Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,354,467 | T→A | 5.3% | P131P (CCA→CCT) | dsbD ← | fused thiol:disulfide interchange protein: activator of DsbC/conserved protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,354,467 | 0 | T | A | 5.3% | 645.4 / 20.2 | 209 | P131P (CCA→CCT) | dsbD | fused thiol:disulfide interchange protein: activator of DsbC/conserved protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (79/119); new base A (5/6); total (84/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.58e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.25e-01 |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
CGTAAAGGCGATACCAATACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAG > CP009273/4354320‑4354611 | cGTAAAGGCGATACCAATACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCt > 2:2330460/1‑148 (MQ=255) tAAAGGCGATACCAATACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTgg > 1:11245/1‑148 (MQ=255) tAAAGGCGATACCAATACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTgg > 1:1900724/1‑148 (MQ=255) tAAAGGCGATACCAATACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTgg > 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ggCGATACCAATACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGa < 2:184561/148‑1 (MQ=255) cGATACCAATACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATa < 1:1797158/148‑1 (MQ=255) cGATACCAATACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATa < 1:968441/148‑1 (MQ=255) gATACCAATACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATaa < 2:1353083/148‑1 (MQ=255) tACCAATACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACa < 1:1155944/148‑1 (MQ=255) aCCAATACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAg > 2:2743052/1‑148 (MQ=255) ccAAGACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAACGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGa < 2:2261678/148‑1 (MQ=255) aaTACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGaaa > 2:2446209/1‑148 (MQ=255) aaTACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGaaa < 2:941434/148‑1 (MQ=255) aTACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAAc < 2:3280754/148‑1 (MQ=255) ccGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATGACAGGAACCgg > 2:1839152/1‑148 (MQ=255) cGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGc < 1:2289124/148‑1 (MQ=255) gATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCa > 2:1109296/1‑148 (MQ=255) aTCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCAt > 1:640672/1‑148 (MQ=255) tCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATc < 1:395454/148‑1 (MQ=255) tCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATc > 1:3199815/1‑148 (MQ=255) caacGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGca > 1:811982/1‑148 (MQ=255) aacGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGcac > 1:1462967/1‑148 (MQ=255) cGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAg < 2:1545148/148‑1 (MQ=255) cGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAg < 2:2080191/148‑1 (MQ=255) gCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGTACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGc < 2:813765/148‑1 (MQ=255) ccAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGccc > 2:218426/1‑148 (MQ=255) agagCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTg < 1:763338/148‑1 (MQ=255) cgcgGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAg > 1:2513256/1‑148 (MQ=255) cgGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGt < 2:1382286/148‑1 (MQ=255) ggAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTg < 1:839662/148‑1 (MQ=255) gAAATGGGCAAGTGCTCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGGGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACATAAACCGGCATGAGCACAGACCTGGTAGGTGa < 2:1129470/148‑1 (MQ=255) gAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGa > 2:3075792/1‑148 (MQ=255) aaaGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACa > 1:703533/1‑148 (MQ=255) aaaGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCAGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACa > 1:2886017/1‑148 (MQ=255) aGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTACCGGTACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGt < 2:3265769/148‑1 (MQ=255) gggCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGtt > 2:1499315/1‑148 (MQ=255) agtGCGCGGTGGGCTGCTCGTGCTGCGGAACCGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGt < 1:2186649/146‑1 (MQ=255) aTTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGt < 2:863536/148‑1 (MQ=255) tGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCAGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCg < 2:1749519/148‑1 (MQ=255) cgGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTcc < 1:3345614/148‑1 (MQ=255) gggCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCa > 1:3251403/1‑148 (MQ=255) gggCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCAGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCa < 1:3302709/148‑1 (MQ=255) gctgctCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACt > 1:2716009/1‑148 (MQ=255) tgctCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCg < 1:104647/148‑1 (MQ=255) ctctTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGcc < 1:3426658/148‑1 (MQ=255) ctctTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGcc < 2:1216743/148‑1 (MQ=255) gctgcGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGtt < 2:1484631/148‑1 (MQ=255) tgcGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGa < 1:2102670/148‑1 (MQ=255) ggAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATgg < 2:2046772/148‑1 (MQ=255) 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ggCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCg > 2:2850083/1‑148 (MQ=255) ggCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCg < 1:2181066/148‑1 (MQ=255) tgGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGc > 2:3052508/1‑148 (MQ=255) cgcTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGa < 2:2545220/148‑1 (MQ=255) gcTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGAt < 1:469463/148‑1 (MQ=255) 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tgGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAAt < 1:3155721/148‑1 (MQ=255) tgGAGACCACTTCGCTTAACGTAACGTTTTTGGTTTCTGGCGTATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTATGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTatat < 2:1218772/148‑1 (MQ=255) gACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCg < 1:2351067/148‑1 (MQ=255) ccACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCt < 1:618197/148‑1 (MQ=255) ccACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCt < 2:2161912/148‑1 (MQ=255) ccACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCt > 1:1617546/1‑148 (MQ=255) cACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCtt < 1:1392819/148‑1 (MQ=255) cACTTCGATTAACGGAACGGTTTTGGATTCTGGCGGATAAAAGAAAACGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTAAACGTCGCTCCCGCACTAGCCGGGTTGATGGTGACTGGAAGCTTCAGACGATCGCGGTAAAtctatctt > 2:2421786/1‑143 (MQ=255) ttCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTg > 1:1658509/1‑148 (MQ=255) ttCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTg < 1:2151989/148‑1 (MQ=255) 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ttCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAg < 1:3075792/148‑1 (MQ=255) | CGTAAAGGCGATACCAATACCGATCAACAACGCCCAGAGCGCGGAAAAGGGCAATTGCGCGGTGGGCTGCTCTTGCTGCGGAACAGACACAGGCTGTGGCGCTGCGTTGTTGGCGACCACTTCGCTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAG > CP009273/4354320‑4354611 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |