| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 619,048 | C→A | 100% | A307S (GCC→TCC) | fepB ← | iron‑enterobactin transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 619,048 | 0 | C | A | 97.2% | 440.7 / 4.1 | 142 | A307S (GCC→TCC) | fepB | iron‑enterobactin transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/2); new base A (66/71); total (68/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
CGGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGCGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAATAGTGACTCGCC > CP009273/618904‑619192 | cGGTTTTGGTTTGTTGATGATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCt < 2:3425149/148‑1 (MQ=255) ttttGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTgta > 1:1655099/1‑148 (MQ=255) tttGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTgtag > 2:1126565/1‑148 (MQ=255) tttGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTgtag > 2:1126746/1‑148 (MQ=255) gTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAAt < 2:1785873/148‑1 (MQ=255) tttGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGCGCTGTAGTAATc > 1:2621844/1‑148 (MQ=255) tttGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCATATCCAGCACAAGCATGGAGCTGTAGTAATc > 2:1774502/1‑148 (MQ=255) tttGTTGATTATCGGCGTGGTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGCGCTGTAGTAATc > 1:2513502/1‑148 (MQ=255) ttgttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATTCTTAAAAAAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATcc > 1:321767/1‑148 (MQ=255) ttgttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATcc > 1:192188/1‑148 (MQ=255) ttgttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATcc > 2:1238399/1‑148 (MQ=255) gttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAg < 1:3444384/148‑1 (MQ=255) gttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAg < 2:1062695/148‑1 (MQ=255) ttgATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGa > 1:532662/1‑148 (MQ=255) ttATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGa > 2:2527989/1‑148 (MQ=255) tCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACg < 1:1822786/148‑1 (MQ=255) cGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGt < 1:1811783/148‑1 (MQ=255) cGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGt < 1:1757699/148‑1 (MQ=255) cGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACACCGCCTTAATCCTATCCACCACTTGCAAGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGt > 1:1084011/1‑148 (MQ=255) cGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGAGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGt < 1:2903862/148‑1 (MQ=255) cGGCGTGGTGTTATTTCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACAATTTCGCCAGACGCCGCCGCACGTGACAGCGTCCGACACTTAATGCTTAAAAAAGCGCCATAAGCCAATACACCACATGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGt > 1:1083927/1‑148 (MQ=255) gCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGtct < 2:797059/148‑1 (MQ=255) gtgtTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCg < 1:1313270/148‑1 (MQ=255) gtgtTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCg < 1:3058781/148‑1 (MQ=255) tgttgtTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCgg < 1:2169233/148‑1 (MQ=255) gttgttATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGt > 1:3258900/1‑148 (MQ=255) ttgttATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGtt > 2:2639795/1‑148 (MQ=255) gttATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTcc < 1:1237156/148‑1 (MQ=255) gttATTGCTGGTGCTGGTGGAGGTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTcc < 2:851896/148‑1 (MQ=255) ttATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTccc < 1:3093684/148‑1 (MQ=255) tATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCa > 1:26530/1‑148 (MQ=255) tATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCa > 1:1205475/1‑148 (MQ=255) ggtgctggtgGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATa > 1:1363067/1‑148 (MQ=255) gtgctggtgGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATaa > 1:46589/1‑148 (MQ=255) gtgctggtgGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATaa < 2:263330/148‑1 (MQ=255) tgctggtgGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATaaa > 1:768017/1‑148 (MQ=255) tgctggtgGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATaaa > 1:8679/1‑148 (MQ=255) ggAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCtt > 1:1150935/1‑148 (MQ=255) gCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTg < 1:2639795/148‑1 (MQ=255) 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aGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGt < 2:2101498/148‑1 (MQ=255) gACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTg < 1:992144/148‑1 (MQ=255) aCGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTgc > 2:2449774/1‑148 (MQ=255) aCGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTgc > 2:2449961/1‑148 (MQ=255) aCGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTgc > 1:3478807/1‑148 (MQ=255) 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ttAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATc < 2:239954/148‑1 (MQ=255) tGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCa > 2:1872618/1‑148 (MQ=255) tGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCa > 2:1808191/1‑148 (MQ=255) gCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCAt > 2:1833636/1‑148 (MQ=255) gCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCAt > 2:2829240/1‑148 (MQ=255) cTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATc < 2:657427/148‑1 (MQ=255) ttAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCt > 1:3042597/1‑148 (MQ=255) ttAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCt > 2:551547/1‑148 (MQ=255) ttAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCt > 1:1295924/1‑148 (MQ=255) aaaaCAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCttt < 2:2825157/148‑1 (MQ=255) aaaaCAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCttt < 2:1072145/148‑1 (MQ=255) aaCAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCt > 1:2486655/1‑148 (MQ=255) aaCAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCt > 1:2012325/1‑148 (MQ=255) gcgcCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATc > 1:349908/1‑148 (MQ=255) cgcCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCa > 2:2960039/1‑148 (MQ=255) ttAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCgg < 1:1238399/148‑1 (MQ=255) aaGCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCg < 2:2360199/148‑1 (MQ=255) gCCTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGaa < 1:1126565/148‑1 (MQ=255) ccTATCCAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAAc < 2:2493643/148‑1 (MQ=255) ccAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGaa < 1:2896702/148‑1 (MQ=255) cAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAAt < 1:2154912/148‑1 (MQ=255) cAGCACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAAt > 1:753216/1‑148 (MQ=255) cACTTGCATGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAATAGt > 1:2858483/1‑148 (MQ=255) aTGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAATAGTGACTCGc < 2:1655099/148‑1 (MQ=255) tGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAATAGTGACTCGcc > 2:3424876/1‑148 (MQ=255) tGGAGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAATAGTGACTCGcc > 2:1655752/1‑148 (MQ=255) | CGGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCTTAAAACAGCGCCTTAAGCCTATCCAGCACTTGCATGGCGCTGTAGTAATCCAGACGGAACGTCTCGGTTCCCAGCGCATAAACCTGCTTGTTTTGTACTGCAGGCAGGTGCGCGAGCAGCGGATTAGCATAAATAGCATCGGCATCTTTCTGATCACCGGCGAACAGGAATAGTGACTCGCC > CP009273/618904‑619192 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |