Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,288,086 | G→T | 100% | F366L (TTC→TTA) | fdhF ← | formate dehydrogenase‑H, selenopolypeptide subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,288,086 | 0 | G | T | 99.2% | 767.4 / ‑2.1 | 235 | F366L (TTC→TTA) | fdhF | formate dehydrogenase‑H, selenopolypeptide subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base T (96/137); total (98/137) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
CTGCCGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCGAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGGTC > CP009273/4287941‑4288230 | cTGCCGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACTCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCTCTGTCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTaa < 1:73267/148‑1 (MQ=255) tGCCGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAAt < 1:3040492/148‑1 (MQ=255) ccGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAAttt < 2:909162/148‑1 (MQ=255) ccGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAAttt < 1:2634611/148‑1 (MQ=255) ccGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAAttt < 1:1440930/148‑1 (MQ=255) ccGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAAttt < 1:2314119/148‑1 (MQ=255) gACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTtct < 2:2790376/148‑1 (MQ=255) cAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTcg < 2:2146120/148‑1 (MQ=255) cTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCgg < 2:2911335/148‑1 (MQ=255) tCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGt < 2:978213/148‑1 (MQ=255) tCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGt < 1:706075/148‑1 (MQ=255) ccGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGtt < 2:2118713/148‑1 (MQ=255) ccGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGtt > 1:2181182/1‑148 (MQ=255) cgcgTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTa > 2:854948/1‑148 (MQ=255) cgcgTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTa < 1:178768/148‑1 (MQ=255) cgTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGc < 2:1369206/148‑1 (MQ=255) cgTCAGGTTGTAGCGGATCTTCTCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGAGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCTGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGc > 2:2534689/1‑148 (MQ=255) gTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGAt < 1:3315437/148‑1 (MQ=255) tttGTAGCGTATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATc > 1:1560172/1‑148 (MQ=255) tttGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATc < 1:1653226/148‑1 (MQ=255) tttGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATc < 1:2863769/148‑1 (MQ=255) tttGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATc < 2:708059/148‑1 (MQ=255) ttGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCt > 1:1275053/1‑148 (MQ=255) tAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTc < 2:395312/148‑1 (MQ=255) aGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCa < 1:862882/148‑1 (MQ=255) cGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACg > 1:2868410/1‑148 (MQ=255) cGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACg > 1:1113715/1‑148 (MQ=255) ggATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGt < 2:3304863/148‑1 (MQ=255) ggATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGt < 2:76737/148‑1 (MQ=255) tCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACt < 2:56857/148‑1 (MQ=255) cccATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATc > 2:2054183/1‑148 (MQ=255) cccATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATc < 2:3485676/148‑1 (MQ=255) ccATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATcc < 1:1469622/148‑1 (MQ=255) aTAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCg > 2:1225304/1‑148 (MQ=255) aaTGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGa < 1:3419992/148‑1 (MQ=255) aTGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGAt > 2:802761/1‑148 (MQ=255) aTGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGAt > 2:2307746/1‑148 (MQ=255) tGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATa < 2:3262371/148‑1 (MQ=255) tGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATa < 2:1113777/148‑1 (MQ=255) cgcgGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTa < 1:1209180/148‑1 (MQ=255) cgcgGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTa > 2:3429075/1‑148 (MQ=255) gcgGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTAt < 1:202843/148‑1 (MQ=255) cgGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATc > 1:774780/1‑148 (MQ=255) cacgcacTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCgg < 2:2125821/148‑1 (MQ=255) gcacTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAg < 1:3362730/148‑1 (MQ=255) cTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAgcgc > 1:2511179/1‑148 (MQ=255) tCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAgcgcgc > 1:431315/1‑148 (MQ=255) aTGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCata > 2:1846096/1‑148 (MQ=255) tgcgctgcgcGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCatat > 2:2267070/1‑148 (MQ=255) tgcgctgcgcGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCatat < 2:49958/148‑1 (MQ=255) tgcgctgcgcGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCatat > 2:1421352/1‑148 (MQ=255) tgcgctgcgcGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCatat < 2:547043/148‑1 (MQ=255) gctgcgcGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGc < 2:3233779/148‑1 (MQ=255) ctgcgcGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCa < 2:3365095/148‑1 (MQ=255) cgGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCAc < 2:2851322/148‑1 (MQ=255) gCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAAc < 2:2218015/148‑1 (MQ=255) gCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAAc > 1:2452380/1‑148 (MQ=255) cAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACg < 1:2709099/148‑1 (MQ=255) cTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACgttg > 2:1679769/1‑148 (MQ=255) cTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACgttg < 1:1551435/148‑1 (MQ=255) tCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACgttgt < 2:1284263/148‑1 (MQ=255) tCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACgttgt < 2:3030335/148‑1 (MQ=255) gCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTc > 2:2725570/1‑148 (MQ=255) cTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCt < 1:317422/148‑1 (MQ=255) cTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCt > 1:1975452/1‑148 (MQ=255) tGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGAcc < 2:2678537/148‑1 (MQ=255) tAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGaa > 1:1821058/1‑148 (MQ=255) tAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGaa < 2:927700/148‑1 (MQ=255) gTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGt > 1:2806005/1‑148 (MQ=255) gTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGt < 2:660586/148‑1 (MQ=255) gTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGt > 1:794841/1‑148 (MQ=255) aTGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTa < 2:1107200/148‑1 (MQ=255) gcgcTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAac < 1:1345414/148‑1 (MQ=255) gCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCCCCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGc > 2:1893509/1‑148 (MQ=255) gCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGc < 1:1730048/148‑1 (MQ=255) gCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGc < 1:3122307/148‑1 (MQ=255) ggCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATg < 1:1746725/148‑1 (MQ=255) ggCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATg < 1:3067222/148‑1 (MQ=255) cTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCg > 1:3346839/1‑148 (MQ=255) ttCCACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGc > 1:2738642/1‑148 (MQ=255) ccACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCtt > 1:2285926/1‑148 (MQ=255) cACGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTa > 2:2661904/1‑148 (MQ=255) aCGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTAc < 1:1149131/148‑1 (MQ=255) aCGCCCCAGGCTTTGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTAc < 1:2934921/148‑1 (MQ=255) 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tGGCTAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGGt < 2:1329829/148‑1 (MQ=255) | CTGCCGACAGCTCCGCGTCAGTTTGTAGCGGATCTTCGCCCATAATGTACGCGGCACGCACTTCGCCATGCGCTGCGCGGTGCGGCAGCTCGCTGATGCGATAGCCGGTATGCGCTGGCAGGCTTTCCACGCCCCAGGCTTTGGCGAATTTCTCGCGGTTAGCCGGATCTTTCACGTACTGGTATCCCGGATACGTATCCGGCAGCGCGCCCATATCGCAGGCACCCTGAACGTTGTTCTGACCACGAACCGGGTTAACACCCGCATGCGGCTTACCGAGGTTACCGGTC > CP009273/4287941‑4288230 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |