Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,279,816 | G→T | 100% | A27A (GCG→GCT) | nrfC → | formate‑dependent nitrite reductase, 4Fe4S subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,279,816 | 0 | G | T | 99.5% | 644.7 / ‑4.3 | 200 | A27A (GCG→GCT) | nrfC | formate‑dependent nitrite reductase, 4Fe4S subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (86/113); total (86/114) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
CACAGCGATCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGTAGCGAG > CP009273/4279671‑4279960 | caGCGATCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTaaaa > 2:1373221/1‑148 (MQ=255) cGATCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGt < 2:2378622/148‑1 (MQ=255) gATCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGtt < 2:528237/148‑1 (MQ=255) aTCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTg < 1:951518/148‑1 (MQ=255) tCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGa < 2:1346348/148‑1 (MQ=255) cAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGaa > 1:3339233/1‑148 (MQ=255) atgcgcACGAATGCGAACTTTAACTCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCAGCGGCGTCGGCGTGGTGGCTGCCGTCAGCGGCTCCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAATGGTTGaa < 2:2021803/146‑1 (MQ=255) aGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAat < 2:1008294/148‑1 (MQ=255) aGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAat < 1:2302021/148‑1 (MQ=255) cgcACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGaggtg > 2:3207673/1‑144 (MQ=255) cgcACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAatat > 2:3252935/1‑148 (MQ=255) cACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCa < 1:3081110/148‑1 (MQ=255) aCCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCaa < 1:794737/148‑1 (MQ=255) aCCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCaa < 1:1358609/148‑1 (MQ=255) cAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATg > 2:925547/1‑148 (MQ=255) aaTCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATgg < 2:449010/148‑1 (MQ=255) aTCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCANCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATggg < 1:1783921/148‑1 (MQ=255) tCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTCAAACGTTGAATATCAATgggg > 2:2997802/1‑148 (MQ=255) tCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATgggg > 2:3158605/1‑148 (MQ=255) aCTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGt > 1:1214764/1‑148 (MQ=255) aCTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGt > 1:1215104/1‑148 (MQ=255) tttAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTa > 2:3343255/1‑148 (MQ=255) cccGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCa < 2:1506448/148‑1 (MQ=255) cGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATg < 1:1615627/148‑1 (MQ=255) ggCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATgg < 2:1909255/148‑1 (MQ=255) ggCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATgg < 2:964357/148‑1 (MQ=255) ggCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATgg < 2:2842609/148‑1 (MQ=255) cGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTg < 1:2111715/148‑1 (MQ=255) tCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAACACGTTGAAGATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCa < 2:2297956/148‑1 (MQ=255) tCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCa < 2:2298033/148‑1 (MQ=255) tGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATg > 1:267998/1‑148 (MQ=255) tGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATg > 2:1905840/1‑148 (MQ=255) gTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGa < 2:1275897/148‑1 (MQ=255) ttCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGAc > 1:1526991/1‑148 (MQ=255) tCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACg > 2:1075832/1‑148 (MQ=255) tCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACg > 2:1075670/1‑148 (MQ=255) ccGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGa < 1:2527846/148‑1 (MQ=255) ccGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGa < 2:2261845/148‑1 (MQ=255) ccGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGa < 2:1612706/148‑1 (MQ=255) gTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGt > 1:762320/1‑148 (MQ=255) cTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGtt < 2:584961/148‑1 (MQ=255) cTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGtt > 1:1632861/1‑148 (MQ=255) ttAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGTTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTa < 2:3236659/148‑1 (MQ=255) ttAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTa < 1:249397/148‑1 (MQ=255) tAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTAt > 2:2945337/1‑148 (MQ=255) aGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGc > 1:546871/1‑148 (MQ=255) ggAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCa > 1:1160140/1‑148 (MQ=255) ggAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCa > 2:3137924/1‑148 (MQ=255) ggAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCa > 1:3489436/1‑148 (MQ=255) gAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCAt > 1:284342/1‑148 (MQ=255) gAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCAt < 2:3303886/148‑1 (MQ=255) agcagcCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACAGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATc < 1:952346/148‑1 (MQ=255) agcagcCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACAGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATc < 1:952387/148‑1 (MQ=255) ccATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTg < 2:2236681/148‑1 (MQ=255) cATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGt < 1:2410095/148‑1 (MQ=255) aTGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTTGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTa < 1:1480996/148‑1 (MQ=255) aTGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTa < 1:1929344/148‑1 (MQ=255) aTGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTa < 1:2530456/148‑1 (MQ=255) ccTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGc < 1:157001/148‑1 (MQ=255) cTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGcc < 1:2570525/148‑1 (MQ=255) tGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCt > 1:2799817/1‑148 (MQ=255) tGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCt > 1:1048609/1‑148 (MQ=255) gTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGt < 2:790177/148‑1 (MQ=255) gTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGt < 1:454289/148‑1 (MQ=255) ctcGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTAt < 1:2028845/148‑1 (MQ=255) cgtcgCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTGGCATATGAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATgg < 2:578731/148‑1 (MQ=255) cgCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATg < 2:342963/148‑1 (MQ=255) gCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGc < 1:2402583/148‑1 (MQ=255) aGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTg < 1:3058640/148‑1 (MQ=255) gTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGt < 2:3419122/148‑1 (MQ=255) cACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGaa > 2:1737092/1‑148 (MQ=255) cACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGaa < 2:3273233/148‑1 (MQ=255) cggcgtcggcgtGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTg > 1:387992/1‑148 (MQ=255) cgtcggcgtGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAAc > 2:2586930/1‑148 (MQ=255) tcggcgtGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACaa < 2:1048609/148‑1 (MQ=255) tcggcgtGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACaa < 2:1523352/148‑1 (MQ=255) cggcgtGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGACGTGAACAAg > 2:1396708/1‑148 (MQ=255) gcgtGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGt < 2:632672/148‑1 (MQ=255) tGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGa < 2:2522587/148‑1 (MQ=255) ggCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGaa > 2:3244857/1‑148 (MQ=255) aGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGc > 2:2984704/1‑148 (MQ=255) cGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGtc < 2:1586249/148‑1 (MQ=255) cGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCgcgc < 2:2905052/148‑1 (MQ=255) cGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCgcgc > 1:3062640/1‑148 (MQ=255) cGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCAGGAAGGCGTCTCgcgc > 2:220473/1‑148 (MQ=255) cACCGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTg < 1:925547/148‑1 (MQ=255) ccGCAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGAc > 1:963822/1‑148 (MQ=255) cAGGGCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGat > 1:1615200/1‑148 (MQ=255) gggCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGatta < 2:353525/148‑1 (MQ=255) gggCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGatta < 2:354035/148‑1 (MQ=255) gggCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGatta > 2:2862849/1‑148 (MQ=255) ggCGCGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGattat < 2:2360658/148‑1 (MQ=255) gcgcGTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGattatt < 2:1208831/148‑1 (MQ=255) cgTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGt > 1:3368046/1‑148 (MQ=255) cgTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGt > 2:2740766/1‑148 (MQ=255) cgTGGTGGCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGt < 1:2914648/148‑1 (MQ=255) gtggCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGTAGCg < 1:1342911/148‑1 (MQ=255) gtggCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGTAGCg > 1:3467182/1‑148 (MQ=255) ggCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGTAGCGAg > 2:478725/1‑148 (MQ=255) ggCTAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGTAGCGAg < 1:3241955/148‑1 (MQ=255) | CACAGCGATCAGCGCACCAATCCGAACTTTAACCCGGCGTCTGTTCCGTTGCTTAAGGAGCAGCCATGACCTGGTCTCGTCGCCAGTTTCTCACCGGCGTCGGCGTGCTGGCAGCCGTCAGCGGCACCGCAGGGCGCGTGGTGGCGAAAACGTTGAATATCAATGGGGTGCGTTACGGCATGGTGCATGACGAGTCGTTATGCATCGGCTGTACCGCCTGTATGGATGCTTGTCGGGAAGTGAACAAGGTGCCGGAAGGCGTCTCGCGCCTGACGATTATTCGTAGCGAG > CP009273/4279671‑4279960 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |