Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,181,504 | G→T | 100% | D69Y (GAT→TAT) | pepT → | peptidase T |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,181,504 | 0 | G | T | 99.1% | 739.3 / ‑2.1 | 225 | D69Y (GAT→TAT) | pepT | peptidase T |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base T (110/113); total (112/113) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.47e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
GGTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCGATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGT > CP009273/1181362‑1181648 | gTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATcc < 1:1077628/148‑1 (MQ=255) tGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATccc < 2:669462/148‑1 (MQ=255) ggTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGAtt < 2:2994385/148‑1 (MQ=255) ttCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTgg < 2:750289/148‑1 (MQ=255) ttCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTgg < 2:3444984/148‑1 (MQ=255) tCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGc > 1:427946/1‑148 (MQ=255) tCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGc < 1:75325/148‑1 (MQ=255) cccAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCt > 1:1716019/1‑148 (MQ=255) ccAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCtt > 1:2326831/1‑148 (MQ=255) ccAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCtt < 2:585949/148‑1 (MQ=255) cAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCttt < 2:662276/148‑1 (MQ=255) gCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTAt > 2:1649146/1‑148 (MQ=255) cACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTAtt < 1:205351/148‑1 (MQ=255) aCGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTAttt < 2:237594/148‑1 (MQ=255) cGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTtc > 2:2599825/1‑148 (MQ=255) cGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTtc > 2:2332401/1‑148 (MQ=255) cGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTtc < 2:2210972/148‑1 (MQ=255) cGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTtc > 1:353479/1‑148 (MQ=255) cGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTtc > 2:845124/1‑148 (MQ=255) ggCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCAtg < 1:2222208/148‑1 (MQ=255) aaTGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGa < 1:2979038/148‑1 (MQ=255) tGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATa < 1:1710377/148‑1 (MQ=255) gTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCa < 1:396394/148‑1 (MQ=255) tATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCAcc > 1:549017/1‑148 (MQ=255) tATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCAcc > 1:1748229/1‑148 (MQ=255) tGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGa < 2:3188606/148‑1 (MQ=255) tGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGa < 2:3188883/148‑1 (MQ=255) cATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGAtt < 2:1518327/148‑1 (MQ=255) aTCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTg > 2:332003/1‑148 (MQ=255) ctgctgAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCa > 2:1811581/1‑148 (MQ=255) ctgctgAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCa < 1:2591902/148‑1 (MQ=255) ctgctgAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCa < 1:894613/148‑1 (MQ=255) tgctgAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAg < 1:3301515/148‑1 (MQ=255) gAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGc < 2:1664897/148‑1 (MQ=255) aaaGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCa > 1:3267095/1‑148 (MQ=255) aaGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCaa > 1:1996722/1‑148 (MQ=255) gagCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCaaaa > 1:3180584/1‑148 (MQ=255) gagCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCaaaa < 2:2570367/148‑1 (MQ=255) agcTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAAtgt < 1:3093887/148‑1 (MQ=255) cTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGa > 2:430851/1‑148 (MQ=255) cGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAAt < 2:1518050/148‑1 (MQ=255) aaGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATcc < 1:1125072/148‑1 (MQ=255) agagATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTTCAGCGGCAAAAATGTGAATCCg > 2:1247063/1‑148 (MQ=255) gagaTGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGc > 2:787862/1‑148 (MQ=255) gagaTGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGc > 2:423660/1‑148 (MQ=255) gaTGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCaa < 2:3429441/148‑1 (MQ=255) tGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAAt < 2:2799331/148‑1 (MQ=255) ggCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAAttgt < 1:2989750/148‑1 (MQ=255) tATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGaa > 1:2630174/1‑148 (MQ=255) aTCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCACATTGTTGaaa > 2:3115910/1‑148 (MQ=255) aTCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGaaa > 1:2451334/1‑148 (MQ=255) cAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAAc > 1:1453380/1‑148 (MQ=255) cAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAAc > 1:1453595/1‑148 (MQ=255) aTGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTa > 2:3269992/1‑148 (MQ=255) aTGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTa < 1:2398012/148‑1 (MQ=255) tgtgACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTAt > 2:169020/1‑148 (MQ=255) tgtgACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTAt > 2:423347/1‑148 (MQ=255) ccTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCgg < 1:3485677/148‑1 (MQ=255) ctaaaGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGt > 1:3214807/4‑148 (MQ=255) cTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTTTTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGt > 2:1495209/1‑148 (MQ=255) cTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGt < 2:767225/148‑1 (MQ=255) gTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGa < 1:3358500/148‑1 (MQ=255) gagaAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGata < 1:274256/148‑1 (MQ=255) gagaAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGata < 2:2998415/148‑1 (MQ=255) agaAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGTAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGatat > 1:780367/1‑148 (MQ=255) agaAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGatat < 1:1264303/148‑1 (MQ=255) aaGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTg > 2:729406/1‑148 (MQ=255) gggCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTgcg < 1:1649146/148‑1 (MQ=255) gCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCt > 2:828647/1‑148 (MQ=255) gCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCt > 2:2587941/1‑148 (MQ=255) aCTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTgg < 2:3180584/148‑1 (MQ=255) cTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTggg > 1:1680694/1‑148 (MQ=255) ttGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCGATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTa > 2:247193/1‑148 (MQ=255) gATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATc < 1:2355626/148‑1 (MQ=255) tGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCgg < 2:2024637/148‑1 (MQ=255) tGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCgg > 1:2018149/1‑148 (MQ=255) cGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGa > 2:2393231/1‑148 (MQ=255) cGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGa > 2:1857663/1‑148 (MQ=255) cGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGAGGa > 2:2047384/1‑148 (MQ=255) gTTACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGaa < 2:1398285/148‑1 (MQ=255) ttACCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATAACTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGTAg > 1:192753/1‑148 (MQ=255) aCCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGtt < 1:587454/148‑1 (MQ=255) aCCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATACGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGGGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGtt > 1:1290651/1‑148 (MQ=255) aCCGGCTAACGTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCACACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAAACCGCCAATTTTTGAAAAATATCGCGGGGGCGATATTTCGCTGGGTATCGGCGATGACGtt > 1:2522097/1‑148 (MQ=255) 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gTCCCTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCgg < 2:2842782/148‑1 (MQ=255) cccTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGtt < 1:840825/148‑1 (MQ=255) cccTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGtt < 1:2599825/148‑1 (MQ=255) cccTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGAGGAAGTTTTATCAACGGtg > 1:2812601/1‑147 (MQ=255) cccTGGCTATATCCCGGCGATTGGCTTTAGTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGtt < 2:2677454/148‑1 (MQ=255) 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ggCTATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGAGATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCAACGGTTATGt > 1:2162327/1‑148 (MQ=255) | GGTGAGACAGGTTCCCAGCACGGAAGGCCAATGGAAGTTATTGCATCTGCTGAAAGAGCAGCTCGAAGAGATGGGGCTTATCAATGTGACCTTAAGTGAGAAGGGCACTTTGATGGCGACGTTACCGGCTAACGTCCCTGGCGATATCCCGGCGATTGGCTTTATTTCTCATGTGGATACCTCACCGGATTGCAGCGGCAAAAATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGT > CP009273/1181362‑1181648 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |