| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 23,320 | T→A | 100% | F310L (TTT→TTA) | ileS → | isoleucyl‑tRNA synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 23,320 | 0 | T | A | 97.7% | 505.7 / 0.5 | 160 | F310L (TTT→TTA) | ileS | isoleucyl‑tRNA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/1); new base A (79/77); total (82/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
TGGTGCAGATCGACGGTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTTATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAGAAATACGGCCTGGAAACCGCTAACCCGGTTGGC > CP009273/23178‑23464 | tGGTGCAGATCGACGGTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATggg < 2:3209916/148‑1 (MQ=255)tGGTGCAGATCGACGGTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATggg > 1:1731129/1‑148 (MQ=255)tGGTGCAGATCGACGGTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATggg > 1:2643280/1‑148 (MQ=255)tGGTGCAGATCGACGGTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATggg > 1:2642306/1‑148 (MQ=255) gTGCAGATCGACGGTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCt > 2:2905199/1‑148 (MQ=255) tGCAGATCGACGGTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCtt < 1:1821340/148‑1 (MQ=255) tGCAGATCGACGGTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCAAGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCtt < 1:2046745/148‑1 (MQ=255) aTCGACGGTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACg < 2:2503358/148‑1 (MQ=255) cGACGGTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGtt > 2:1204174/1‑148 (MQ=255) aCGGTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTcc > 2:183146/1‑148 (MQ=255) ggTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCgg < 1:3060666/148‑1 (MQ=255) ggTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCgg < 1:3060653/148‑1 (MQ=255) ggTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCgg < 1:1949084/148‑1 (MQ=255) tCAGGCCGTGATTCGGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCa < 2:205945/148‑1 (MQ=255) cAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCaa > 2:3248663/1‑148 (MQ=255) cAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCaa < 1:1947021/148‑1 (MQ=255) gCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATcc < 2:1948194/148‑1 (MQ=255) gCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATcc > 2:3224795/1‑148 (MQ=255) gCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATcc < 2:392104/148‑1 (MQ=255) gTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCg > 2:3012787/1‑148 (MQ=255) tGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCgg < 1:2211288/148‑1 (MQ=255) tGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCgg < 1:778042/148‑1 (MQ=255) tCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGAt > 2:1917261/1‑148 (MQ=255) cGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGt < 2:3414042/148‑1 (MQ=255) aaaGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTa < 2:335996/148‑1 (MQ=255) aGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTAcc < 1:620150/148‑1 (MQ=255) cTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTgg > 2:747168/1‑148 (MQ=255) gTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATg > 2:1753940/1‑148 (MQ=255) ttGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGc < 1:876041/148‑1 (MQ=255) tGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGGAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGcc < 1:631266/148‑1 (MQ=255) aaGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGt < 2:153868/148‑1 (MQ=255) aGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTa > 1:3353233/1‑148 (MQ=255) cGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTAcc > 2:3503476/1‑148 (MQ=255) cGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTAcc > 2:2823858/1‑148 (MQ=255) gTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCg < 1:947598/148‑1 (MQ=255) gTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCg < 1:2114860/148‑1 (MQ=255) aTGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTg < 2:2265319/148‑1 (MQ=255) cAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCg < 2:82712/148‑1 (MQ=255) aGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGt > 1:332090/1‑148 (MQ=255) aGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGt < 2:2462122/148‑1 (MQ=255) aGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGt < 2:563908/148‑1 (MQ=255) gCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGtt > 1:58392/1‑148 (MQ=255) aTCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTcaca > 1:2828118/1‑148 (MQ=255) tCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCacac < 1:2890306/148‑1 (MQ=255) cGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACAcc > 2:3023181/1‑148 (MQ=255) cGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACAcc > 1:2241975/1‑148 (MQ=255) gTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGTCGTTCACACCgcgc < 2:3324126/148‑1 (MQ=255) gTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCgcgc < 2:2122104/148‑1 (MQ=255) gTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCgcgc < 1:1480477/148‑1 (MQ=255) tGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGcc > 1:3136004/1‑148 (MQ=255) tGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGcc > 1:3135993/1‑148 (MQ=255) ccGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTgg > 2:1420852/1‑148 (MQ=255) ccGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTgg > 2:1420833/1‑148 (MQ=255) gATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTTATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGcc > 2:1602809/1‑148 (MQ=255) 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cATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCg > 2:1131892/1‑148 (MQ=255) aTTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCgg < 1:2788680/148‑1 (MQ=255) aTTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCgg < 1:2789367/148‑1 (MQ=255) ttCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGga > 2:620684/1‑148 (MQ=255) ttCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGga > 1:2330653/1‑148 (MQ=255) ttCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACACTCGATCCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGACTGGCAACGGCCCgca > 2:2384197/1‑146 (MQ=255) tcGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGgacga < 1:1063260/148‑1 (MQ=255) tcGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGgacga < 1:1063402/148‑1 (MQ=255) cgtcACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGgacgac < 2:1782599/145‑1 (MQ=255) gCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTTATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTa < 2:844354/148‑1 (MQ=255) cACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTAt < 1:2495450/148‑1 (MQ=255) cGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTAtgt > 1:2954328/1‑148 (MQ=255) gTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGa > 2:654712/1‑148 (MQ=255) tAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGAt > 1:2183868/1‑148 (MQ=255) aaaGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCg > 1:2554693/1‑148 (MQ=255) aaGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCgg < 1:63674/148‑1 (MQ=255) aGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGt < 2:3353228/148‑1 (MQ=255) aGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGt < 1:982817/148‑1 (MQ=255) tGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGTCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAg > 2:1122139/1‑148 (MQ=255) gCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAGa > 2:2695285/1‑148 (MQ=255) gCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAGa > 2:2695338/1‑148 (MQ=255) gAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAGAAAt > 2:3108860/1‑148 (MQ=255) aGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAGAAATa > 1:862348/1‑148 (MQ=255) cTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAGAAATACg < 2:2623977/148‑1 (MQ=255) cTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAGAAATACg > 2:2622911/1‑148 (MQ=255) 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cgcTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAGAAATACGGCCTGGAAACCg < 2:1690282/148‑1 (MQ=255) cTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAGAAATACGGCCTGGAAACCGCt < 1:551866/148‑1 (MQ=255) cTTTACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAGAAATACGGCCTGGAAACCGCt > 2:1969394/1‑148 (MQ=255) ttACCCATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAGAAATACGGCCTGGAAACCGCTaa > 1:3417431/1‑148 (MQ=255) cATCCGTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAGAAATACGGCCTGGAAACCGCTAACCCgg > 2:1259085/1‑148 (MQ=255) 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gTTAATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTAGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAGAAATACGGCCTGGAAACCGCTAACCCGGTTGGc < 1:2819088/148‑1 (MQ=255) | TGGTGCAGATCGACGGTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTTATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAGAAATACGGCCTGGAAACCGCTAACCCGGTTGGC > CP009273/23178‑23464 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |