| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,428,092 | G→T | 100% | G190V (GGA→GTA) | ytfI → | uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,428,092 | 0 | G | T | 98.9% | 876.5 / ‑1.0 | 275 | G190V (GGA→GTA) | ytfI | uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base T (127/145); total (129/146) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
TTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCTGTTGTTT > CP009273/4427948‑4428235 | tCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGt > 1:3011743/1‑148 (MQ=255) tCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGt > 1:63807/1‑148 (MQ=255) tCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGAGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGt > 1:3174422/1‑148 (MQ=255) aCAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGa > 2:199194/1‑148 (MQ=255) aCAGAAAAAACAGTCTGACAGACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGa < 2:2199848/148‑1 (MQ=255) aGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAAt > 1:3476156/1‑148 (MQ=255) gAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAAtt > 1:811389/1‑148 (MQ=255) aaaaaCAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTaa > 2:845027/1‑148 (MQ=255) aaaaaCAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTaa < 2:2719147/148‑1 (MQ=255) aaaCAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAg < 2:1153562/148‑1 (MQ=255) aaaCAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAg < 2:1791829/148‑1 (MQ=255) aaCAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGa < 1:1438856/148‑1 (MQ=255) aCAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGaa > 1:7304/1‑148 (MQ=255) aGTCTGAAATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGAAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATg < 2:3297176/148‑1 (MQ=255) cTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCga < 1:2928983/148‑1 (MQ=255) cTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCga < 1:3412060/148‑1 (MQ=255) cTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCga < 1:3346091/148‑1 (MQ=255) tGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCgat < 2:1456948/148‑1 (MQ=255) aCATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCgatgg > 1:2579825/1‑148 (MQ=255) cATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCgatgga < 1:1947197/148‑1 (MQ=255) tACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCgatggatg < 1:834030/148‑1 (MQ=255) aCCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGatggatgg < 2:2573552/148‑1 (MQ=255) cGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGta > 1:2796190/1‑148 (MQ=255) gAAAAGTATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGtat < 2:3134370/148‑1 (MQ=255) aaGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATAtt > 2:3090007/1‑148 (MQ=255) ttAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTCGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGa > 2:121432/1‑148 (MQ=255) ttAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGa > 2:3081654/1‑148 (MQ=255) ttAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGa > 2:1263329/1‑148 (MQ=255) tAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGaa > 1:2219899/1‑148 (MQ=255) aGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGaaaaa > 1:947542/1‑148 (MQ=255) ggTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGaaaaaa > 1:1534410/1‑148 (MQ=255) gTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGTATTAAAAAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAaat > 2:864994/1‑148 (MQ=255) ttATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAaata > 1:2070549/1‑148 (MQ=255) ttATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAaata > 1:2546895/1‑148 (MQ=255) atatTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAaataat < 2:63460/148‑1 (MQ=255) tatTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAAtt < 1:2740070/148‑1 (MQ=255) atTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATtg > 1:2961879/1‑148 (MQ=255) atTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATtg < 1:1676254/148‑1 (MQ=255) ttCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATtga < 2:1787134/148‑1 (MQ=255) cACCAGGCGAGTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATtgatg < 2:1891226/148‑1 (MQ=255) aCCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATtgatga > 2:966603/1‑148 (MQ=255) aGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATaa < 1:2526300/148‑1 (MQ=255) aTTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTg > 2:2074487/1‑148 (MQ=255) tGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGcc < 2:1981692/148‑1 (MQ=255) tGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGcc > 2:1094286/1‑148 (MQ=255) ggTGACGTGTCTTTAGGTTATTCCTTATTGGAGTATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCa < 1:2955083/148‑1 (MQ=255) cGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTc < 2:1237615/148‑1 (MQ=255) gtgtCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCa < 1:501688/148‑1 (MQ=255) gtgtCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCa < 2:2446358/148‑1 (MQ=255) tgtCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCAt < 2:2158981/148‑1 (MQ=255) tgtCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCAt > 2:1654941/1‑148 (MQ=255) cTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATGTTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGa > 2:474386/1‑148 (MQ=255) tttAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGaa < 1:352149/148‑1 (MQ=255) tttAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGaa < 1:1259231/148‑1 (MQ=255) tttAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGaa > 1:194439/1‑148 (MQ=255) ttAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAAt < 2:3333073/148‑1 (MQ=255) ttAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAAt > 2:2650129/1‑148 (MQ=255) aGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCt < 1:780449/148‑1 (MQ=255) ttATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTg > 2:1929237/1‑148 (MQ=255) ccTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCtt < 1:2103661/148‑1 (MQ=255) ttATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTg < 2:1366684/148‑1 (MQ=255) ttGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTgcgc > 1:108515/1‑148 (MQ=255) ttGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTgcgc < 1:3286085/148‑1 (MQ=255) ttGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTgcgc < 1:1215583/148‑1 (MQ=255) tGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCt < 1:549115/148‑1 (MQ=255) tGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCt > 2:2312000/1‑148 (MQ=255) gaggaTATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTa > 2:2937544/1‑148 (MQ=255) ggaTATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAAGACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTaaa < 2:1187338/148‑1 (MQ=255) taGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTa > 1:2029694/1‑148 (MQ=255) taGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTa < 2:3472004/148‑1 (MQ=255) taGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTa < 1:2265077/148‑1 (MQ=255) taGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTa < 2:2785717/148‑1 (MQ=255) aGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTAt > 1:2338915/1‑148 (MQ=255) aGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAg < 2:2978316/148‑1 (MQ=255) gCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAgg > 2:2171653/1‑148 (MQ=255) aaaTTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAgggg < 2:574526/148‑1 (MQ=255) aaTTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGa < 2:3230862/148‑1 (MQ=255) ttAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATg > 2:1514720/1‑148 (MQ=255) ttAAAACGGAGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATg < 2:3174422/148‑1 (MQ=255) tAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGa > 2:100630/1‑148 (MQ=255) tAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGa > 2:3381590/1‑148 (MQ=255) tAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGa > 1:1471815/1‑148 (MQ=255) aaCGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACg < 2:2062534/148‑1 (MQ=255) aCGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGt < 2:2474710/148‑1 (MQ=255) cGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGtt > 2:746788/1‑148 (MQ=255) gggTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGtttt < 2:2529514/148‑1 (MQ=255) gggTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGtttt < 1:222950/148‑1 (MQ=255) ggTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTc > 2:114438/1‑148 (MQ=255) gTAAATTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCg < 2:947542/148‑1 (MQ=255) aaaTTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTa < 2:775743/148‑1 (MQ=255) aaTTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTaa > 2:52740/1‑148 (MQ=255) aTTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAAt > 1:911483/1‑148 (MQ=255) aTTTGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAAt > 2:2622445/1‑148 (MQ=255) tttGAACTCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATg < 2:1252187/148‑1 (MQ=255) aaCTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTc > 1:1808846/1‑148 (MQ=255) tCCAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGACATAGTCATAGAATCTTTGGGCTATGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCTGAATGGTTCctc > 2:2431305/1‑148 (MQ=255) cAAATACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCtg < 1:1002074/148‑1 (MQ=255) aaTACCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCtgtt > 2:25147/1‑148 (MQ=255) aCCAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCTgttgtt < 1:774771/148‑1 (MQ=255) ccAGTAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCTGTTGttt < 2:1404987/148‑1 (MQ=255) | TTCTACAGAAAAAACAGTCTGACATACCGAAAAGGATTAAAGGTTATATTCACCAGGCGATTGGTGACGTGTCTTTAGGTTATGCCTTATTGGAGGATATAGTAAGCAAATTAAAACGGGGTAAATTTGAACTCCAAATACCAGGAGGTGGAATTAAAGAATGCGATGGATGGTATATTTACGAAAAAATAATTGATGATAATTTTGCCATAGTCATAGAATCTTTGGGCTTTGCGCTTAAAATCTATGGAGGGGATGAACGTTTTCGTAATGGTTCCTCTGTTGTTT > CP009273/4427948‑4428235 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |