Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,482,005 | G→T | 100% | D172Y (GAT→TAT) | ydcF → | DUF218 superfamily protein, SAM‑binding |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,482,005 | 0 | G | T | 99.5% | 686.3 / ‑4.1 | 209 | D172Y (GAT→TAT) | ydcF | DUF218 superfamily protein, SAM‑binding |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (96/112); total (96/113) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
ACAAACTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCGATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTAC > CP009273/1481861‑1482149 | acaaACTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATg > 1:2273219/1‑148 (MQ=255) caaACTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGc > 1:2867017/1‑148 (MQ=255) aaCTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGcac > 2:782783/1‑148 (MQ=255) gCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACg < 1:995203/148‑1 (MQ=255) gTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTg > 1:3038494/1‑148 (MQ=255) gAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGt > 2:2636510/1‑148 (MQ=255) gAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGt > 2:1403759/1‑148 (MQ=255) aaaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTa > 2:427027/1‑148 (MQ=255) aaaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTa > 2:2194322/1‑148 (MQ=255) aaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTaa > 2:2409547/1‑148 (MQ=255) aaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTaa > 2:3002661/1‑148 (MQ=255) aaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTaa > 2:2738111/1‑148 (MQ=255) acgcacgcTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAg < 1:743808/148‑1 (MQ=255) cacgcTTTATCATCGCGCTATTGAATCAGTCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCTGTGTTCAGGACCACACAATGCAGCGGCGCACGAAGGCGACGTTCCGCCGTATGACTTGGGACAATCAATATTCACCACGCTGGTTAAGTTa > 2:1099464/1‑148 (MQ=255) gcTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATcc < 2:3154737/148‑1 (MQ=255) ttAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCgg > 1:2368649/1‑148 (MQ=255) tAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGa > 2:2117859/1‑148 (MQ=255) gCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGAtt < 1:1660470/148‑1 (MQ=255) tCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGt > 2:1496702/1‑148 (MQ=255) cgcgCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGtt < 2:1284985/148‑1 (MQ=255) gcgcTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTc < 2:1635880/148‑1 (MQ=255) tATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCa < 2:2003048/148‑1 (MQ=255) tGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGtt < 1:910974/148‑1 (MQ=255) tGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGGTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGtt > 1:1999401/1‑148 (MQ=255) tCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAGTCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGa > 2:2120560/1‑148 (MQ=255) cAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGATGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGaa < 1:895615/148‑1 (MQ=255) aGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGaaa < 1:2204675/148‑1 (MQ=255) ggCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAAt < 2:2943809/148‑1 (MQ=255) gCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATa < 1:1840936/148‑1 (MQ=255) gCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATa < 2:1956385/148‑1 (MQ=255) gCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTAGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATa > 2:847827/1‑148 (MQ=255) gTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCNTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACg > 1:1785461/1‑148 (MQ=255) tAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGc < 2:3311958/148‑1 (MQ=255) aGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCa < 1:61351/148‑1 (MQ=255) gAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAg < 2:2192611/148‑1 (MQ=255) aaCGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGa > 2:530378/1‑148 (MQ=255) aCGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGAc > 1:2148369/1‑148 (MQ=255) cGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACa > 2:1885895/1‑148 (MQ=255) gAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAg < 1:299261/148‑1 (MQ=255) aGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAgt < 2:1946744/148‑1 (MQ=255) aGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAgt > 2:1688854/1‑148 (MQ=255) tCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTa < 1:3474693/148‑1 (MQ=255) tCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTa < 1:3086953/148‑1 (MQ=255) aCGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCt > 1:1188573/1‑148 (MQ=255) aCGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCt < 2:1700165/148‑1 (MQ=255) aCGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCt > 1:1616391/1‑148 (MQ=255) ggCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCttt < 1:2664609/148‑1 (MQ=255) tATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTttatt > 2:1846495/1‑148 (MQ=255) tCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTaa < 2:390387/148‑1 (MQ=255) ttgttCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCa > 1:1053690/1‑148 (MQ=255) tgttCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAg < 2:2132272/148‑1 (MQ=255) gttCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGt < 2:1976089/148‑1 (MQ=255) gttCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGt < 1:3253800/148‑1 (MQ=255) ttCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGtt < 2:1345868/148‑1 (MQ=255) ttCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGtt < 1:3180289/148‑1 (MQ=255) tctggACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTa < 2:1338653/145‑1 (MQ=255) tCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTa < 2:3085428/148‑1 (MQ=255) tCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTa > 1:2238297/1‑148 (MQ=255) tCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTa > 1:3283874/1‑148 (MQ=255) aGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACa < 1:2441567/148‑1 (MQ=255) aGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACa < 2:2371833/148‑1 (MQ=255) ggACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACaa < 2:2258789/148‑1 (MQ=255) aCCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAgg > 2:610213/1‑148 (MQ=255) ccccACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGa < 1:458320/148‑1 (MQ=255) ccaccaTGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGAtt < 1:3298865/148‑1 (MQ=255) accaTGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTAt > 2:1465959/1‑148 (MQ=255) accaTGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTAt < 2:2427540/148‑1 (MQ=255) caTGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGAAGACAGTGTAATATTTATTAATCAGTTACAAGGAGTATgg > 1:969717/1‑148 (MQ=255) aTGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGc > 2:2587298/1‑148 (MQ=255) aTGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCGATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGc < 1:356753/148‑1 (MQ=255) gCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCa > 2:2672681/1‑148 (MQ=255) gCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGGTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCa < 2:3388123/148‑1 (MQ=255) aGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGCCAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGt < 2:1925545/148‑1 (MQ=255) gcggcgCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGtt < 2:557047/148‑1 (MQ=255) gcgcACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAg < 1:2869273/148‑1 (MQ=255) gcACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCg < 1:1367285/148‑1 (MQ=255) gcACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCg < 1:797294/148‑1 (MQ=255) cACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGt > 2:2769515/1‑148 (MQ=255) aCGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGtt < 1:3385782/148‑1 (MQ=255) cGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTa < 1:575600/148‑1 (MQ=255) cGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTa < 1:2117859/148‑1 (MQ=255) cGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTa < 1:2741800/148‑1 (MQ=255) cGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTa < 1:1275621/148‑1 (MQ=255) tGGCGACGGTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTAtct < 1:2355110/148‑1 (MQ=255) gCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTAtctct < 2:2788296/148‑1 (MQ=255) cGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTAtctctc < 1:1470118/148‑1 (MQ=255) ttCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCactac > 2:3070629/1‑148 (MQ=255) cgccgTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGTATTATGGCAAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCa > 1:3184849/1‑148 (MQ=255) cgccgTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCa < 2:2867017/148‑1 (MQ=255) ccgTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACt > 2:1780585/1‑148 (MQ=255) ccgTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACt > 2:2921152/1‑148 (MQ=255) cgTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTg > 1:1289271/1‑148 (MQ=255) tGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGa > 1:1712699/1‑148 (MQ=255) tGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGa > 1:3058217/1‑148 (MQ=255) gACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAg < 2:1559369/148‑1 (MQ=255) aCTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGc > 1:2095045/1‑148 (MQ=255) aCTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGc < 1:1292319/148‑1 (MQ=255) aCTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGc > 1:2094828/1‑148 (MQ=255) aaTCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATACCGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGtt < 2:74370/148‑1 (MQ=255) tCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTa > 2:922862/1‑148 (MQ=255) | ACAAACTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCGATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTAC > CP009273/1481861‑1482149 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |