Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,458,254 | T→A | 100% | V271V (GTT→GTA) | mgtA → | magnesium transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,458,254 | 0 | T | A | 99.5% | 686.3 / ‑4.7 | 212 | V271V (GTT→GTA) | mgtA | magnesium transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base A (95/116); total (95/117) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
CTACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTTAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAGCGGCGCTG > CP009273/4458109‑4458398 | cTACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAg > 1:2734421/1‑148 (MQ=255) aCCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTg < 1:1805936/148‑1 (MQ=255) aCCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTg < 1:1668535/148‑1 (MQ=255) aCCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTg > 2:1134202/1‑148 (MQ=255) ccACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGa > 1:2162552/1‑148 (MQ=255) ccACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGa > 1:730743/1‑148 (MQ=255) ccACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGa > 2:426831/1‑148 (MQ=255) cACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTACGTGAg > 1:3414147/1‑148 (MQ=255) aCTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGc > 2:3406535/1‑148 (MQ=255) aCTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGc < 2:2212322/148‑1 (MQ=255) cTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCa < 2:1240396/148‑1 (MQ=255) gCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGa < 2:2971710/148‑1 (MQ=255) cAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGaaa < 2:2753150/148‑1 (MQ=255) cAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGaaa < 2:1413311/148‑1 (MQ=255) cAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGaaa < 1:191769/148‑1 (MQ=255) aGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAg > 1:1607673/1‑148 (MQ=255) ccGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCg < 1:1019461/148‑1 (MQ=255) aGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATg > 2:1260223/1‑148 (MQ=255) gCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGc > 2:1726587/1‑148 (MQ=255) cAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGcc < 1:929912/148‑1 (MQ=255) cAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGcc < 1:1449351/148‑1 (MQ=255) aTCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCtt > 1:1681493/1‑148 (MQ=255) aTCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCtt > 1:3036803/1‑148 (MQ=255) aTCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCtt > 2:854047/1‑148 (MQ=255) tCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCttt > 2:610583/1‑148 (MQ=255) ccGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTc < 2:1021082/148‑1 (MQ=255) cTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGc > 2:3237406/1‑148 (MQ=255) aGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAgg < 1:637141/148‑1 (MQ=255) tGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGa < 1:3012666/148‑1 (MQ=255) gCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGAt < 2:138112/148‑1 (MQ=255) gCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGAt < 2:138079/148‑1 (MQ=255) cacGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGc < 2:232341/148‑1 (MQ=255) tgtgTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGt < 1:2527533/148‑1 (MQ=255) gtgtTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGACAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTc < 1:2280977/148‑1 (MQ=255) gtTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAg > 1:2078811/1‑148 (MQ=255) ttttATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGt > 2:2326164/1‑148 (MQ=255) ttttATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGt < 1:1143072/148‑1 (MQ=255) tttATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTa < 2:3138714/148‑1 (MQ=255) tttATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTa > 2:3492295/1‑148 (MQ=255) accaccGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGa < 2:798446/148‑1 (MQ=255) ccaccGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGAt < 2:392663/148‑1 (MQ=255) ccaccGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGAt < 1:3428996/148‑1 (MQ=255) caccGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGAtt > 2:113186/1‑148 (MQ=255) accGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTc < 1:100465/148‑1 (MQ=255) ccGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCATCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCg > 1:252860/1‑148 (MQ=255) cGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGc < 1:1024689/148‑1 (MQ=255) tggtgAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCtt < 2:2752054/148‑1 (MQ=255) tggtgAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCtt < 1:2698712/148‑1 (MQ=255) gtgAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTa < 1:426877/148‑1 (MQ=255) gAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATg < 2:2845687/148‑1 (MQ=255) gAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATg < 1:2916186/148‑1 (MQ=255) ggcacggcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTgg < 2:1413345/148‑1 (MQ=255) gcacggcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGt > 1:840793/1‑148 (MQ=255) cacggcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTg > 2:2413953/1‑148 (MQ=255) cacggcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTg > 1:1735398/1‑148 (MQ=255) cggcaaAAGCAATGGTGAATGCTACAGGTGCCAATACCTGGATTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGAt > 2:1373722/1‑148 (MQ=255) caAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCAc > 1:2457169/1‑148 (MQ=255) aGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCg > 2:3259111/1‑148 (MQ=255) tGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCggtggt > 2:2560036/1‑148 (MQ=255) ggTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGgtggtg > 2:736760/1‑148 (MQ=255) ggTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGgtggtg > 2:2657699/1‑148 (MQ=255) ggTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGgtggtg > 1:2188/1‑148 (MQ=255) tGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCt > 1:432948/1‑148 (MQ=255) aTTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGt < 2:1328115/148‑1 (MQ=255) ttGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTCTGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGtt > 1:3143169/1‑148 (MQ=255) tACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATc > 2:2871554/1‑148 (MQ=255) aCAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCa < 2:1155792/148‑1 (MQ=255) aCAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCa < 1:1256131/148‑1 (MQ=255) cAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCaa > 2:2746969/1‑148 (MQ=255) tGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGt > 2:917032/1‑148 (MQ=255) tGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGt < 2:882441/148‑1 (MQ=255) gcgaaTTCCTGGTTTGGTAAACTGGCGGTGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGATCCGAATGCCTTTCAGCAAGTGATCAGCCGCGTCAGTATGCTTCTGATTCGCTTTATGCTTTTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGtt < 2:1786011/145‑1 (MQ=255) gCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGtt < 2:1785904/148‑1 (MQ=255) ccAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTa < 1:2752616/148‑1 (MQ=255) cAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTac > 2:3154675/1‑148 (MQ=255) aTACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTacac > 2:2340172/1‑148 (MQ=255) aTACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTacac < 1:1319121/148‑1 (MQ=255) aTACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTacac > 1:1767120/1‑148 (MQ=255) aTACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTacac < 1:186720/148‑1 (MQ=255) tACCTGGGTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTacaca > 2:2105493/1‑147 (MQ=255) aCCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCa > 1:863600/1‑148 (MQ=255) aCCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCa > 2:457383/1‑148 (MQ=255) cTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCaaa < 1:2820693/148‑1 (MQ=255) tGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAg < 2:1007273/148‑1 (MQ=255) tGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAg < 2:1007588/148‑1 (MQ=255) gTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGc > 2:2182705/1‑148 (MQ=255) tttGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCg < 2:3015110/148‑1 (MQ=255) tttGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCg > 2:2713000/1‑148 (MQ=255) tttGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCg < 1:113186/148‑1 (MQ=255) tGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGAc < 1:1613786/148‑1 (MQ=255) tGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGAc < 2:2517487/148‑1 (MQ=255) tCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACtgg < 2:1953993/148‑1 (MQ=255) cAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACtggt > 1:1718501/1‑148 (MQ=255) cAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACtggt > 2:332017/1‑148 (MQ=255) cAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACtggt < 1:3315469/148‑1 (MQ=255) aaCTGGGGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACtggtg < 1:1134202/148‑1 (MQ=255) cTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTggg > 2:501418/1‑148 (MQ=255) tGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGa < 2:3414147/148‑1 (MQ=255) gCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAgcggcg < 2:1768085/148‑1 (MQ=255) tgtAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGACTGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAACGGCGACTGGTGGGAAGCGGCGCTg < 1:1198020/148‑1 (MQ=255) | CTACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTTAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAGCGGCGCTG > CP009273/4458109‑4458398 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |