| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 360652 = | 175 (0.870) | 3130 (23.440) +AATTAATGTAAGTTAGCGCGAATTGATCTGGTTTGACAGCTTATCA |
177/182 | NT | 96.6% | intergenic (‑586/+9) | lacZ/lacI | pseudogene, truncated/DNA‑binding transcriptional repressor |
| ? | CP009273 | = 1317577 | 160 (0.790) | coding (101/882 nt) | yciV | PHP domain protein | |||||
Only 100 of 5737 total aligned reads displayed.
CCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAGATGCGCGTCGGCACCCTGGCGATCACCGACCATGACACCACAGCTGCAATCGCGCCAGCAAGAGAGGAAATTTCACGTTCGGGACTGGCGTTGAATCTTATTCCCGGCGTGGAAATTTCCACGGTCTGGGAAAATCATGAAATTC > CP009273/1317429‑1317723 | cGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAAGTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCga < 2:360233/148‑1 (MQ=255) gatgTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAAGGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAGATgcg > 2:2618958/1‑148 (MQ=255) gatgTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataa > 2:1524346‑M2/1‑142 (MQ=255) gatgTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataa < 1:3062440‑M2/148‑7 (MQ=255) atgTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataag > 1:2201067‑M2/1‑141 (MQ=255) atgTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataag > 1:3000192‑M2/1‑141 (MQ=255) gTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagct < 2:678134‑M2/148‑10 (MQ=255) gTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagct > 1:235764‑M2/1‑139 (MQ=255) cgcAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaa > 2:53385‑M2/1‑134 (MQ=255) cAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaac < 1:54259‑M2/148‑17 (MQ=255) cAAAAAACATTATCCAGAACCGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCTATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAGATGCGCGTCGGCAcc > 1:618617/1‑148 (MQ=255) aaaaaCATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaacca < 2:195266‑M2/148‑19 (MQ=255) aaaaCATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATTCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccag > 1:1200718‑M2/1‑129 (MQ=255) aaaaCATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccag < 2:1383321‑M2/148‑20 (MQ=255) aaaaCATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccag > 1:2678350‑M2/1‑129 (MQ=255) aaaCATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCAGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccaga < 2:940939‑M2/148‑21 (MQ=255) aaaCATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGGGATTTACGACATGCACAGCCATACAACAGCTACCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccaga < 2:2182309‑M2/148‑21 (MQ=255) aaCATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGAGTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagat < 2:1761385‑M2/148‑22 (MQ=255) aCATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatc < 2:1456131‑M2/148‑23 (MQ=255) cATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatca > 2:2862534‑M2/1‑125 (MQ=255) aTTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaa > 1:1498775‑M2/1‑124 (MQ=255) aTTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaa < 2:1267104‑M2/148‑25 (MQ=255) aTTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaa > 1:326510‑M2/1‑124 (MQ=255) tATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaatt < 2:1821217‑M2/148‑27 (MQ=255) tATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaatt > 2:3322622‑M2/1‑122 (MQ=255) tCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcg < 1:1627910‑M2/148‑29 (MQ=255) ccAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgc < 1:2418636‑M2/148‑30 (MQ=255) ccAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgc < 2:3177411‑M2/148‑30 (MQ=255) cGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCCTTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaac < 2:2720536‑M2/148‑36 (MQ=255) ggAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaactt > 2:2666205‑M2/1‑111 (MQ=255) gAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaactta < 1:352749‑M2/148‑39 (MQ=255) tGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacat < 1:2542824‑M2/148‑42 (MQ=255) tGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAGATGCGCGTCGGCACCCTGGCGATCACCGACCATGAcacca > 1:918680/1‑148 (MQ=255) cgcCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacatta > 2:1639554‑M2/1‑105 (MQ=255) ccTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaat > 1:1067009‑M2/1‑103 (MQ=255) ccTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaat < 1:139494‑M2/148‑46 (MQ=255) aGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgt > 2:420763‑M2/1‑98 (MQ=255) aGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgt < 1:3396192‑M2/148‑51 (MQ=255) aGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgt > 1:2885045‑M2/1‑98 (MQ=255) gCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgtt > 1:2312022‑M2/1‑97 (MQ=255) cGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttg < 1:1933667‑M2/148‑53 (MQ=255) aaacgaATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgagttgcg < 1:737522‑M2/146‑55 (MQ=255) cacGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgc < 1:2487748‑M2/148‑56 (MQ=255) cGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctc < 1:1797510‑M2/148‑58 (MQ=255) gAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACTCCAGAAGCATTGGTTCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctca > 2:2798375‑M2/1‑90 (MQ=255) gAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctca > 1:806277‑M2/1‑90 (MQ=255) gAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctca > 1:212694‑M2/1‑90 (MQ=255) gAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctca > 2:1137474‑M2/1‑90 (MQ=255) gAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctca > 1:1864836‑M2/1‑90 (MQ=255) gAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctca > 1:2798472‑M2/1‑90 (MQ=255) gAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctca > 1:686246‑M2/1‑90 (MQ=255) aaTTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcac > 1:1728302‑M2/1‑89 (MQ=255) ttATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactg < 1:3208109‑M2/148‑62 (MQ=255) tATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAGATGCGCGTCGGCACCCTGGCGATCACCGACCATGACACCACAGCTGCAATCGCGCCAGCaa > 1:2734542/1‑148 (MQ=255) tATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGAAGCCAGAAGCATTTGTGAACCTTGAAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattagctctaacttacattaattgcgttgcgctcactgc > 1:1685330‑M2/1‑86 (MQ=255) tGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgccc < 1:1132009‑M2/148‑65 (MQ=255) aTTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttcc > 2:1194888‑M2/1‑77 (MQ=255) ttACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccag > 2:1885730‑M2/1‑75 (MQ=255) tACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagt > 1:2055663‑M2/1‑74 (MQ=255) tACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagt > 1:869364‑M2/1‑74 (MQ=255) aCGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtc < 1:1262477‑M2/148‑76 (MQ=255) cGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcg > 2:2310340‑M2/1‑72 (MQ=255) gACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgg < 1:411649‑M2/148‑78 (MQ=255) gACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgg > 2:765572‑M2/1‑71 (MQ=255) aCCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcggg > 2:2915654‑M2/1‑70 (MQ=255) cTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaa < 2:47361‑M2/148‑81 (MQ=255) gCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaac > 1:2944270‑M2/1‑66 (MQ=255) cacaGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacc < 2:2084940‑M2/148‑84 (MQ=255) cacaGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacc > 2:1697221‑M2/1‑65 (MQ=255) caGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctg > 2:2501784‑M2/1‑63 (MQ=255) caGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctg > 1:2004072‑M2/1‑63 (MQ=255) gCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtc > 1:1000284‑M2/1‑61 (MQ=255) cATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgt < 1:1443808‑M2/148‑90 (MQ=255) aTACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtg < 2:2982058‑M2/148‑91 (MQ=255) tACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgc > 2:2246478‑M2/1‑57 (MQ=255) cacaGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccag < 1:491202‑M2/148‑95 (MQ=255) caGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagct < 2:895718‑M2/148‑97 (MQ=255) caGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagct < 2:1323874‑M2/148‑97 (MQ=255) cTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgca > 1:976838‑M2/1‑49 (MQ=255) ccGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcatta > 2:597269‑M2/1‑46 (MQ=255) ccGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcatta > 1:1329747‑M2/1‑46 (MQ=255) tGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatga > 1:2606819‑M2/1‑42 (MQ=255) ggCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaa < 1:3124050‑M2/148‑108 (MQ=255) ggCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaa < 1:1567029‑M2/148‑108 (MQ=255) cTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatc < 2:3378127‑M2/148‑110 (MQ=255) gACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaa < 2:3435235‑M2/148‑116 (MQ=255) aGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAggataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcgggg < 2:3052133‑M2/148‑125 (MQ=255) gCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaagcctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcgggga > 2:2432396‑M2/1‑23 (MQ=255) cATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggag < 2:3247183‑M2/148‑127 (MQ=255) ttGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagag > 2:2137376‑M2/1‑20 (MQ=255) tGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagagg < 2:2361367‑M2/148‑130 (MQ=255) ggTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggc > 2:202126‑M2/1‑18 (MQ=255) gTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcg > 2:2565447‑M2/1‑17 (MQ=255) gTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcg < 1:3324966‑M2/148‑132 (MQ=255) gTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcg > 2:1578340‑M2/1‑10 (MQ=255) tGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgt < 1:2253534‑M2/148‑140 (MQ=255) tCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtattgg > 2:3117037‑M2/1‑4 (MQ=255) tCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtattgg < 1:3450326‑M2/148‑145 (MQ=255) cGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtattggg > 2:1048971‑M2/1‑3 (MQ=255) cGAtgataagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtattggg > 2:833270‑M2/1‑3 (MQ=255) | CCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAGATGCGCGTCGGCACCCTGGCGATCACCGACCATGACACCACAGCTGCAATCGCGCCAGCAAGAGAGGAAATTTCACGTTCGGGACTGGCGTTGAATCTTATTCCCGGCGTGGAAATTTCCACGGTCTGGGAAAATCATGAAATTC > CP009273/1317429‑1317723 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |