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGacac > 2:2812815/1‑148 (MQ=255) ccGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGacac > 1:10185/1‑148 (MQ=255) ccGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGacac > 1:451965/1‑148 (MQ=255) tAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGt > 1:2773116/1‑148 (MQ=255) aaTACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTg > 2:2396439/1‑148 (MQ=255) aaTACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTg > 1:752250/1‑148 (MQ=255) ccTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGaaaa > 1:3478123/1‑148 (MQ=255) cTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAg < 2:1245105/148‑1 (MQ=255) cTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAg > 2:1819394/1‑148 (MQ=255) tGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGc < 2:2481162/148‑1 (MQ=255) gCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCa < 1:2277095/148‑1 (MQ=255) gCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCa < 1:2331404/148‑1 (MQ=255) cACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAg < 2:1688096/148‑1 (MQ=255) ccGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTa < 2:1230105/148‑1 (MQ=255) ccGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTa < 2:1732801/148‑1 (MQ=255) aaaaCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaaca > 1:635508/1‑148 (MQ=255) aaaCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaacaa > 2:1348703/1‑148 (MQ=255) aaCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaacaac < 2:3395390/148‑1 (MQ=255) aCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACt > 1:3044076/1‑148 (MQ=255) cACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGt < 2:1142199/148‑1 (MQ=255) aCGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTgcgc > 1:2653174/1‑148 (MQ=255) cGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCa > 2:2761771/1‑148 (MQ=255) cGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCa > 2:753232/1‑148 (MQ=255) cccGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACACCTGTTGCGCAGGt < 2:1746244/148‑1 (MQ=255) cccGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGt < 2:2462884/148‑1 (MQ=255) ccgccgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGtt < 1:611023/148‑1 (MQ=255) ccgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTAt < 2:3227798/148‑1 (MQ=255) ccgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTAt > 2:2296221/1‑148 (MQ=255) ccgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTAt > 2:919517/1‑148 (MQ=255) cgGAGTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATc < 2:1851643/148‑1 (MQ=255) ttACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCggg < 1:2560861/148‑1 (MQ=255) ttACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCggg < 1:2673327/148‑1 (MQ=255) ttACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCggg < 2:483691/148‑1 (MQ=255) cTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGa < 1:1572394/148‑1 (MQ=255) cTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGa > 2:1661831/1‑148 (MQ=255) ggCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGaaca < 2:3215910/148‑1 (MQ=255) ccGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAAcaacaa > 1:3310857/1‑148 (MQ=255) ccGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAAcaacaa > 1:2319219/1‑148 (MQ=255) cgcgCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACaaa < 1:1311057/148‑1 (MQ=255) cgcgCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACaaa < 1:1742086/148‑1 (MQ=255) gcgcCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACaaaa < 1:2761771/148‑1 (MQ=255) gcgcCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACaaaa < 1:3473008/148‑1 (MQ=255) cgcCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAAt > 1:2958956/1‑148 (MQ=255) gcCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATg < 1:2473433/148‑1 (MQ=255) gcCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATg < 1:929071/148‑1 (MQ=255) ccGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCa > 2:2152914/1‑148 (MQ=255) acacTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGt < 2:2099198/148‑1 (MQ=255) acTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGttt > 2:2875691/1‑148 (MQ=255) cTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTc > 2:1652209/1‑148 (MQ=255) cTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCAGGACACCGTGGAAAAGCAGTTACTACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTc < 2:1442957/148‑1 (MQ=255) tCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCa < 1:1099162/148‑1 (MQ=255) tCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCa < 2:2969878/148‑1 (MQ=255) caccacCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCAt < 1:2514209/148‑1 (MQ=255) caccacCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCAt < 1:2514168/148‑1 (MQ=255) ccaccaGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATgg > 1:2042371/1‑148 (MQ=255) caccaGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGc > 1:3338959/1‑148 (MQ=255) ccaGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGa < 1:2714330/148‑1 (MQ=255) caGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGaa < 1:434961/148‑1 (MQ=255) cATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCt < 2:1083855/148‑1 (MQ=255) cATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCt > 1:3411984/1‑148 (MQ=255) cAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTaa < 1:237691/148‑1 (MQ=255) 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gCGGTGCAAACCAGGTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCa < 2:3156633/148‑1 (MQ=255) cAAACCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAAtt > 2:641188/1‑148 (MQ=255) aaaCCAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAAttt < 1:1302819/148‑1 (MQ=255) aCCAGGTGCCTATGTG‑CCCCCAGTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTa < 2:524059/148‑1 (MQ=255) ccAGTTGCCTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTAc > 1:2119229/1‑148 (MQ=255) 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cTAT‑TTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGa < 2:2057811/148‑1 (MQ=255) | ATCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAT‑TT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGA > CP009273/2586882‑2587170 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |