| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,409,935 | G→T | 100% | A570A (GCG→GCT) | pta → | phosphate acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,409,935 | 0 | G | T | 98.6% | 471.8 / ‑1.7 | 147 | A570A (GCG→GCT) | pta | phosphate acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base T (61/84); total (63/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.82e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
GTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTG > CP009273/2409790‑2410077 | tccgCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTAtt > 2:2172865/1‑148 (MQ=255) gccgcTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAg < 2:1745271/148‑1 (MQ=255) ccgcTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGt > 1:2297933/1‑148 (MQ=255) gCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCt > 1:1146195/1‑148 (MQ=255) cAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTg > 1:2070008/1‑148 (MQ=255) cTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGAtt > 1:2541454/1‑148 (MQ=255) tCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGc > 1:1264395/1‑148 (MQ=255) aaaaCTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTg > 1:2645056/1‑148 (MQ=255) aaCTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCg > 2:647555/1‑148 (MQ=255) aaCTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCg > 2:2408918/1‑148 (MQ=255) tGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGcc < 2:2377043/148‑1 (MQ=255) cACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCtt < 1:3418952/148‑1 (MQ=255) aCCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTc > 2:3477533/1‑148 (MQ=255) gggCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGt < 2:2578850/148‑1 (MQ=255) gggCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGt < 1:764454/148‑1 (MQ=255) gCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTAt > 2:1393875/1‑148 (MQ=255) gCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGa > 2:207440/1‑148 (MQ=255) gCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGa < 1:2126788/148‑1 (MQ=255) gCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGa < 1:2126797/148‑1 (MQ=255) gCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGa > 2:208185/1‑148 (MQ=255) cTCCCTGGGATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGaa < 1:3144501/148‑1 (MQ=255) cccTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAAcc > 1:2713412/1‑148 (MQ=255) tGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACcgcg > 2:2722790/1‑148 (MQ=255) tCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTg > 1:2810714/1‑148 (MQ=255) tCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTg < 2:1637966/148‑1 (MQ=255) tCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTg < 2:1636053/148‑1 (MQ=255) cTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGc > 2:1940890/1‑148 (MQ=255) cTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGc > 1:958501/1‑148 (MQ=255) cTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGc > 2:1036745/1‑148 (MQ=255) tCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTa < 1:1465868/148‑1 (MQ=255) tCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTa < 1:2395521/148‑1 (MQ=255) tCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTa < 2:843996/148‑1 (MQ=255) tCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCCGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTa < 1:2395576/148‑1 (MQ=255) cGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATg < 2:927980/148‑1 (MQ=255) cGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATg < 1:2314348/148‑1 (MQ=255) cGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATg < 1:3260586/148‑1 (MQ=255) tgtTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGct > 2:3324160/1‑148 (MQ=255) gtTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGctc > 2:1771229/1‑148 (MQ=255) ttcttcATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGctct < 1:267206/148‑1 (MQ=255) ttcttcATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGctct < 1:2801882/148‑1 (MQ=255) ttcttcATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGctct < 2:1000241/148‑1 (MQ=255) cttcATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTcc < 1:2660454/148‑1 (MQ=255) cttcATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTcc < 1:342258/148‑1 (MQ=255) cttcATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCAGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTcc < 1:723619/148‑1 (MQ=255) tgctgctgcCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTc > 1:1002936/1‑148 (MQ=255) tgctgctgcCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTc < 1:2949017/148‑1 (MQ=255) gctgctgcCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTcc > 2:1919004/1‑148 (MQ=255) ctgcCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCg > 1:2627936/1‑148 (MQ=255) cGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTAc < 1:1703645/148‑1 (MQ=255) cGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTAc < 2:1253084/148‑1 (MQ=255) aaCAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTc > 2:1819213/1‑148 (MQ=255) gtttacgtttacGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTg > 2:2797049/1‑148 (MQ=255) gtttacgtttacGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTg > 2:2797434/1‑148 (MQ=255) gtttacgtttacGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTg < 2:1411123/148‑1 (MQ=255) ttacgtttacgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCa > 1:1938185/1‑148 (MQ=255) ttacgtttacgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCa < 1:2093201/148‑1 (MQ=255) ttacgtttacgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCa < 2:1901846/148‑1 (MQ=255) ttacgtttacgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCa < 1:2172865/148‑1 (MQ=255) acgtttacgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAgg > 1:913848/1‑148 (MQ=255) tttacgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAg < 1:729207/148‑1 (MQ=255) tacgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCg < 2:250839/148‑1 (MQ=255) acgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGa < 2:1726509/148‑1 (MQ=255) acgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGa < 1:919703/148‑1 (MQ=255) gACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAg < 2:315200/148‑1 (MQ=255) aCTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGa > 1:782110/1‑148 (MQ=255) aTCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTc > 2:25420/1‑148 (MQ=255) tCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTcg < 1:3146755/148‑1 (MQ=255) tCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTcg > 1:49349/1‑148 (MQ=255) aCCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGa < 1:1995431/148‑1 (MQ=255) cGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGc > 2:2661024/1‑148 (MQ=255) cGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGc > 2:3392500/1‑148 (MQ=255) ggATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCa < 1:2412305/148‑1 (MQ=255) ggATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCa < 1:2412237/148‑1 (MQ=255) gATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAACTCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCaa < 2:1197882/148‑1 (MQ=255) gATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCTGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCGGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCaa < 2:2707600/148‑1 (MQ=255) gATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCaa < 2:931296/148‑1 (MQ=255) gATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCaa < 1:528283/148‑1 (MQ=255) tCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACt > 1:257438/1‑148 (MQ=255) tCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACt < 1:1388463/148‑1 (MQ=255) aCCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTc > 2:1288981/1‑148 (MQ=255) ccGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCt < 2:392165/148‑1 (MQ=255) gAACAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACGCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGgcgc < 1:2089049/148‑1 (MQ=255) aaCAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCa < 2:2628819/148‑1 (MQ=255) cAGCTGGCAGAAATCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAgg > 1:3002112/1‑148 (MQ=255) 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aTCGCTATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTcctg < 2:2151240/148‑1 (MQ=255) | GTCCGCCGCTGCAGCTGATCAAAACTGCACCGGGCAGCTCCCTGGTATCTTCCGTGTTCTTCATGCTGCTGCCGGAACAGGTTTACGTTTACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTG > CP009273/2409790‑2410077 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |