| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,284,857 | G→T | 100% | D53Y (GAT→TAT) | rssA → | putative patatin‑like family phospholipase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,284,857 | 0 | G | T | 98.6% | 657.5 / ‑0.8 | 209 | D53Y (GAT→TAT) | rssA | putative patatin‑like family phospholipase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/3); new base T (113/93); total (113/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.53e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
AAAATAGGGCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCGATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTTCAATCAATACCGCGAAATAATGCCGGAAACAG > CP009273/1284713‑1285001 | aaaTAGGGCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGctatcg < 1:372155/148‑1 (MQ=255) aaaTAGGGCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGctatcg < 1:1368840/148‑1 (MQ=255) aTAGGGCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGctatcgat > 2:1683516/1‑148 (MQ=255) gggCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTAt < 2:1786340/148‑1 (MQ=255) ggCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATc < 2:1853541/148‑1 (MQ=255) ggCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATc > 2:362896/1‑148 (MQ=255) gCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCt > 2:2341386/1‑148 (MQ=255) cTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTg < 2:2407937/148‑1 (MQ=255) ggCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTgcg < 1:405075/148‑1 (MQ=255) gcgcTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTgcgc > 1:1667899/1‑148 (MQ=255) cgAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACctc > 1:2861386/1‑148 (MQ=255) cgAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACctc < 1:1805086/148‑1 (MQ=255) gagaGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACctct < 1:3318579/148‑1 (MQ=255) gagaGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGAGATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACctct < 2:840333/148‑1 (MQ=255) gagGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCttt > 1:2243882/1‑148 (MQ=255) agGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTc > 1:489168/1‑148 (MQ=255) ggTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCa < 2:3009515/148‑1 (MQ=255) tGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGtt > 2:935178/1‑148 (MQ=255) tGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGtt < 2:1580380/148‑1 (MQ=255) 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tatTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGAt > 2:169634/1‑148 (MQ=255) tatTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGAt > 2:798893/1‑148 (MQ=255) ttGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGt > 1:558274/1‑148 (MQ=255) ttGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGt < 1:692622/148‑1 (MQ=255) tGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTTCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGAATATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTAAGTTATTGGGATGtt > 1:2435682/1‑148 (MQ=255) tGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTTGGATGtt > 2:1622541/1‑148 (MQ=255) tGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGtt < 1:2737833/148‑1 (MQ=255) cGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTa < 1:2913080/148‑1 (MQ=255) gTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTAc > 2:1450968/1‑148 (MQ=255) attaATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGcc > 2:2949048/1‑148 (MQ=255) 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taATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTg > 1:1036322/1‑148 (MQ=255) taATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTg > 1:1081921/1‑148 (MQ=255) aaTGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGa < 1:2137293/148‑1 (MQ=255) aaTGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGa < 1:321009/148‑1 (MQ=255) aTGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGAt > 1:2207489/1‑148 (MQ=255) aTGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGAt > 1:118610/1‑148 (MQ=255) aTGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGAt < 1:2990281/148‑1 (MQ=255) aTGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGAt > 1:1170890/1‑148 (MQ=255) gcgcTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATgg < 1:1450484/148‑1 (MQ=255) cgcTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGa < 2:543241/148‑1 (MQ=255) aaaaaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGAtctc > 2:2202071/1‑148 (MQ=255) aaaaaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGAtctc > 2:434951/1‑148 (MQ=255) aaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCt < 1:2823239/148‑1 (MQ=255) tgtgTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCa > 1:3368138/4‑148 (MQ=255) tGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCa > 1:1426438/1‑148 (MQ=255) 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aaTTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTggg > 1:2117061/1‑148 (MQ=255) ttGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGtt > 2:696587/1‑148 (MQ=255) ttGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGtt > 2:1065009/1‑148 (MQ=255) tGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTa < 1:1310564/148‑1 (MQ=255) gATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTAc > 1:2765890/1‑148 (MQ=255) 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aTGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCgt > 2:3484833/1‑148 (MQ=255) gTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCgtgt < 2:1852381/148‑1 (MQ=255) gTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCgtgt > 2:3226897/1‑148 (MQ=255) ttCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTc < 1:698316/148‑1 (MQ=255) aTTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtca > 1:2425360/1‑148 (MQ=255) aTTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtca > 1:2425566/1‑148 (MQ=255) ttGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACTCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa > 2:191253/1‑148 (MQ=255) gTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaatca < 2:2826779/148‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGa > 2:757036/1‑132 (MQ=255) cGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTTCAATCAATa < 2:1488295/148‑1 (MQ=255) 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tggGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTTCAATCAATACCGCGa < 2:1176552/148‑1 (MQ=255) gggCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTTCAATCAATACCGCGaa < 1:3229957/148‑1 (MQ=255) ggCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTTCAATCAATACCGCGaaa < 2:1023158/148‑1 (MQ=255) gcTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTTCAATCAATACCGCGAaataa < 1:1011586/148‑1 (MQ=255) tGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTTCAATCAATACCGCGAAATAATg < 2:2016175/148‑1 (MQ=255) 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catgcTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTTCAATCAATACCGCGAAATAATGCCGGAAAc < 1:798893/148‑1 (MQ=255) | AAAATAGGGCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCGATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTTCAATCAATACCGCGAAATAATGCCGGAAACAG > CP009273/1284713‑1285001 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |