| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 500,234 | C→A | 100% | intergenic (‑82/‑136) | fsr ← / → ushA | putative fosmidomycin efflux system protein/bifunctional UDP‑sugar hydrolase/5'‑nucleotidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 500,234 | 0 | C | A | 96.5% | 603.9 / 11.6 | 200 | intergenic (‑82/‑136) | fsr/ushA | putative fosmidomycin efflux system protein/bifunctional UDP‑sugar hydrolase/5'‑nucleotidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/4); new base A (97/96); total (100/100) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
GTTCGGGCCTTGGTCGTTGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTCGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAATCAGGTCAGGGAGAGAAGTATGAAATTA > CP009273/500088‑500378 | gTTCGGGCCTTGGTCGTTGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGcgtcg < 1:505867/148‑1 (MQ=255) ttCGGGCCTTGGTCGTTGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGcgtagt < 1:201887/148‑1 (MQ=255) tCGGGCCTTGGTCGTTGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCgtcgtc > 2:3448579/1‑148 (MQ=255) tCGGGCCTTGGTCGTTGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCgtagtc > 1:3323415/1‑148 (MQ=255) tCGGGCCTTGGTCGTTGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCgtagtc > 2:816635/1‑148 (MQ=255) ggCCTTGGTCGTTGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTga > 2:1955992/1‑148 (MQ=255) ggCCTTGGTCGTTGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTga > 1:2627310/1‑148 (MQ=255) gCCTTGGTCGTTGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTgaa > 1:913143/1‑148 (MQ=255) cTTGGTCGTTGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTCGTCTgaagg < 2:119956/148‑1 (MQ=255) ttGGTCGTTGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTgaagga < 1:1233709/148‑1 (MQ=255) tGGTCGTTGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTgaaggaa < 1:2211766/148‑1 (MQ=255) tGGTCGTTGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTgaaggaa > 1:2694278/1‑148 (MQ=255) cGTTGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGtct > 2:747443/1‑148 (MQ=255) ttGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCa > 1:3473125/1‑148 (MQ=255) cGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGc > 1:447767/1‑148 (MQ=255) aGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGa < 1:937190/148‑1 (MQ=255) gCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGaa > 1:2825676/1‑148 (MQ=255) gCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGaa < 2:767183/148‑1 (MQ=255) cgcgCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATa < 1:1562599/148‑1 (MQ=255) gcccgccACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAg < 1:2348722/148‑1 (MQ=255) ccACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAAttt < 1:2248914/148‑1 (MQ=255) cacaGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTc < 1:1095493/148‑1 (MQ=255) acaGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCt > 2:557180/1‑148 (MQ=255) caGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTa < 1:3006768/148‑1 (MQ=255) ggggTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTgg < 1:1353526/148‑1 (MQ=255) ggggTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTgg < 1:1351657/148‑1 (MQ=255) ggggTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTgg < 1:529612/148‑1 (MQ=255) gggTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGa > 2:2755034/1‑148 (MQ=255) gttgttCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATg < 2:666258/148‑1 (MQ=255) ttCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGa > 2:2048387/1‑148 (MQ=255) aCTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGAttt > 1:148964/1‑148 (MQ=255) aCTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGAttt < 1:3308961/148‑1 (MQ=255) tCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTAt > 1:2127094/1‑148 (MQ=255) tCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTAt < 2:2173449/148‑1 (MQ=255) aTTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCt < 1:2480490/148‑1 (MQ=255) aTAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCg > 2:2186566/1‑148 (MQ=255) aGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGa < 2:3400634/148‑1 (MQ=255) aGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGa < 2:1661020/148‑1 (MQ=255) aGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGa > 2:1486424/1‑148 (MQ=255) aGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGa > 2:2546796/1‑148 (MQ=255) ggAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGAc > 2:1280467/1‑148 (MQ=255) gAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACg > 2:623660/1‑148 (MQ=255) aaaGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGc > 2:3180708/1‑148 (MQ=255) aaaGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGc > 2:375110/1‑148 (MQ=255) gTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGa > 2:2312140/1‑148 (MQ=255) cACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACt < 2:3293731/148‑1 (MQ=255) cACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACt > 2:146225/1‑148 (MQ=255) aCTTTTTCAGGTTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACtt < 1:2961364/148‑1 (MQ=255) tttttCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGt < 1:1774802/148‑1 (MQ=255) ttttCAGGGTTGCGATGTAAATAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTc < 1:3272936/148‑1 (MQ=255) ttttCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTc > 2:2875184/1‑148 (MQ=255) ttttCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTc < 1:1260089/148‑1 (MQ=255) ttCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTa < 2:2689861/148‑1 (MQ=255) ttCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTa < 2:31129/148‑1 (MQ=255) cAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTatg < 1:943499/148‑1 (MQ=255) cAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTatg < 2:1149499/148‑1 (MQ=255) aGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTatga > 1:577340/1‑148 (MQ=255) gTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGt < 1:2706575/148‑1 (MQ=255) tGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGAAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTcg > 2:2015445/1‑148 (MQ=255) gTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCAt > 1:2442551/1‑148 (MQ=255) gTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCAt > 1:3152819/1‑148 (MQ=255) tAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATa > 1:357539/1‑148 (MQ=255) aaGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACt < 1:664950/148‑1 (MQ=255) aGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTa > 2:162029/1‑148 (MQ=255) aGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTa > 2:439234/1‑148 (MQ=255) aGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTa > 2:248810/1‑148 (MQ=255) gAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTAt < 2:872191/148‑1 (MQ=255) gAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTAt > 1:120586/1‑148 (MQ=255) aaTGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTAtt > 1:1887130/1‑148 (MQ=255) aTGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATTCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGACGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTAAACGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTAgtt > 2:541822/1‑148 (MQ=255) aTGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTAttt > 2:2309913/1‑148 (MQ=255) gATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTAttttt < 2:284542/148‑1 (MQ=255) aTCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTc > 1:2867972/1‑148 (MQ=255) cTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCaa > 1:1977878/1‑148 (MQ=255) ttATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAac < 2:1786499/148‑1 (MQ=255) tATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAaca > 1:824026/1‑148 (MQ=255) tATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAaca < 2:2334202/148‑1 (MQ=255) tttGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACACAAAAACAAAACACCAAGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACg < 1:1610040/148‑1 (MQ=255) ttGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGt > 1:45538/1‑148 (MQ=255) ttGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGt < 1:1341889/148‑1 (MQ=255) tgATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGa < 2:3147704/148‑1 (MQ=255) ttattaCCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAAt < 2:2825676/148‑1 (MQ=255) ttattaCCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAAt < 2:2908998/148‑1 (MQ=255) ttattaCCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAAt < 2:2980974/148‑1 (MQ=255) attaCCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAAtca < 1:2542407/148‑1 (MQ=255) ttaCCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAAtcag < 2:3040482/148‑1 (MQ=255) aCCAGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAAtcaggt < 1:658157/148‑1 (MQ=255) aGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAAtcaggtcag > 1:1016874/1‑148 (MQ=255) aGACTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAAtcaggtcag > 2:1367451/1‑148 (MQ=255) cTAACATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAATCAGGTCAGGga > 1:3182030/1‑148 (MQ=255) aaCATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAATCAGGTCAGGgaga > 1:357833/1‑148 (MQ=255) aaCATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAATCAGGTCAGGgaga > 2:713796/1‑148 (MQ=255) aaCATACCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAATCAGGTCAGGgaga > 2:2593058/1‑148 (MQ=255) aCCTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAATCAGGTCAGGGAGAGAAGt > 2:1796519/1‑148 (MQ=255) ccTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAATCAGGTCAGGGAGAGAAGTa < 2:447767/148‑1 (MQ=255) ccTGTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAATCAGGTCAGGGAGAGAAGTa > 1:251417/1‑148 (MQ=255) gTATGCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAATCAGGTCAGGGAGAGAAGTATGa > 1:3396947/1‑148 (MQ=255) gCGTAGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAATCAGGTCAGGGAGAGAAGTATGAAatt < 1:588608/148‑1 (MQ=255) cgtagtCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAATCAGGTCAGGGAGAGAAGTATGAAatta < 2:150947/148‑1 (MQ=255) cgtagtCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCAACGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAATCAGGTCAGGGAGAGAAGTATGAAatta < 2:1062766/148‑1 (MQ=255) | GTTCGGGCCTTGGTCGTTGACGCAGCCGCGCCCGCCACAGGCTGGGGTTGTTCACTCATTGCCATAGGAAAGTCACTTTTTCAGGGTTGCGATGTAAAGAATGATCTTATTTGTGATTATTACCAGACTAACATACCTGTATGCGTCGTCTGAAGGAAGTCTCAACGCCGAATACAGAATTTCTAATCTGGATGCAGATTTATCTTCACCGGACGCAGACTTGTCTATGATGTCGCGTCATACTATTTTTCAACACGTTGAAATCAGGTCAGGGAGAGAAGTATGAAATTA > CP009273/500088‑500378 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |