Predicted mutation | |||||||
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JC JC | CP009273 | 1,428,894 | IS2 (–) +5 bp | 100% | intergenic (‑413/+317) | ynaE ← / ← ttcC | cold shock protein, Rac prophage/pseudogene, prophage Rac integration site ttcA duplication;Phage or Prophage Related |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | CP009273 | 1428894 = | 1 (0.010) | 257 (1.270) | 139/274 | NT | 99.6% | intergenic (‑413/+321) | ynaE/ttcC | cold shock protein, Rac prophage/pseudogene, prophage Rac integration site ttcA duplication;Phage or Prophage Related |
? | CP009273 | = 1463497 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
* | ? | CP009273 | = 1428898 | 1 (0.010) | 215 (1.070) | 113/274 | NT | 99.5% | intergenic (‑417/+317) | ynaE/ttcC | cold shock protein, Rac prophage/pseudogene, prophage Rac integration site ttcA duplication;Phage or Prophage Related |
? | CP009273 | 1462167 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
TTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/1428753‑1428898 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTT > CP009273/1462167‑1462313 TTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACAGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATG > 1:314549/1‑148 CAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGA < 1:529785/148‑1 AGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGAT < 1:2346013/148‑1 CAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACAAGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCC < 1:1939295/148‑1 ATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATAT < 2:953164/148‑1 TGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATT > 1:2809303/1‑148 CTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTC < 1:1437879/148‑1 CTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTC < 1:22374/148‑1 AGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC > 2:455707/1‑148 GTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT < 2:769765/148‑1 GTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT < 2:769435/148‑1 TGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC < 1:572589/148‑1 TGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC < 1:1537817/148‑1 GCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGGTTCTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTG < 1:806459/148‑1 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TGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG < 2:3132088/148‑1 TGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG > 1:840776/1‑148 TGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG > 1:678595/1‑148 GGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGC < 1:2006275/148‑1 CAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC < 2:1462856/148‑1 CAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC > 1:861371/1‑148 CAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC > 1:1069334/1‑148 AGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTG < 2:2130898/148‑1 GCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGC > 1:2396004/1‑148 GCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGC > 1:87058/1‑148 GAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATAAATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGC > 2:845903/1‑148 TGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGAT < 2:529779/148‑1 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ATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGACCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGATGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGC > 2:2254686/1‑148 TATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATA < 1:2105518/148‑1 TATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATA > 1:3229010/1‑148 GCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACC < 1:325797/148‑1 GCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACC < 1:1658791/148‑1 GACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCG > 1:3103721/1‑148 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1:3439210/1‑148 CATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCT > 1:357660/1‑148 CATAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAAACAAGCTCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCT > 1:110215/1‑148 TAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCG > 1:1149294/1‑148 TAGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCG > 1:2455038/1‑148 AGATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGA < 2:1242628/148‑1 ATAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAAC < 1:1216131/148‑1 TAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACG > 1:1131108/1‑148 TAACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACG > 2:171338/1‑148 AACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGC > 2:2728525/1‑148 AACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGC > 1:1795619/1‑148 AACAGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGC > 1:62873/1‑148 AGTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTC < 1:1758637/148‑1 GTTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCT > 1:3409692/1‑148 TTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTG > 1:466860/1‑148 TTTTTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTG < 1:374337/148‑1 TTATCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAA > 2:1739826/1‑148 TCTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGT > 1:607801/1‑148 CTGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTT > 2:3506743/1‑148 TGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTC < 2:3199365/148‑1 TGAATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTC > 2:294629/1‑148 gATGGATTTGCCCCTATAGTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGTTATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCAATTCGTGATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTT < 2:1391130/147‑1 AATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTT > 2:2784688/1‑148 AATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTT > 1:336753/1‑148 ATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCTCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTT > 1:1762250/1‑148 ATGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTT > 2:32979/1‑148 ATGGATGTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATACCCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTT < 2:2814441/148‑1 TTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGATTGGGTTTAAAAGTATACATAGATAACAGTTTTTATCTGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/1428753‑1428898 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTT > CP009273/1462167‑1462313 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |