Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,755,150 | A→T | 100% | L300* (TTG→TAG) | sufD ← | component of SufBCD Fe‑S cluster assembly scaffold |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,755,150 | 0 | A | T | 95.0% | 563.0 / 15.1 | 180 | L300* (TTG→TAG) | sufD | component of SufBCD Fe‑S cluster assembly scaffold |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (7/2); new base T (89/82); total (96/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.78e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.32e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
CTGCGGTTTCGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACTGGTGTTGTGTCGTAACA > CP009273/1755005‑1755294 | cTGCGGTTTCGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTAc > 1:1528600/1‑148 (MQ=255) gCGGTTTCGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTg > 2:3482622/1‑148 (MQ=255) tttCGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCgg > 2:581274/1‑148 (MQ=255) ttCGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGc < 2:622645/148‑1 (MQ=255) tCGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCt < 2:321517/148‑1 (MQ=255) cGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTg < 2:250076/148‑1 (MQ=255) cGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTg < 2:2022545/148‑1 (MQ=255) tATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGtt < 2:1330344/148‑1 (MQ=255) tCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTAc > 1:646675/1‑148 (MQ=255) aCTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACaaa > 1:2925795/1‑148 (MQ=255) cTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACaaaa < 1:3260413/148‑1 (MQ=255) cTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACaaaa < 1:1989825/148‑1 (MQ=255) cTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATATGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACaaaa > 2:350268/1‑148 (MQ=255) ttCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACaaaaa > 1:576354/1‑148 (MQ=255) ccAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCttt > 2:2862337/1‑148 (MQ=255) ccAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCttt < 2:2993058/148‑1 (MQ=255) cAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTa > 1:1368131/1‑148 (MQ=255) gCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTgtgt < 2:2683367/148‑1 (MQ=255) gCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTgtgt < 1:2780223/148‑1 (MQ=255) cccATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGtt < 2:2272801/148‑1 (MQ=255) cccATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGtt > 2:156721/1‑148 (MQ=255) cccATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGtt > 1:567689/1‑148 (MQ=255) ccATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTc < 2:1801756/148‑1 (MQ=255) ccATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTc < 2:2321329/148‑1 (MQ=255) ccATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTc < 1:983322/148‑1 (MQ=255) ccATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTc < 2:949456/148‑1 (MQ=255) ccATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTc > 1:2174785/1‑148 (MQ=255) cATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTcc > 2:299546/1‑148 (MQ=255) cATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTcc > 2:299566/1‑148 (MQ=255) cATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTcc < 2:2448829/148‑1 (MQ=255) cagcagATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTccagc > 2:3218885/1‑148 (MQ=255) cagcagATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTccagc > 1:3253359/1‑148 (MQ=255) gcagATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTccagcca > 2:569966/1‑148 (MQ=255) gcagATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTccagcca > 2:570433/1‑148 (MQ=255) cagATTGTTGATGGTCATCTGACCATCCGTTTTGAATGCGTGCTGCGCGACGTTGAACAAACCGTTAAATACCGCGCGCCCATTGTCGCTGACGATAGTTTTGAGCTACTGTCGGCTGTAACAAAAACCTTTATTTTGTTccagacag > 2:877257/1‑148 (MQ=255) gATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGt > 1:1873911/1‑148 (MQ=255) aTTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTa < 2:763483/148‑1 (MQ=255) tgGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATc > 2:3300630/1‑148 (MQ=255) tgGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATc > 2:691114/1‑148 (MQ=255) gTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATcac > 1:2596860/1‑148 (MQ=255) gTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATcac > 2:804474/1‑148 (MQ=255) tCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCacacac < 2:1368131/148‑1 (MQ=255) cTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACAcc > 2:2627346/1‑148 (MQ=255) cTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACAcc < 1:102858/148‑1 (MQ=255) aCCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCg > 1:2863064/1‑148 (MQ=255) aCCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCg > 1:2909761/1‑148 (MQ=255) ccATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGt > 1:3498370/1‑148 (MQ=255) ccATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGt < 2:2519155/148‑1 (MQ=255) aTCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGttt > 1:1228072/1‑148 (MQ=255) aTCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGttt > 1:1228067/1‑148 (MQ=255) aTCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGAAGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCTCTGACGATATTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGttt < 1:125550/148‑1 (MQ=255) tGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCAt < 1:510237/148‑1 (MQ=255) cgcgACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTa < 2:2578698/148‑1 (MQ=255) cgcgACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTa < 1:1595658/148‑1 (MQ=255) cgACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTAtt < 1:156721/148‑1 (MQ=255) aCGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGa > 1:118280/1‑148 (MQ=255) cGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGAt > 1:999683/1‑148 (MQ=255) cGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGAt < 2:2150572/148‑1 (MQ=255) gTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATc < 2:3458796/148‑1 (MQ=255) ttGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATcc > 1:1815894/1‑148 (MQ=255) ttGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATcc > 2:1097932/1‑148 (MQ=255) ttGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATcc > 1:442350/1‑148 (MQ=255) gATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGc < 1:3343398/148‑1 (MQ=255) tCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAg > 1:3076585/1‑148 (MQ=255) cAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGc > 2:3026942/1‑148 (MQ=255) aaCCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGt > 2:46844/1‑148 (MQ=255) aCCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTg > 2:2188589/1‑148 (MQ=255) cGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCt > 2:1093586/1‑148 (MQ=255) gTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTg > 2:2515922/1‑148 (MQ=255) tAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGtt > 1:2048179/1‑148 (MQ=255) tAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGtt > 2:1794276/1‑148 (MQ=255) aaaTACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGttt > 1:285902/1‑148 (MQ=255) aTACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTc > 1:1113598/1‑148 (MQ=255) aTACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTc > 2:1349036/1‑148 (MQ=255) aTACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTc > 2:3152193/1‑148 (MQ=255) cgGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTAGTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGa < 2:3066727/148‑1 (MQ=255) gCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGt > 1:882594/1‑148 (MQ=255) gCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGt < 2:1615534/148‑1 (MQ=255) ccTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGtt > 1:2481737/1‑148 (MQ=255) ccTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGtt < 2:3355027/148‑1 (MQ=255) tttGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGc < 1:109845/148‑1 (MQ=255) tGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGt < 1:2550483/148‑1 (MQ=255) gTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGGTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTa < 2:1962687/148‑1 (MQ=255) tCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCCGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTAc < 2:1467770/148‑1 (MQ=255) 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tgCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACTGGTGTTGTGTCGTAaca < 2:646675/148‑1 (MQ=255) | CTGCGGTTTCGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACTGGTGTTGTGTCGTAACA > CP009273/1755005‑1755294 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |