Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA CP009273 4,465,936 T→A 100% L228* (TTA→TAA)  yjgL → uncharacterized protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP0092734,465,9360TA100.0% 945.9 / NA 283L228* (TTA→TAA) yjgLuncharacterized protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base A (150/133);  total (150/133)
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold.
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand.

Only 100 of 288 total aligned reads displayed.

AAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTT  >  CP009273/4465791‑4466080
                                                                                                                                                 |                                                                                                                                                
aaGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTaaa                                                                                                                                                >  2:1350252/1‑148 (MQ=255)
 aGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTaaaa                                                                                                                                               <  1:1003511/148‑1 (MQ=255)
  gAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAAt                                                                                                                                              >  1:126345/1‑148 (MQ=255)
  gAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAAt                                                                                                                                              >  2:2424666/1‑148 (MQ=255)
    aaaTAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGa                                                                                                                                            <  2:3374537/148‑1 (MQ=255)
        aGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATtct                                                                                                                                        <  1:1969149/148‑1 (MQ=255)
        aGCGAGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATtct                                                                                                                                        <  1:1968945/148‑1 (MQ=255)
         gcgcGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATtctc                                                                                                                                       >  2:3110120/1‑148 (MQ=255)
          cgcgTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCa                                                                                                                                      >  1:2173624/1‑148 (MQ=255)
          cgcgTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCa                                                                                                                                      >  1:376214/1‑148 (MQ=255)
          cgcgTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCa                                                                                                                                      >  1:162837/1‑148 (MQ=255)
          cgcgTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCa                                                                                                                                      <  2:1081673/148‑1 (MQ=255)
            cgTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAgg                                                                                                                                    >  1:2839446/1‑148 (MQ=255)
             gTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGa                                                                                                                                   <  1:1595888/148‑1 (MQ=255)
              tCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAg                                                                                                                                  <  2:1831452/148‑1 (MQ=255)
                tATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGtt                                                                                                                                >  2:2409351/1‑148 (MQ=255)
                  ttAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTaa                                                                                                                              <  2:2987063/148‑1 (MQ=255)
                      ataataatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATaa                                                                                                                          >  2:3239186/1‑148 (MQ=255)
                       taataatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAAc                                                                                                                         >  1:3141679/1‑148 (MQ=255)
                        aataatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACt                                                                                                                        >  2:2298440/1‑148 (MQ=255)
                        aataatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACt                                                                                                                        <  2:2924831/148‑1 (MQ=255)
                        aataatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACt                                                                                                                        <  2:759504/148‑1 (MQ=255)
                             tCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAg                                                                                                                   >  2:3221512/1‑148 (MQ=255)
                             tCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAg                                                                                                                   >  1:1925933/1‑148 (MQ=255)
                             tCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAg                                                                                                                   >  1:333855/1‑148 (MQ=255)
                                ggAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGaa                                                                                                                <  1:3407853/148‑1 (MQ=255)
                                     tAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTaaa                                                                                                           <  1:56309/148‑1 (MQ=255)
                                     tAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTaaa                                                                                                           <  1:327458/148‑1 (MQ=255)
                                     tAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAAAAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTaaa                                                                                                           >  1:647548/1‑148 (MQ=255)
                                        ataatCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAg                                                                                                        >  2:2313268/1‑148 (MQ=255)
                                            tCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCca                                                                                                    >  1:815300/1‑148 (MQ=255)
                                             cTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCcac                                                                                                   <  1:708280/148‑1 (MQ=255)
                                             cTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAATTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCcac                                                                                                   <  1:2929308/148‑1 (MQ=255)
                                                cAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAgg                                                                                                <  2:1140663/148‑1 (MQ=255)
                                                cAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAgg                                                                                                <  1:2996420/148‑1 (MQ=255)
                                                   aaaTTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGt                                                                                             >  1:1553345/1‑148 (MQ=255)
                                                     aTTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTa                                                                                           >  1:2554617/1‑148 (MQ=255)
                                                      ttAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTaa                                                                                          <  1:1314309/148‑1 (MQ=255)
                                                         aataatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATg                                                                                       >  2:698395/1‑148 (MQ=255)
                                                          ataatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGa                                                                                      <  1:468543/148‑1 (MQ=255)
                                                           taatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGATTAAAAAAATACGAAGAATTAAAATTATTCTCAGGAGTTAAATAACTCTCAGCAATTAAATGGTCCACAGGAGTTAAATGAt                                                                                     >  2:869749/1‑148 (MQ=255)
                                                           taatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGAt                                                                                     >  1:1009842/1‑148 (MQ=255)
                                                           taatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGAt                                                                                     <  1:23195/148‑1 (MQ=255)
                                                            aatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATc                                                                                    >  1:2766818/1‑148 (MQ=255)
                                                            aatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATc                                                                                    >  1:112121/1‑148 (MQ=255)
                                                               cTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGc                                                                                 <  2:1873929/148‑1 (MQ=255)
                                                                   aGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGa                                                                             <  2:1714243/148‑1 (MQ=255)
                                                                   aGAACTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGa                                                                             <  2:3283250/148‑1 (MQ=255)
                                                                    gAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAg                                                                            >  1:3377197/1‑148 (MQ=255)
                                                                    gAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAg                                                                            >  1:906708/1‑148 (MQ=255)
                                                                     aaGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGt                                                                           <  1:2355300/148‑1 (MQ=255)
                                                                     aaGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGt                                                                           <  2:414274/148‑1 (MQ=255)
                                                                        ttAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTaa                                                                        <  1:1045215/148‑1 (MQ=255)
                                                                         tAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTaaa                                                                       >  2:2151430/1‑148 (MQ=255)
                                                                         tAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTaaa                                                                       >  2:956521/1‑148 (MQ=255)
                                                                         tAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTaaa                                                                       <  2:182048/148‑1 (MQ=255)
                                                                          aaaTAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAaat                                                                      >  2:2092952/1‑148 (MQ=255)
                                                                              aatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAAtt                                                                  <  1:2064688/148‑1 (MQ=255)
                                                                                tCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATtct                                                                <  1:1493642/148‑1 (MQ=255)
                                                                                 cTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATtctc                                                               <  1:1901718/148‑1 (MQ=255)
                                                                                     tGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGa                                                           >  2:168270/1‑148 (MQ=255)
                                                                                         gTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTa                                                       <  2:3451651/148‑1 (MQ=255)
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                                                                                              ataataTACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATaa                                                  >  1:3372277/1‑148 (MQ=255)
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                                                                                                                               tAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTc                 <  2:274427/148‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                 aataatCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTa               >  2:260484/1‑148 (MQ=255)
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                                                                                                                                    aatCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGa            >  1:2520142/1‑148 (MQ=255)
                                                                                                                                    aatCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGa            >  1:1388640/1‑148 (MQ=255)
                                                                                                                                    aatCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGa            >  1:759119/1‑148 (MQ=255)
                                                                                                                                     atCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGAt           <  2:473828/148‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                        cGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTAc        >  2:1647687/1‑148 (MQ=255)
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                                                                                                                                             aaTTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGtt   <  2:80159/148‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                                 |                                                                                                                                                
AAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTT  >  CP009273/4465791‑4466080

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑