| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | CP009273 | 2,080,274 | IS2 (–) +5 bp | 100% | coding (266‑270/1359 nt) | plaP ← | putrescine importer, low affinity |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2062422 = | NA (NA) | 204 (1.010) | 118/274 | NT | 98.0% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | CP009273 | = 2080278 | 4 (0.020) | coding (266/1359 nt) | plaP | putrescine importer, low affinity | |||||
| * | ? | CP009273 | = 2063752 | NA (NA) | 213 (1.060) | 111/274 | NT | 98.1% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | CP009273 | 2080274 = | 4 (0.020) | coding (270/1359 nt) | plaP | putrescine importer, low affinity | |||||
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
CTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2063608‑2063752‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTGAGGCCTGAAACGAT > CP009273/2080274‑2080420 CTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAAT < 1:1153634/148‑1CTTGTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAAT < 2:3094300/148‑1 TTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGG < 1:2772418/148‑1 TTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGG > 1:3068447/1‑148 CTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTT < 2:1259958/148‑1 TGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATCTTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTC > 2:3188091/1‑148 TGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTC > 2:775093/1‑148 TGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTC < 2:1899176/148‑1 TGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTC < 1:205887/148‑1 CCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGT < 2:3228527/148‑1 GTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGT < 1:1095328/148‑1 GTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATATCTGGGCGTAAGTGT > 2:860688/1‑148 TCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTA > 1:369350/1‑148 CTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTAT < 1:166338/148‑1 GCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGC > 1:1395770/1‑148 CGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCA > 2:410801/1‑148 TCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGC < 2:645437/148‑1 CTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCC < 2:3215918/148‑1 CCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGA > 1:2299592/1‑148 TAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGG < 2:1561157/148‑1 AAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGA < 2:678055/148‑1 AGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGAT > 1:2157665/1‑148 GACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGACGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATA > 2:1753110/1‑148 ACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGTGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAG < 2:1922464/148‑1 TCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCA > 2:1125345/1‑148 CTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAG > 2:1017248/1‑148 CTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAG < 2:70785/148‑1 GTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCT > 2:568492/1‑148 TCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTC < 2:3352165/148‑1 ATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAG > 1:1500290/1‑148 TGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTCAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGC > 2:547289/1‑148 CTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCACTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCA > 2:288165/1‑148 AGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGA < 2:2288111/148‑1 GTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAG > 1:2188786/1‑148 GTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAG > 2:2958139/1‑148 GTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAG < 1:1759145/148‑1 TCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGC > 1:2271824/1‑148 TCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGC > 1:1683219/1‑148 CTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCC > 2:2621190/1‑148 CTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCC > 1:1931261/1‑148 CTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCC > 2:329768/1‑148 AAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAA > 2:285237/1‑148 AAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAA > 1:1468258/1‑148 AACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAA > 2:3383792/1‑148 AACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAA > 1:3299624/1‑148 AACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAA > 1:2482959/1‑148 ACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAAC > 2:1216498/1‑148 AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGG > 1:2424803/1‑148 GTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGA < 2:319045/148‑1 GTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGA > 1:1029418/1‑148 GTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGA < 1:2919666/148‑1 TATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGAT > 1:1517430/1‑148 TATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGAT > 2:3179640/1‑148 TTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCG < 1:764160/148‑1 TTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCG < 1:3436945/148‑1 TAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGC > 2:470625/1‑148 TAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGC > 2:1566263/1‑148 AAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCA < 1:1755301/148‑1 AAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCA < 1:1805326/148‑1 GACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAAT > 1:2834406/1‑148 ACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATC > 1:2173036/1‑148 CTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCA < 1:2566606/148‑1 CACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGC > 2:2003066/1‑148 CACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGC > 2:229891/1‑148 ACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCG < 1:117568/148‑1 CTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGA > 1:1597332/1‑148 CTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGA > 1:798746/1‑148 TTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGC > 1:1895066/1‑148 TTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGC > 1:48527/1‑148 GTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGG < 1:1228761/148‑1 GTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGG > 2:1792167/1‑148 TGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGC > 1:2659715/1‑148 ATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTG < 2:2169072/148‑1 ATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTG < 1:2569552/148‑1 ATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTC > 1:2807994/1‑148 TGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGTATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGATCCGTAAACAGGATCGCAATCAATTCGAACGCATAGGCTGTCGG > 1:3029769/1‑148 GGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGC < 1:330904/148‑1 GTTCTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGAAGAATGATAGCGGCGAACCAGCAACCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCCAAGCCTGTCGGCA > 2:2335323/1‑148 TGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACA > 1:309887/1‑148 CTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGA > 2:1747233/1‑148 GAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCA > 1:3212671/1‑148 GAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCA > 1:1529927/1‑148 GATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATC > 2:2062888/1‑148 GATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATC < 2:2482950/148‑1 ATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCC > 1:389935/1‑148 ATTCAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCC < 1:3434796/148‑1 CAGGGGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTG > 1:1988381/1‑148 GGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTGAGGC > 1:2479503/1‑148 GGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTGAGGC > 2:2492765/1‑148 GGGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTGAGGC < 1:2092965/148‑1 GGCCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTGAGGCC < 1:2703750/148‑1 CCAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTGAGGCCTG > 2:2801217/1‑148 CAGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTGAGGCCTGA > 1:2670548/1‑148 AGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGGAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTGAGGCCTGAA < 1:630792/148‑1 AGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTGAGGCCTGAA < 2:369350/148‑1 AGTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTGAGGCCTGAA < 1:2882772/148‑1 GTCTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTGAGGCCTGAAA < 2:2157665/148‑1 CTAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTGAGGCCTGAAACG > 1:1009643/1‑148 TAAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTGAGGCCTGAAACGA < 2:305214/148‑1 AAATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTGAGGCCTGAAACGAT > 2:3317487/1‑148 CTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2063608‑2063752‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATGGATTTCTGGGCGTAAGTGTATGCAGAGCCAGCAGAAGGATAGCGGCGAACCAGCTTCCCGTAGCTCAGAGCCGTAAACAGGATCGCAATCAATGCGAACGCATAGGCTGTCGGCACATGACCATCCGTGAGGCCTGAAACGAT > CP009273/2080274‑2080420 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |