| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,540,399 | A→G | 100% | intergenic (‑114/+146) | yddL ← / ← yddG | putative lipoprotein;putative membrane; Not classified; putative outer membrane porin protein/aromatic amino acid exporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,540,399 | 0 | A | G | 98.6% | 847.8 / ‑0.7 | 217 | intergenic (‑114/+146) | yddL/yddG | putative lipoprotein;putative membrane; Not classified; putative outer membrane porin protein/aromatic amino acid exporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base G (95/117); total (98/119) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.02e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
GTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAT > CP009273/1540254‑1540543 | gTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGgaa > 1:1056433/1‑148 (MQ=255) tACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGgaaaa > 2:2504636/1‑148 (MQ=255) aCAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAAt < 2:1588911/148‑1 (MQ=255) cAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATa > 1:1021672/1‑148 (MQ=255) cAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATa > 1:2624811/1‑148 (MQ=255) aaCCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAg < 1:1881020/148‑1 (MQ=255) ccaccGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGAt > 1:2318700/1‑148 (MQ=255) ccaccGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGAt < 2:2430409/148‑1 (MQ=255) accGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAACATAGATGa > 2:2671475/1‑148 (MQ=255) ccGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGaa > 1:1721152/1‑148 (MQ=255) gCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACTAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAaat < 2:1541960/148‑1 (MQ=255) aCTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAaataat < 1:626231/148‑1 (MQ=255) cTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAataata < 1:747531/148‑1 (MQ=255) aTTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAAtatt > 2:1977675/1‑148 (MQ=255) tttttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAAtatta < 1:78624/148‑1 (MQ=255) tttttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAAtatta < 1:3265818/148‑1 (MQ=255) tttttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAAtatta < 1:2135059/148‑1 (MQ=255) tttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATattatt < 1:2411476/148‑1 (MQ=255) ttAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATAttattt < 2:85986/148‑1 (MQ=255) tAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATAttattta < 2:1155295/148‑1 (MQ=255) tAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATAttattta < 2:1050928/148‑1 (MQ=255) aTTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATc < 2:2892202/148‑1 (MQ=255) tCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGat < 1:431404/148‑1 (MQ=255) tttAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATAtg > 1:2300722/1‑148 (MQ=255) tAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATAtgtg < 1:3450092/148‑1 (MQ=255) cAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATc < 1:708002/148‑1 (MQ=255) gAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGa > 2:823399/1‑148 (MQ=255) aaTCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGaa < 1:2035241/148‑1 (MQ=255) aaTCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGaa < 1:855891/148‑1 (MQ=255) aTCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAg < 1:3489924/148‑1 (MQ=255) gccTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGt < 2:835731/147‑1 (MQ=255) ccTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTc > 2:1783565/1‑148 (MQ=255) ttAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGaaa > 1:2233222/1‑148 (MQ=255) tCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGata > 2:1695157/1‑148 (MQ=255) gTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGAtata < 1:2550198/148‑1 (MQ=255) gTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGAtata < 1:3160089/148‑1 (MQ=255) tAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAg > 2:3161992/1‑148 (MQ=255) aaaCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAgg > 1:3243679/1‑148 (MQ=255) aaCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGt > 2:416801/1‑148 (MQ=255) aCGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTg > 1:1153526/1‑148 (MQ=255) gTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGaa < 1:1226134/148‑1 (MQ=255) tATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAAt > 1:434388/1‑148 (MQ=255) ttttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTa < 2:762109/148‑1 (MQ=255) ttttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTa < 2:3309746/148‑1 (MQ=255) ttttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTa < 1:676752/148‑1 (MQ=255) tttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGTAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTAc > 2:2268194/1‑148 (MQ=255) tttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTAc > 2:806714/1‑148 (MQ=255) tttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTAc > 1:2809108/1‑148 (MQ=255) tttCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTAc < 1:3408206/148‑1 (MQ=255) tCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTg < 2:545315/148‑1 (MQ=255) aaaCGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTa > 1:3112914/1‑148 (MQ=255) aCGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTAtt > 2:3066067/1‑148 (MQ=255) ttttAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGaaa < 1:3007334/148‑1 (MQ=255) aCGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAatttatt < 2:2318700/148‑1 (MQ=255) aCGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAatttatt > 1:320334/1‑148 (MQ=255) aCGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAatttatt < 1:1394935/148‑1 (MQ=255) cGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAatttattt > 2:787709/1‑148 (MQ=255) cGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTAtttttt < 1:1685962/148‑1 (MQ=255) gTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTAttttttt > 2:675453/1‑148 (MQ=255) tCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTa > 1:2970864/1‑148 (MQ=255) cATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTaa < 1:1599481/148‑1 (MQ=255) cATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTaa > 1:2506023/1‑148 (MQ=255) tttATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAata < 1:1180824/148‑1 (MQ=255) tttATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAata > 2:1394049/1‑148 (MQ=255) ttATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAatat < 2:473916/148‑1 (MQ=255) tataAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATAtt < 1:113473/148‑1 (MQ=255) taAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGt < 2:2848316/148‑1 (MQ=255) taAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGt < 1:1278491/148‑1 (MQ=255) aTGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAGGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATCTTGTCgg > 2:1905119/1‑148 (MQ=255) tGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGa < 2:3399039/148‑1 (MQ=255) aCATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAAt < 1:788315/148‑1 (MQ=255) aCATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAAAAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAAt < 2:2062182/148‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATAATATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATTTGATATAAGGTGAATTACTGGTCTTTGAAATTTATTTTGTTAATATTGTCGGACTTTAt > 2:1733758/1‑148 (MQ=255) aCTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTAt < 2:439768/148‑1 (MQ=255) cTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATc > 2:1023068/1‑148 (MQ=255) tttAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGAtt > 2:1444130/1‑148 (MQ=255) ttAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTa > 1:90996/1‑148 (MQ=255) tAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTaa > 1:3050080/1‑148 (MQ=255) aaaaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGGTGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAAc < 2:275596/148‑1 (MQ=255) aaaaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAAc < 2:1270123/148‑1 (MQ=255) aaaaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAAc < 1:2148308/148‑1 (MQ=255) aaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTa > 1:495020/1‑148 (MQ=255) aaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTa > 2:2532500/1‑148 (MQ=255) aaTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTa > 1:3027704/1‑148 (MQ=255) aTAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATCATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCTGAATTTATCTGATTAACTAc > 2:2605048/1‑148 (MQ=255) aGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCg < 1:136078/148‑1 (MQ=255) aGAATGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCg < 1:549322/148‑1 (MQ=255) aGAATGGAGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCg < 1:1912507/148‑1 (MQ=255) aaTGGTGATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCggg > 1:950564/1‑148 (MQ=255) tGGTGATTAAAAACAATGCCGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCTATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGcc < 2:2165612/148‑1 (MQ=255) gATTAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAg > 1:3376067/1‑148 (MQ=255) ttAAAAACAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGAc > 2:1278435/1‑148 (MQ=255) aaaCAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCgg > 2:1913711/1‑148 (MQ=255) aaCAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGANTTACTGGGATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGc > 1:1785544/1‑148 (MQ=255) aCAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCa > 2:1067654/1‑148 (MQ=255) cAATGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAg > 1:3324292/1‑148 (MQ=255) aTGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGtt > 2:357576/1‑148 (MQ=255) aTGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGtt < 1:759624/148‑1 (MQ=255) aTGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGtt > 1:3376650/1‑148 (MQ=255) tGAGGAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTa > 1:149068/1‑148 (MQ=255) | GTTACAACCACCGCAACTATTTTTAATTTCATTTAACAGAATCCTTTTAATTATCGTTAAACGTATTTTCTAAACGAATTTTAAACGGCGTCATTTATAAATGACATACTGTTTTTAAAATAGAATGGTGATTAAAAACAATGAGAAAAATAGATGAAATAATATTATTTATCGATATGTGATCGAAGTCGAAATGAGATATAAGGTGAATTACTGGTATTTGAAATTTATTTTTTTAATATTGTCGGAATTTATCTGATTAACTACCGGGCCGTAGACCCGGCAGTTAT > CP009273/1540254‑1540543 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |