Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,836,192 | T→A | 100% | I67I (ATA→ATT) | ynjH ← | DUF1496 family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,836,192 | 0 | T | A | 98.3% | 562.9 / ‑0.1 | 178 | I67I (ATA→ATT) | ynjH | DUF1496 family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base A (80/95); total (82/96) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.95e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.46e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
TGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCGGG > CP009273/1836048‑1836336 | tggtctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAAtt > 2:2735444/1‑148 (MQ=255) ctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCtt < 1:2610341/148‑1 (MQ=255) gtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCACCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCgg < 1:1767570/148‑1 (MQ=255) gtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTGGATTGGTTTAAGCGCCGCCAGACCAGCGGGTTAGTGGTAATGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTACTTAgg > 1:1057130/1‑148 (MQ=255) gtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACAGTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCgg < 1:3381250/148‑1 (MQ=255) gCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCt > 2:2524476/1‑148 (MQ=255) gCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCt < 1:548892/148‑1 (MQ=255) cACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGGTTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTa > 2:1305041/1‑148 (MQ=255) tGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTa < 1:631104/148‑1 (MQ=255) gAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTTCGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTAc > 2:1650952/1‑148 (MQ=255) gAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTAc < 2:172106/148‑1 (MQ=255) gAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTAc < 2:602442/148‑1 (MQ=255) gAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTAAGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCATCGGCGTTAATTAc > 1:2612667/1‑148 (MQ=255) agGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATTGCTTTAAGCGCCCCCAGCCCAGCGGATTAGTGGTAAGGGTTTTGTGCTCACGCGGGCCTTTCAGCAGAATTCCATCGGCTGTAATTACCGcc > 1:2523863/1‑148 (MQ=255) gcgcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGcccc < 2:1792099/148‑1 (MQ=255) gcgcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGcccc < 1:1937519/148‑1 (MQ=255) gcgcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGcccc < 1:1940432/148‑1 (MQ=255) cAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGa < 2:936278/148‑1 (MQ=255) cAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGa < 1:2365951/148‑1 (MQ=255) aaTATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGaa < 1:3165982/148‑1 (MQ=255) atatCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGaat < 2:2184710/148‑1 (MQ=255) atCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGaataa < 2:3464117/148‑1 (MQ=255) ccGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTTCAGCAGAAATCCTTAGGCTTTAATTACCGCCCCATCAGAATAAtt > 1:295693/1‑148 (MQ=255) cGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAAttt < 2:2005936/148‑1 (MQ=255) cTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTg < 2:2911842/148‑1 (MQ=255) tGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGa < 1:2177162/148‑1 (MQ=255) ggCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGAt < 2:1244855/148‑1 (MQ=255) gCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTGTTTGGCTTTACGCGCCGCCCGACCCGCGGATTAGTGCTAAGGGGTTTGTCATCACGCTGGGCTTGCAGCAGAATTACATCGGCTTTAATTAACGCCCCGTCAGTATAATTTTGATc > 1:1587096/1‑148 (MQ=255) ccccTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATcc < 1:390904/148‑1 (MQ=255) ccTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTg > 2:1451007/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTg < 2:3490820/148‑1 (MQ=255) tgctgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTTCGCGCCGCCACACCAGCGGATTAGTTCTAATGGTTTTTTGATCACGCGGGCATTTAATCAGAATTACTTCGGCTTTAATTTACGCCCCTTCAGAATAAATTTTATTCTGAt > 1:1578908/1‑148 (MQ=255) ctgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATaa < 1:2735444/148‑1 (MQ=255) ctgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATaa < 1:3501544/148‑1 (MQ=255) gACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCACCGGCTTAGTGCTAAGGGGTTTTTCATCAAGCTGGCATTGCAGCAGAAATCCTTCGGCTTTAATTAACGCCCCTTCAGAATAAATTTGATACTGATAAAc > 1:1118968/1‑148 (MQ=255) aCATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCGAAGGGTTTTGTCATCACGCAGGCATTGCCGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACg > 2:2348233/1‑148 (MQ=255) cATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgc < 2:1527022/148‑1 (MQ=255) ttCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgcag < 2:2938842/148‑1 (MQ=255) ttCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgcag < 2:788973/148‑1 (MQ=255) ttCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgcag < 2:2938870/148‑1 (MQ=255) ttCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTAATCAAGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTAACGCCCCATCAGAATAATTTTTATCCTGATAAACgcag > 2:7728/1‑148 (MQ=255) ttCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCACCGGATTTGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTTCAGCAGAATTACTTCGGCTTTAATTACCGCCCCGTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgcag > 1:857469/1‑148 (MQ=255) tCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCCGACCCGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAAATCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATACAGATAAACgcagc > 2:1946221/1‑148 (MQ=255) tCCATTATTAGAGGCGTGTATGGCTTTACGCGCCCCCAGACCAGCGGCTTAGTGCTAAGGGTTTTGTCCTCACGCGGGCATTGCAGCAGAATTCCGTCGGCTTTAATTACCGCCCCGTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgcagc > 2:1246042/1‑148 (MQ=255) ccATTATTAGAGGCGTTTATGGGTTTAAGCGCCGCCAGACCCGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCCTTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAAAgcagca > 2:473149/1‑148 (MQ=255) cATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCAc < 1:1145300/148‑1 (MQ=255) cATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCACCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACCCTGGCATTTCAGCAGAATTCCATAGGCGTTAATTACCGCCCCATCAGAAAAATTTTGATCCGGATAAAAGCAGCAc > 2:3257304/1‑148 (MQ=255) ttattaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTg < 2:904920/148‑1 (MQ=255) attaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAg < 2:1129640/148‑1 (MQ=255) ttaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGt < 1:3354624/148‑1 (MQ=255) agagGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTAc < 2:1408129/148‑1 (MQ=255) agagGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTAc < 2:2734432/148‑1 (MQ=255) gagGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACa < 2:893752/148‑1 (MQ=255) gagGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACa < 2:2603806/148‑1 (MQ=255) agGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAg < 1:2573912/148‑1 (MQ=255) gCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAggg > 2:2392233/1‑148 (MQ=255) cGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGc < 2:1739456/148‑1 (MQ=255) tttATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTg > 1:2305653/1‑148 (MQ=255) ttATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTgc > 2:2043780/1‑148 (MQ=255) tATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTgcg < 2:2764451/148‑1 (MQ=255) ttACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTg > 2:1342125/1‑148 (MQ=255) gccgccAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGcc < 2:1874653/148‑1 (MQ=255) cAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctgaac > 1:203320/1‑148 (MQ=255) aCCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctgaactga > 2:2081736/1‑148 (MQ=255) cAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCtgaactgaac > 2:1534898/1‑148 (MQ=255) gtaTTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCTGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACtt < 2:2473636/146‑1 (MQ=255) ggATTAGTGCTATGGTTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCATAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACTGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACtt < 1:1017758/148‑1 (MQ=255) gATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTc > 1:3271514/1‑148 (MQ=255) gATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTc > 2:3225277/1‑148 (MQ=255) gATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAAGTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTc < 2:3098713/148‑1 (MQ=255) aTTTGTGCTATGTTTTTTGTCATCACGCTGGCATTTCAGAATAATTCCTTCGTATTTATTTACCGCCCCTTAATAATATTTTTTATCCTGATAAACGCAGCAGTGAGTACCGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCt < 1:1515238/148‑1 (MQ=255) aTTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGACCACTTCt > 1:348457/1‑148 (MQ=255) aTTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCt > 1:1237042/1‑148 (MQ=255) aaGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACg < 2:3359633/148‑1 (MQ=255) aaGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACg > 2:386603/1‑148 (MQ=255) aaGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACg < 1:510454/148‑1 (MQ=255) aaGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACg < 2:1944475/148‑1 (MQ=255) aaGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACGGAGTACCGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACg < 2:1839821/148‑1 (MQ=255) aGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGt > 1:2981069/1‑148 (MQ=255) aGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGt < 1:2437709/148‑1 (MQ=255) gggTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGtt > 2:3278208/1‑148 (MQ=255) gggTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGtt > 2:3278748/1‑148 (MQ=255) gggTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGtt > 1:2222566/1‑148 (MQ=255) ggTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGttt > 1:136624/1‑148 (MQ=255) ggTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGttt > 1:578485/1‑148 (MQ=255) ggTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGttt > 1:1870203/1‑148 (MQ=255) ttttGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACCGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTAc < 1:106267/148‑1 (MQ=255) tttGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTAcc < 1:3122420/148‑1 (MQ=255) tGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTAAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTc < 1:1650952/148‑1 (MQ=255) tcatcaCGCTGTCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTATACCTCCa > 2:739633/1‑148 (MQ=255) catcaCGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCAc > 1:981184/1‑148 (MQ=255) catcaCGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCAc > 1:2731114/1‑148 (MQ=255) tcaCGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCTACGt > 2:2568328/1‑148 (MQ=255) gCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCCCGTCCGGACGa > 2:1014489/1‑148 (MQ=255) aTTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATa < 2:1057130/148‑1 (MQ=255) aTTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATa < 1:2524476/148‑1 (MQ=255) tGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAAt > 2:2228906/1‑148 (MQ=255) cagcagAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGc < 1:888824/148‑1 (MQ=255) cagAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCggg > 1:3128524/1‑148 (MQ=255) cagAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCggg < 1:2286782/148‑1 (MQ=255) | TGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCGGG > CP009273/1836048‑1836336 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |