Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,296,729 | C→A | 100% | H431N (CAC→AAC) | oppA → | oligopeptide transporter subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,296,729 | 0 | C | A | 97.8% | 704.0 / 5.6 | 222 | H431N (CAC→AAC) | oppA | oligopeptide transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/3); new base A (116/101); total (118/104) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
CAAACCGTTGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTCACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCGAACAGCTCGATGAATACCGCGCATTATAAGAGCCCGGCCTTTGACAGCATTATGGCGGAAA > CP009273/1296584‑1296873 | cAAACCGTTGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAAc > 2:3297257/1‑148 (MQ=255) aaaCCGTTGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAAcc > 2:1028141/1‑148 (MQ=255) aCCGTTGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAg > 2:3051303/1‑148 (MQ=255) ccGTTGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAgg < 2:1347269/148‑1 (MQ=255) gTTGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGt < 1:2336536/148‑1 (MQ=255) aCCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACtt > 1:2997361/1‑148 (MQ=255) aCCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACtt > 1:2995720/1‑148 (MQ=255) aTCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTg < 2:1414713/148‑1 (MQ=255) cAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGAt > 1:3155862/1‑148 (MQ=255) cAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGAt > 1:1060970/1‑148 (MQ=255) aaCCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGAtg > 1:1834657/1‑148 (MQ=255) ccTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGAtgtg > 1:1723399/1‑148 (MQ=255) ccTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGAtgtg > 2:1050806/1‑148 (MQ=255) ccTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGAtgtg > 1:3460257/1‑148 (MQ=255) gttgtATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGcc > 2:2927345/1‑148 (MQ=255) gttgtATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGcc > 2:1363725/1‑148 (MQ=255) tataACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGGAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTg > 2:1686441/1‑148 (MQ=255) tataACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTg < 2:391974/148‑1 (MQ=255) tataACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTg < 1:453789/148‑1 (MQ=255) taACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCa < 2:1496807/148‑1 (MQ=255) aaCACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAg > 1:2786332/1‑148 (MQ=255) acacCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAgg > 2:2541051/1‑148 (MQ=255) acacCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAgg > 1:1117154/1‑148 (MQ=255) cacCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGc < 2:3441784/148‑1 (MQ=255) cacCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGc < 1:1413572/148‑1 (MQ=255) acCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCt < 1:1990318/148‑1 (MQ=255) tCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGgt > 2:2149951/1‑148 (MQ=255) tCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGgt > 1:317669/1‑148 (MQ=255) ccGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGgtg < 1:3072111/148‑1 (MQ=255) gATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGtgtg < 1:1278138/148‑1 (MQ=255) cTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTCCTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTg > 2:3284135/1‑148 (MQ=255) gCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTCACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGAc > 2:3220412/1‑148 (MQ=255) gCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGAc > 1:2865643/1‑148 (MQ=255) gCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGAc > 1:1107189/1‑148 (MQ=255) cATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACt > 1:1795658/1‑148 (MQ=255) tAAAAAGCTGGCGAGTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTAc < 2:415547/148‑1 (MQ=255) aaaaaGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACa < 1:168040/148‑1 (MQ=255) aaGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACg > 1:792160/1‑148 (MQ=255) aGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGa < 1:1594789/148‑1 (MQ=255) aGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGa < 1:1660400/148‑1 (MQ=255) gCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGaa < 2:15446/148‑1 (MQ=255) aTTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAActt > 2:367289/1‑148 (MQ=255) tgcCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAActtccttc < 2:1480692/148‑1 (MQ=255) tctTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGa < 1:632872/148‑1 (MQ=255) ctTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGaa < 2:3501514/148‑1 (MQ=255) tCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTCACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAaca < 2:229432/148‑1 (MQ=255) aTTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACAcc < 1:371437/148‑1 (MQ=255) aTTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACAcc > 1:934735/1‑148 (MQ=255) tgtgGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCAt > 2:24739/1‑148 (MQ=255) tgGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGc > 1:1932511/1‑148 (MQ=255) tgGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGc < 1:613130/148‑1 (MQ=255) tgGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGc < 1:3425106/148‑1 (MQ=255) tgGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGc > 1:3415751/1‑148 (MQ=255) tgGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGc < 1:2202627/148‑1 (MQ=255) ggAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTCACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCt > 2:3358646/1‑148 (MQ=255) gaagaaAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCtt > 2:924595/1‑148 (MQ=255) gaagaaAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCtt > 1:2448289/1‑148 (MQ=255) gaaAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCg > 1:2121783/1‑148 (MQ=255) aaaaCATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCGaa < 1:392101/148‑1 (MQ=255) aaaaCATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGGTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCGaa < 1:3506281/148‑1 (MQ=255) cATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCGAACAGc > 2:2234390/1‑148 (MQ=255) aTTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCGAACAGCt < 1:2621025/148‑1 (MQ=255) aTTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCGAACAGCt > 2:2395308/1‑148 (MQ=255) tgtAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCGAACAGCTCGATg > 2:1813083/1‑148 (MQ=255) 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cGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCGAACAGCTCGATGAATACCGCGCATTATAAGAGCCCGGCCTTTGACAGCATTATGGCGGaaa < 2:1208911/148‑1 (MQ=255) | CAAACCGTTGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTCACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCGAACAGCTCGATGAATACCGCGCATTATAAGAGCCCGGCCTTTGACAGCATTATGGCGGAAA > CP009273/1296584‑1296873 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |