| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,261,810 | G→A | 100% | A87A (GCG→GCA) | prmC → | N5‑glutamine methyltransferase, modifies release factors RF‑1 and RF‑2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,261,810 | 0 | G | A | 98.3% | 483.9 / ‑1.4 | 160 | A87A (GCG→GCA) | prmC | N5‑glutamine methyltransferase, modifies release factors RF‑1 and RF‑2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base A (83/73); total (85/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
TTCTCGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAA > CP009273/1261665‑1261954 | ttCTCGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAAc < 1:763725/148‑1 (MQ=255)ttCTCGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAAc < 1:1987596/148‑1 (MQ=255) tctcGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAAcc > 1:535777/1‑148 (MQ=255) tctcGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAAcc > 1:52978/1‑148 (MQ=255) tcGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCtt < 2:2722242/148‑1 (MQ=255) cGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCATa > 1:42074/1‑148 (MQ=255) cTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAAtt < 2:215009/148‑1 (MQ=255) aaaCGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGccc > 2:1702302/1‑148 (MQ=255) aaaCGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGccc < 1:2169807/148‑1 (MQ=255) aCGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCgg < 1:2191308/148‑1 (MQ=255) aCGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCgg < 1:2051745/148‑1 (MQ=255) cAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATa < 2:958224/148‑1 (MQ=255) cAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTACGCGCCCGGATa > 1:2984443/1‑148 (MQ=255) gCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACg > 1:1088894/1‑148 (MQ=255) ctgactgaCGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACgg < 1:997462/148‑1 (MQ=255) gactgacGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAg < 2:1459382/148‑1 (MQ=255) tgacGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAgtgt < 2:181920/148‑1 (MQ=255) tgacGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAgtgt < 1:3433926/148‑1 (MQ=255) tgacGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAgtgt < 2:3506244/148‑1 (MQ=255) acGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCt < 2:286028/148‑1 (MQ=255) gAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCtgg < 1:465151/148‑1 (MQ=255) aaCAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCtggt > 2:2535784/1‑148 (MQ=255) aCAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCtggtg > 1:348561/1‑148 (MQ=255) aTGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAg > 1:1355367/1‑148 (MQ=255) aTGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAg < 2:1767481/148‑1 (MQ=255) aTGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCAATTGCTCATTTAACCGGGTTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCAGAGCCCGGATACGGAGTGTCTGTTGGAg > 2:1140766/1‑148 (MQ=255) tGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGc > 1:3466804/1‑148 (MQ=255) cAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTAGCCAGCAACCATAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAgg > 1:1797010/1‑148 (MQ=255) aCTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTg < 1:3365050/148‑1 (MQ=255) aCTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTACGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGGTGAGCAGGCACTg > 1:2280057/1‑148 (MQ=255) cTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTgg > 2:510240/1‑148 (MQ=255) tGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTTTTTAGCCAGCAACCATAATTAAGCGCCCGGAAACGGAGTGTCTGGGGGTGCACGCACTGgcg > 1:618251/1‑148 (MQ=255) aTGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGcgcg > 2:2051939/1‑148 (MQ=255) tGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCgg < 2:234709/148‑1 (MQ=255) tGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAAACGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCgg < 1:617450/148‑1 (MQ=255) tACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGcc < 2:526662/148‑1 (MQ=255) gaCTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGcc < 2:389823/147‑1 (MQ=255) aCTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCt < 2:1587686/148‑1 (MQ=255) aCTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCt < 2:3327747/148‑1 (MQ=255) tgccacGTCGTCGCGATGGTGAACCCCTTGCTCCTTGACCCGGGGGGCGCGAAGTCGGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAAGTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGa < 2:2629905/145‑1 (MQ=255) tGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGa < 1:226748/148‑1 (MQ=255) cacGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCCACCATAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGaaca > 1:3112211/1‑148 (MQ=255) cacGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTAGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCGGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGGTGCCTGaaca > 1:2719202/1‑148 (MQ=255) acGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGaacaa < 1:2957963/148‑1 (MQ=255) cgtcgtCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGaacaac > 2:3191678/1‑148 (MQ=255) gtcgtcGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAAcc < 1:508092/148‑1 (MQ=255) tcgtcgCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCt < 2:93760/148‑1 (MQ=255) tcgtcgCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCt < 2:93788/148‑1 (MQ=255) cgtcgCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCtt > 1:1776595/1‑148 (MQ=255) cgtcgCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCtt < 2:3078273/148‑1 (MQ=255) gtcgCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTg < 2:24549/148‑1 (MQ=255) gtcgCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTg < 2:21874/148‑1 (MQ=255) gtcgCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTg < 1:2535784/148‑1 (MQ=255) gATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTa < 1:124222/148‑1 (MQ=255) tGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTAtt > 2:1816805/1‑148 (MQ=255) gTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATATGTTTAGACAGCAACCTTAAATCCTCGCCCCGATACGGATTTTCCGGTGGCGCATGCACATGAGCGGTGTCCTGAACAACCATTCCGTATtct > 1:1996027/1‑148 (MQ=255) gAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCg < 1:1669315/148‑1 (MQ=255) gAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCATAATTACGCGCCCGGATACCGAGTGTGGGGTGGAGCCGGCCCAGGCGCGGGTGCCGGAACCACCATGCCGTATTCTCg > 1:84462/1‑148 (MQ=255) aaCCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTAGCCAGCAACCTTAATTACGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGa > 1:2237281/1‑148 (MQ=255) aaCCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTAGCCAGCAAACATAATAACGCGCCCGGATAAGGAGTGTCTGGTGGTGCAGGCACAGGCGCGGTTGGCTGTACAAACATGCCGGATTGTCGa > 1:1211617/1‑148 (MQ=255) aCCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGAt > 2:3042431/1‑148 (MQ=255) aCCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGAt < 1:927960/148‑1 (MQ=255) ccATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGAtct > 1:2266516/1‑148 (MQ=255) tGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCggg > 2:842363/1‑148 (MQ=255) 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ttCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTACGCGCCCGGATACGGAGTGTGTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCGTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGAttgcgcttg > 2:1550777/1‑148 (MQ=255) tCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTgg < 1:3046360/148‑1 (MQ=255) cGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGc < 2:433263/148‑1 (MQ=255) ttGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTa > 1:190389/1‑148 (MQ=255) tGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCAACCATAATTACGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCCCTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATATCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTag > 1:2694012/1‑148 (MQ=255) 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ttGTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCCCTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGccc > 1:147949/1‑148 (MQ=255) gTTTCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCgg < 1:804731/148‑1 (MQ=255) tttCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGa > 1:1003610/1‑148 (MQ=255) tttCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGa < 2:2574968/148‑1 (MQ=255) tttCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGa > 1:2051184/1‑148 (MQ=255) ttCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGAc > 1:2183714/1‑148 (MQ=255) ttCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGAc > 1:3225605/1‑148 (MQ=255) ttCGCCAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGAc > 1:3346555/1‑148 (MQ=255) cAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGa < 1:2342697/148‑1 (MQ=255) cAGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGa > 1:1673874/1‑148 (MQ=255) aGCAACCTTAATTCCGCGCCCGGACACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGaa > 2:1032924/1‑148 (MQ=255) | TTCTCGCCTTTGGTGAAACGCAGCTGACTGACGAACAATGTCAGCAACTTGATGCGCTACTGACACGTCGTCGCGATGGTGAACCCATTGCTCATTTAACCGGGGTGCGAGAATTCTGGTCGTTGCCGTTATTTGTTTCGCCAGCGACCTTAATTCCGCGCCCGGATACGGAGTGTCTGGTGGAGCAGGCACTGGCGCGGTTGCCTGAACAACCTTGCCGTATTCTCGATCTCGGGACGGGTACCGGGGCGATTGCGCTTGCGCTGGCTAGCGAGCGCCCGGACTGCGAA > CP009273/1261665‑1261954 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |