Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 80,123 | C→T | 100% | G25S (GGC→AGC) | leuL ← | leu operon leader peptide |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 80,123 | 0 | C | T | 99.6% | 705.3 / ‑5.9 | 214 | G25S (GGC→AGC) | leuL | leu operon leader peptide |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (104/108); minor base G (1/0); total (106/108) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
CAATGTGGTATCGAAAATAATGACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCCGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGATATGCTTTTAGAGTTACTGGATACAAAAACGGATGTCAACCCTGA > CP009273/79981‑80264 | cAATGTGGTATCGAAAATAATGACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCa > 1:3382250/1‑148 (MQ=255) cAATGTGGTATCGAAAATAATGACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCa > 1:1815466/1‑148 (MQ=255) ggTATCGAAAATAATGACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTc > 1:451193/1‑148 (MQ=255) tATCGAAAATAATGACTTGCTTGCTCATGGTTTTGGTCATTGTCTCTTTTAGAGCGCCTAGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGATTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTa < 2:1807444/148‑1 (MQ=255) tATCGAAAATAATGACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTa > 1:2442696/1‑148 (MQ=255) tATCGAAAATAATGACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGATTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTa > 1:2626245/1‑148 (MQ=255) aTCGAAAATAATGACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTATTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTAc < 2:3495120/148‑1 (MQ=255) aaaTAATGACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCgcgc > 2:217621/1‑148 (MQ=255) aataatGACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCa > 1:2197877/1‑148 (MQ=255) ataatGACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCaa > 1:3234926/1‑148 (MQ=255) aatGACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAAAGGCGCGGGTTTTTTTTTTGACTGAGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTAACTCGTCTACCGCGCAaag > 1:903942/1‑148 (MQ=255) atGACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCATTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAaaga < 2:263931/148‑1 (MQ=255) gACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAaagaag > 2:1739527/1‑148 (MQ=255) gACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAaagaag > 2:1871638/1‑148 (MQ=255) gACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAaagaag < 2:129645/148‑1 (MQ=255) ttGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATg > 2:2821191/1‑148 (MQ=255) ttGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGGTGGACGGCGTGGGGGGTTAGTGCTGGATGGGGGTCCCTCGGCTCCCGCGCCCAGACGATg > 2:958100/1‑148 (MQ=255) tGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGc > 1:1585896/1‑148 (MQ=255) cTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGt < 1:3047370/148‑1 (MQ=255) gCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTta > 2:1320753/1‑148 (MQ=255) gCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTta > 2:1780315/1‑148 (MQ=255) tCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTtagt < 1:735825/148‑1 (MQ=255) cATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTtagta > 1:3252224/1‑148 (MQ=255) cATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTtagta < 2:984918/148‑1 (MQ=255) tGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTtagtagt > 1:1772820/1‑148 (MQ=255) ggTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTtagtagta > 2:2010271/1‑148 (MQ=255) tGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTtagtagtagtag > 2:3017562/1‑148 (MQ=255) tGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTtagtagtagtag < 1:143610/148‑1 (MQ=255) ggTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGAc < 2:144272/148‑1 (MQ=255) ggTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGAc < 1:2891183/148‑1 (MQ=255) cTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGAt < 1:663572/148‑1 (MQ=255) ttGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATa > 1:260970/1‑148 (MQ=255) tGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATaa > 1:1964652/1‑148 (MQ=255) tGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATaa < 1:2821191/148‑1 (MQ=255) tGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATaa < 2:2565802/148‑1 (MQ=255) tGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGATTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATaa < 1:988079/148‑1 (MQ=255) gTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATaaa > 1:1259660/1‑148 (MQ=255) tttAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAATACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAAc > 2:769764/1‑148 (MQ=255) tttAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAAc > 2:732387/1‑148 (MQ=255) ttAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACg > 1:392946/1‑148 (MQ=255) ttAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACg < 2:1536252/148‑1 (MQ=255) agagCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGAt < 1:1777728/148‑1 (MQ=255) agagCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGAt < 1:1409115/148‑1 (MQ=255) agagCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGAt < 1:2604070/148‑1 (MQ=255) agCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGAtgt > 2:805353/1‑148 (MQ=255) agCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTGTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGAtgt > 2:618077/1‑148 (MQ=255) gcgcCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGAtgtg > 2:1786535/1‑148 (MQ=255) gcCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAg < 2:3048806/148‑1 (MQ=255) ccTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGt < 1:837775/148‑1 (MQ=255) ccTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGt < 2:3019692/148‑1 (MQ=255) cTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTc > 2:2118238/1‑148 (MQ=255) cTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTc < 2:1756123/148‑1 (MQ=255) tCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCa < 1:1884310/148‑1 (MQ=255) cTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCTTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTa > 1:2846354/1‑148 (MQ=255) ttCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTaa > 2:3156899/1‑148 (MQ=255) tCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTaaa > 2:2662908/1‑148 (MQ=255) tCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTaaa < 1:2159455/148‑1 (MQ=255) cGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAAt < 2:2863650/148‑1 (MQ=255) cGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAAt < 2:2362976/148‑1 (MQ=255) gggCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATc < 2:2626300/148‑1 (MQ=255) cATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGc > 1:3075764/1‑148 (MQ=255) tAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTATTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTc < 1:1644352/148‑1 (MQ=255) aaaaCCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGa < 2:572995/148‑1 (MQ=255) aaCCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATg < 2:2749626/148‑1 (MQ=255) 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cAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGat > 2:3432877/1‑148 (MQ=255) cAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGat > 2:791328/1‑148 (MQ=255) aaTGGAGCGGGTTTTTTTTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGata > 2:2593199/1‑148 (MQ=255) ctGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGatat < 1:309806/147‑1 (MQ=255) aTGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGatat > 2:2530075/1‑148 (MQ=255) 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gTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGATATGCTTTTaga < 2:1772820/148‑1 (MQ=255) ttttGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGATATGCTTTTAGAGtt < 1:1876605/148‑1 (MQ=255) tttgtttgACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGATATGCTTTTAGAGTTa < 2:2358561/148‑1 (MQ=255) ttgACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGATATGCTTTTAGAGTTACTGGa > 2:2467442/1‑148 (MQ=255) tgACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGATATGCTTTTAGAGTTACTGGAt < 2:379339/148‑1 (MQ=255) tgACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGATATGCTTTTAGAGTTACTGGAt < 1:609754/148‑1 (MQ=255) tGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGATATGCTTTTAGAGTTACTGGATACaa > 2:482965/1‑148 (MQ=255) cGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGATATGCTTTTAGAGTTACTGGATACaaaa < 2:3382250/148‑1 (MQ=255) cGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGATATGCTTTTAGAGTTACTGGATACaaaa > 2:1385222/1‑148 (MQ=255) gCTGGCTTAATGCTGGATGCTGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGATATGCTTTTAGAGTTACTGGATACAAAAACg > 2:1252626/1‑148 (MQ=255) 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ggATGCAGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGATTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGACATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGATATGCTTATAGAGTTACAGGATACAAAAACGGATGTCAACCCTGa > 2:1703749/1‑148 (MQ=255) | CAATGTGGTATCGAAAATAATGACTTGCTGGCTCATGGTTTGGGTCCTTGTCTCTTTTAGAGCGCCTCGCTTCGGGCATAAAAAAACCCGCGCAATGGCGCGGGTTTTTTGTTTGACTGCGTGCTGGCTTAATGCTGGATGCCGCTCACTCGTCTACCGCGCAAAGAAGATGCGTTTAGTAGTAGTAGACCGATAAAGCGAACGATGTGAGTCATTAAATCAGCTCCAGATGAATGCGATATGCTTTTAGAGTTACTGGATACAAAAACGGATGTCAACCCTGA > CP009273/79981‑80264 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |