Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,138,039 | C→A | 100% | I431I (ATC→ATA) | yegE → | putative diguanylate cyclase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,138,039 | 0 | C | A | 99.1% | 693.2 / ‑3.2 | 216 | I431I (ATC→ATA) | yegE | putative diguanylate cyclase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base A (107/106); total (108/108) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
GCAATGGCGATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGAGTGCGTG > CP009273/2137894‑2138183 | gCAATGGCGATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAAc > 2:3296302/1‑148 (MQ=255) cAATGGCGATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAAct > 2:2231786/1‑148 (MQ=255) aaTGGCGATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAActc > 2:1468216/1‑148 (MQ=255) aTGGCGATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAActct > 1:1118041/1‑148 (MQ=255) ggCGATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTgg < 1:404871/148‑1 (MQ=255) ggCGATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTgg > 1:2325228/1‑148 (MQ=255) gCGATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGc < 1:3467039/148‑1 (MQ=255) aTGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTaa < 1:2117303/148‑1 (MQ=255) ttgtCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGa > 2:376918/1‑148 (MQ=255) ttgcttgcCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGa > 2:2936400/1‑148 (MQ=255) cGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATc < 2:3468062/148‑1 (MQ=255) cGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATc < 2:78276/148‑1 (MQ=255) gTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCt < 2:1402947/148‑1 (MQ=255) ctcACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCtgg > 2:469841/1‑148 (MQ=255) tcACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCtggg > 1:1064902/1‑148 (MQ=255) aCTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCtgggag > 1:2625472/1‑148 (MQ=255) aCTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCtgggag > 1:3046340/1‑148 (MQ=255) aCTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCtgggag > 2:3473503/1‑148 (MQ=255) tGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCtgggagtg < 1:3373168/148‑1 (MQ=255) 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ccACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTg < 2:2501566/148‑1 (MQ=255) cacaCGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGa < 1:202061/148‑1 (MQ=255) acacGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGaa < 1:653601/148‑1 (MQ=255) acacGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGaa < 1:821750/148‑1 (MQ=255) acacGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGaa > 1:1316359/1‑148 (MQ=255) acacGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGaa < 1:2415066/148‑1 (MQ=255) acGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGc < 2:2941824/148‑1 (MQ=255) cGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGcc < 1:3100548/148‑1 (MQ=255) ggATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAAAGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCg > 1:1487883/1‑148 (MQ=255) tGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAat < 2:2363357/148‑1 (MQ=255) ggCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAata < 1:3356303/148‑1 (MQ=255) gCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAatat < 2:1755444/148‑1 (MQ=255) cgccgcTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATAtttt > 2:818405/1‑148 (MQ=255) gccgcTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATAttttt < 1:1552502/148‑1 (MQ=255) gccgcTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATAttttt < 2:876745/148‑1 (MQ=255) cgcTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAg < 2:3149618/148‑1 (MQ=255) ctctATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCt < 1:522449/148‑1 (MQ=255) tctATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTg > 1:2909300/1‑148 (MQ=255) aTTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGa > 1:704486/1‑148 (MQ=255) tttATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATa > 2:1312449/1‑148 (MQ=255) 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aCATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTa > 1:5779/1‑148 (MQ=255) aTTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATg > 2:2714412/1‑148 (MQ=255) tAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGaa > 1:215762/1‑148 (MQ=255) tAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGaa > 1:991916/1‑148 (MQ=255) tAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGaa > 1:2745879/1‑148 (MQ=255) 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gCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACatat > 2:3463991/1‑148 (MQ=255) cACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATc > 1:1002672/1‑148 (MQ=255) ccGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCaa > 1:936593/1‑148 (MQ=255) cAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGa < 2:515568/148‑1 (MQ=255) cAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGa > 1:468804/1‑148 (MQ=255) aGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGaa > 1:2871744/1‑148 (MQ=255) ggTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAAc > 2:2164301/1‑148 (MQ=255) ggTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAAACGAAc > 2:2536752/1‑148 (MQ=255) gTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACt < 1:429129/148‑1 (MQ=255) cAATCAGCAACTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTgg > 2:979862/1‑148 (MQ=255) 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aaCTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGtgtg > 2:3054120/1‑148 (MQ=255) cTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGt > 1:1860793/1‑148 (MQ=255) cTGATGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGt > 2:1842695/1‑148 (MQ=255) aTGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACg > 1:1127990/1‑148 (MQ=255) tGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGa < 2:418281/148‑1 (MQ=255) tGGAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGa < 1:245571/148‑1 (MQ=255) gAGCGCATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGAgt < 1:1650048/148‑1 (MQ=255) cgcATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGTGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGAgtgcg < 1:1916623/148‑1 (MQ=255) cgcATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGAgtgcg < 1:3299977/148‑1 (MQ=255) cATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGAgtgcgtg < 1:3473503/148‑1 (MQ=255) cATAACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGAgtgcgtg < 1:3035906/148‑1 (MQ=255) | GCAATGGCGATGTTGTCTGGGCGTTGCTTGCCGTCTCACTGGTGCGCCACACGGATGGCACGCCGCTCTATTTTATCGCTCAGATTGAAGACATTAACGAGCTAAAACGCACCGAACAGGTCAATCAGCAACTGATGGAGCGCATCACTCTGGCTAACGAAGCGGGCGGGATTGGCATCTGGGAGTGGGAGTTGAAGCCGAATATTTTTAGCTGGGATAAGCGGATGTTCGAGCTGTATGAAATTCCTCCACATATCAAACCGAACTGGCAGGTGTGGTACGAGTGCGTG > CP009273/2137894‑2138183 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |