| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,389,852 | G→T | 100% | R110S (CGC→AGC) | ynaI ← | mechanosensitive channel protein, very small conductance |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,389,852 | 0 | G | T | 98.3% | 726.7 / 2.9 | 233 | R110S (CGC→AGC) | ynaI | mechanosensitive channel protein, very small conductance |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/1); new base T (116/113); total (119/114) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.36e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
ATACCGACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCGACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAGTTTTCTATAACATAATT > CP009273/1389707‑1389996 | aTACCGACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTAc < 1:386879/148‑1 (MQ=255) aCCGACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCt > 2:193403/1‑148 (MQ=255) gACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCtttt > 1:1718284/1‑148 (MQ=255) aCAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCttttt < 1:258519/148‑1 (MQ=255) aCAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCttttt > 1:444691/1‑148 (MQ=255) cAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCtttttt > 2:1898186/1‑148 (MQ=255) aGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTa < 2:209643/148‑1 (MQ=255) gCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTaa < 2:1861383/148‑1 (MQ=255) ccAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAAt < 1:2805614/148‑1 (MQ=255) ccAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAAt < 1:3205373/148‑1 (MQ=255) accaccAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATctgc < 2:653423/148‑1 (MQ=255) accaccAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATctgc > 1:613503/1‑148 (MQ=255) ccaATACCACCAAAGGTCAGCACGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGtt < 2:3325644/148‑1 (MQ=255) caATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGttt < 1:3478257/148‑1 (MQ=255) ccaccaAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCaa < 2:959897/148‑1 (MQ=255) ccaccaAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCaa > 2:1177532/1‑148 (MQ=255) ccaccaAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCaa < 1:1183842/148‑1 (MQ=255) ccaccaAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCaa < 1:1181800/148‑1 (MQ=255) ccaccaAAGGTCAGCAAGCCAGAAACGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCaa < 2:3442825/148‑1 (MQ=255) ccaAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACt > 1:301961/1‑148 (MQ=255) aaaGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGa < 1:260759/148‑1 (MQ=255) aaGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGAt > 1:3212521/1‑148 (MQ=255) aaGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGAt > 1:1441160/1‑148 (MQ=255) aGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGAtt > 2:819060/1‑148 (MQ=255) ggTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTa > 2:3505883/1‑148 (MQ=255) ggTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTa > 2:736750/1‑148 (MQ=255) ggTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAAATGATTa > 2:2499279/1‑148 (MQ=255) gTCAGCAAGCCAGAAGGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTaa < 1:2174321/148‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATc < 2:1515065/148‑1 (MQ=255) cAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATc < 2:2871893/148‑1 (MQ=255) cAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATcagc > 1:801877/1‑148 (MQ=255) cAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATcagc > 1:1359934/1‑148 (MQ=255) aGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAAt > 1:893405/1‑148 (MQ=255) gAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATa < 2:3075930/148‑1 (MQ=255) aaaGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAg > 1:696319/1‑148 (MQ=255) aaaGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAg > 1:1258703/1‑148 (MQ=255) aaaGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAg > 1:1717969/1‑148 (MQ=255) agccTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCt > 2:2989527/4‑148 (MQ=255) aGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCt > 2:550301/1‑148 (MQ=255) ggCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCtt < 2:263085/148‑1 (MQ=255) ggCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCtt < 2:262536/148‑1 (MQ=255) gCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTa < 2:1815701/148‑1 (MQ=255) ccGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCa > 1:2471219/1‑148 (MQ=255) cGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAg > 1:942428/1‑148 (MQ=255) gAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGa > 1:2031952/1‑148 (MQ=255) aaaTGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGaa > 1:910988/1‑148 (MQ=255) aaTGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAAt > 1:2539628/1‑148 (MQ=255) gTTCGCCATAACGCAGAACAAGCACCACAATACTGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTACTCGTCAGAATAAc < 2:1062539/148‑1 (MQ=255) ttCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAAcc > 1:2933471/1‑148 (MQ=255) ttCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAAcc > 1:1010198/1‑148 (MQ=255) ccATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCaa > 1:3335906/1‑148 (MQ=255) aTAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATc > 1:151361/1‑148 (MQ=255) aaGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAgg > 1:1869686/1‑148 (MQ=255) gCAGAACAAGCACCACACTACTGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGa < 2:1028632/148‑1 (MQ=255) gCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGa > 1:1179807/1‑148 (MQ=255) cAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGAc > 2:1807153/1‑148 (MQ=255) cAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGAc > 1:1034596/1‑148 (MQ=255) aGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACg < 1:1167322/148‑1 (MQ=255) aGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACg < 1:3399438/148‑1 (MQ=255) cAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACa > 1:2009222/1‑148 (MQ=255) aaGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCCCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAg > 2:141259/1‑148 (MQ=255) aGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGa > 2:2822638/1‑148 (MQ=255) gCACCACTATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCGACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGAt > 2:1293190/1‑148 (MQ=255) gCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGAt > 2:2559897/1‑148 (MQ=255) gCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGAt > 2:3392436/1‑148 (MQ=255) caccacAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATa > 1:632007/1‑148 (MQ=255) cacaATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATaaaa < 2:511108/148‑1 (MQ=255) aataatGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTTAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCg < 2:2339508/148‑1 (MQ=255) aataatGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCg < 2:24118/148‑1 (MQ=255) aatGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATa < 1:1679994/148‑1 (MQ=255) aatGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATa < 2:1319860/148‑1 (MQ=255) atGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATaa > 2:463641/1‑148 (MQ=255) tGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAAc > 2:266776/1‑148 (MQ=255) tGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGcc > 1:876966/1‑148 (MQ=255) tGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGcc < 1:2679175/148‑1 (MQ=255) gATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCt < 1:771323/148‑1 (MQ=255) gATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCt < 2:914857/148‑1 (MQ=255) tttGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCAATAACGCCTggg < 2:444691/148‑1 (MQ=255) ttGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTgggg > 1:1201960/1‑148 (MQ=255) atACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATaa < 1:3149215/148‑1 (MQ=255) atACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCGACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATaa > 1:3109523/1‑148 (MQ=255) tACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATaaa < 2:784727/148‑1 (MQ=255) tACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATaaa < 2:3284849/148‑1 (MQ=255) cgACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTg > 1:2277057/1‑148 (MQ=255) cATAATCCGCGCACTGGTGATTTCGTTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTTATCAGCTGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCTGGGACGTACAGATAAAATCGTTAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGt < 2:3046411/148‑1 (MQ=255) cATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGt > 1:2965546/1‑148 (MQ=255) tAATCCGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGttt > 2:19840/1‑148 (MQ=255) aTCCGCGCACTGGTGATATCGCGACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTtat < 2:3171099/148‑1 (MQ=255) tCCGCGCACTGGTGAAATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTtata > 1:2047949/1‑148 (MQ=255) ccGCGCACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATAAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAg > 2:2959185/1‑148 (MQ=255) cgcgCACGGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAGt < 1:509737/148‑1 (MQ=255) cACTGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAGTTTTc < 2:62557/148‑1 (MQ=255) tGGTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAGTTTTCtat < 2:2463520/148‑1 (MQ=255) ggTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAGTTTTCtata < 2:2277057/148‑1 (MQ=255) gTGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTTTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAGTTTTCTATaa < 1:1797162/148‑1 (MQ=255) tGATATCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACTCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATTGTTTTCTATAAc > 2:1483046/1‑148 (MQ=255) atatCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAGTTTTCTATAACAt < 1:1917721/148‑1 (MQ=255) tatCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCTTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTAGAGTTTATAGTTTTCTATAACAta > 1:2340795/1‑148 (MQ=255) atCGCTACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAGTTTTCTATAACAtaa < 2:3235497/148‑1 (MQ=255) cgctACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAGTTTTCTATAACAtaatt < 2:632007/148‑1 (MQ=255) | ATACCGACAGCCAGACCACCAATACCACCAAAGGTCAGCAAGCCAGAAAGGCTCATGCCGAAATGTTCGCCATAAAGCAGAACAAGCACCACAATAATGGTGATTTTGATGATACGCGACATAATCCGCGCACTGGTGATATCGCGACCTTTTTTAATCTGCTGTTTTTCAAACTGATTAATCAGCAGAAATAGCTTAATCGTCAGAATAACCGCAATCAGGGACGTACAGATAAAATCGATAACGCCTGGGGTGATAAATTTGAGTTTATAGTTTTCTATAACATAATT > CP009273/1389707‑1389996 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |