Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,463,920 | C→A | 12.7% | D437E (GAC→GAA) | gtrS → | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,463,920 | 0 | C | A | 12.7% | 397.2 / 9.8 | 144 | D437E (GAC→GAA) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/70); new base A (20/4); total (70/74) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.29e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
AATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTG > CP009273/2463776‑2464066 | tctcAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCg < 2:1578472/148‑1 (MQ=255) ctcAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TGTTTTTTTTTTTTAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAACaaaaaaga > 1:3354154/1‑142 (MQ=255) cAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATg < 1:2923804/148‑1 (MQ=255) cAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAAAAATTAAAAAAAATAAAAAAAAAAACGAtt > 2:77930/1‑147 (MQ=255) aTTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTTATTTATAAAAAAATTAAAAAAAAAAAAGAAAATAACGATTTa > 2:2725022/1‑148 (MQ=255) ttttATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTTAATTATTAAATAATTAAAAAAAATCAAAACAAAAGCGATTTaa > 2:2707337/1‑148 (MQ=255) ttttATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAAAAATTAAAATAAATAAAGACAAAAGCGAAGTaa > 2:437933/1‑148 (MQ=255) tATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTTATTTATTAAATAATTCAAAGAAAAAAAAACAATATCGATTGAAAGc > 1:3221842/1‑148 (MQ=255) tgtgTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACGTAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAc < 1:3468358/148‑1 (MQ=255) gtCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TGTTTTTTATTTTTAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGATTTaaatgacaaa > 1:221296/1‑141 (MQ=255) tCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAg < 1:160034/148‑1 (MQ=255) tttttCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGttt < 1:3151554/148‑1 (MQ=255) ttttCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTTATTTATAAAAAAAATAAAAAAAAAAAATAAAATAGCGATGTAAATCACTAAGtttt > 2:2440795/1‑147 (MQ=255) ttCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTaaa < 2:3379002/148‑1 (MQ=255) tCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAAt < 2:1690119/148‑1 (MQ=255) ggtgAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTg < 2:2005975/145‑1 (MQ=255) gATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAAAAATTCAAAGAAATCAAGACAAAATCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTTCGCGccc > 2:3180987/1‑147 (MQ=255) atatAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCaa < 1:2406622/148‑1 (MQ=255) ataGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTTATTTATAAAATAATTAAAAGAAATAAATAAAAAATCGATGTAAATCACTAAGTTTAAATTTCGCGCCaaaa > 2:3130174/1‑146 (MQ=255) agagATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TGTTTTTTATTTTTTAAAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGATTTAAAGCACTAAGTTTTAATTTAGCGcccaaaat > 1:581141/1‑142 (MQ=255) agaTTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTTATTTATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAATAGATGTAAAGCACGAAATTTTAAAATCGCGCCAAACAAgg > 2:1191605/1‑148 (MQ=255) agaTTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATgg < 1:996158/148‑1 (MQ=255) tAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAAATTATAAAATAATTAAAATAAAAAAATAAAAAAACGAAGTAAAGCACAAATTTTAAAATTCGCGCCAAACAAGtcgcgc > 2:3213656/1‑148 (MQ=255) gcaagcaTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TGTTTTTTATTTATAAAATAAATAAAATAAAAAAAAAAAAAATATATTTAAAGAAAGAAATTTATATTTAGGGCCAAACATGGGGCGccca > 1:815341/1‑148 (MQ=255) caagcaTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAAAAAATAAAAGAAAAAAATAAAAAAGCGATTTTAATCACTAAGTTTAAAATTAGCGCCAATAATTTCGCGCCCaa > 2:3442173/1‑148 (MQ=255) aagcaTTTTTTTGGAATTTATTTTTCTTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTTTAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAg < 2:2913966/148‑1 (MQ=255) aagaaTTTATTTGGATTGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCT‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAg < 2:1089854/148‑1 (MQ=255) gcaTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCt < 2:3475845/148‑1 (MQ=255) caTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAAGAAATAAAGACAATAGCTATGTAAAGAAATAATTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCta < 1:1416532/148‑1 (MQ=255) ttatttGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTTAATTAATAAAA‑AATTAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAGAATTAAAGCACTCATTTTAAATTTGGCGCCACAAAAGGCGCGCACCACCTaaaa > 2:2393959/1‑148 (MQ=255) tttGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATAc < 1:3473867/148‑1 (MQ=255) aaTGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAAcc < 2:563802/148‑1 (MQ=255) tGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTa < 2:728640/148‑1 (MQ=255) aTTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAAATTAAAAAATAATTACAATAAAAAAAGACAAAAGCGAAGTAAAGCACTAAATTTAAAATGCGCGCCAAACATGGGGCGCACCAACTATAATAAAAACATAAtt > 2:227892/1‑148 (MQ=255) tttttCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTTATTTATAAAAAAAATAAAATAAAAAAAAAAAAAATAGATGTAAAGCACAAAATTTAAAATTCGCCCCAAAAAATGCGCCCACAAACAATAAAACCAACCTAAatt > 2:1126970/1‑148 (MQ=255) ctttcgACATTTGATTATACATAACATTGT‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAATTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTctcct < 1:1568243/146‑1 (MQ=255) ttcgACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTctcctcc < 2:2454832/148‑1 (MQ=255) tcgACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTTATTTATAAAATAATTCAAAAAAATAAACACCATATCGATGTAAAGCACGAAGTTTAAAATTAGCGCCAAAAAAGGCGCGCACAAGCTATAAAACCAACCTAAATTatactcct > 2:3222347/1‑148 (MQ=255) ctacattttCTTATACATAACATTCG‑TTTTTTTATTTTATAAAATAATAAAAATAAATCAATAAAATAGCGATGTAAAGCACTATTTTTAATTTGCGCGCCAATATTGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTctcctcctc < 1:972274/143‑1 (MQ=255) cgACCTTTTCTTATACATAACATTCT‑TTTTTTTAATTAATAAAATAATTCAAATAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAATTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTctcctcctc < 1:2707337/148‑1 (MQ=255) cgACCTTTGCTTATACATAACAGTCT‑TTTTTTTAATTTATAAAATAAATCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAATAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTctcctcctc < 1:1103293/148‑1 (MQ=255) cgACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTctcctcctc < 1:280575/148‑1 (MQ=255) cgAACTTTGCTTATACATAACAGTCT‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATAAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTctcctcctc < 1:2706734/148‑1 (MQ=255) tttGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATTAAAAAATTAAAATAAATCAAGAAAAAAGAGATTTAAATCACTAACTTTAAATTTCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATAACAAACAAAATTATACACATCTTaga > 2:3459530/1‑148 (MQ=255) tttGCTTATAAATAACAGTCT‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTaga < 2:3011842/148‑1 (MQ=255) ttGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAAAAAAAAAGACAAAAGCGTTGTAAATCAATAACTTTAAATTTAGCGGCAATAAATGCGCGCACAACCTATAAAAACAACCAAATTTATCCTCCTCTTagag > 2:2594722/1‑148 (MQ=255) ataCATAACAGTCT‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACta < 1:1672191/148‑1 (MQ=255) ataCATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACta < 2:2487917/148‑1 (MQ=255) aTAACTGTCT‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAATAAATCAAGAAAATCGCGATTTAAACCACTAAGTTTAAATGGCGCGCCAATCTTGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATAtc < 1:1507721/148‑1 (MQ=255) tAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATAtct < 1:984565/148‑1 (MQ=255) aCAGTCT‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTcc < 2:2769761/148‑1 (MQ=255) tcttttttttAATTTATAAAATAATTAAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGAt < 1:3283516/145‑1 (MQ=255) tttttttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGa > 2:1719151/1‑148 (MQ=255) ttttttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCTATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGaa < 2:935873/148‑1 (MQ=255) ttttttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGaa > 2:2099576/1‑148 (MQ=255) tttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGAAAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTg < 1:1564146/148‑1 (MQ=255) ttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGc > 2:971379/1‑148 (MQ=255) tAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCg > 1:3382031/1‑148 (MQ=255) ataAAATAATTCAAATAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTg < 2:3415892/148‑1 (MQ=255) ataAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTg > 1:1622337/1‑148 (MQ=255) ataAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTg > 1:1622338/1‑148 (MQ=255) ataAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTg < 2:3414208/148‑1 (MQ=255) taAAATAATTAAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGa < 1:1377107/148‑1 (MQ=255) aaaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGAc > 1:1355600/1‑148 (MQ=255) aaaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGAc > 1:3355056/1‑148 (MQ=255) aaaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGAc < 1:422500/148‑1 (MQ=255) aaaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTACTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGAc < 2:3009133/148‑1 (MQ=255) aaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACt < 2:2561426/148‑1 (MQ=255) aaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACt < 2:1092280/148‑1 (MQ=255) ataatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTAt > 1:3247920/1‑148 (MQ=255) taatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATc > 1:2397013/1‑148 (MQ=255) taatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATc > 2:2194660/1‑148 (MQ=255) atTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCaa < 1:488546/148‑1 (MQ=255) atTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCaa < 1:488529/148‑1 (MQ=255) atTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCaa < 1:3145851/148‑1 (MQ=255) ttCAAATAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCaaa < 2:599491/148‑1 (MQ=255) tCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAAt > 2:1050532/1‑148 (MQ=255) tCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAAt > 1:1726890/1‑148 (MQ=255) tCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAAt > 2:1806228/1‑148 (MQ=255) tCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAAt < 1:2991309/148‑1 (MQ=255) cAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATg < 2:1049417/148‑1 (MQ=255) aaaGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGc < 1:2468725/148‑1 (MQ=255) aGAAATCAATAAATTATCTATTTAAAGCACTAATTTTTAATTGAGCGCCAATAATGGGGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATTTGTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGccc < 1:1065061/148‑1 (MQ=255) aGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCACTCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAAGTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGccc > 1:2255783/1‑148 (MQ=255) aGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATTccc > 2:3154048/1‑148 (MQ=255) aGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGAACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGccc < 1:1065055/148‑1 (MQ=255) gAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCt > 2:1140856/1‑148 (MQ=255) gAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCt > 2:1195162/1‑148 (MQ=255) gAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCGCCTGATAGAATTGAGGTATTGACTATCAAATGCCCt > 2:1195086/1‑148 (MQ=255) aaaTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTg > 2:1660031/1‑148 (MQ=255) aaaTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTg > 2:1535013/1‑148 (MQ=255) aTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAt > 2:2385797/1‑148 (MQ=255) aTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAt > 2:1939561/1‑148 (MQ=255) cAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTc < 2:2779267/148‑1 (MQ=255) cAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTc < 2:2778853/148‑1 (MQ=255) aaGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCg > 2:2835571/1‑148 (MQ=255) aGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCgt > 1:400535/1‑148 (MQ=255) aGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCgt > 2:1939934/1‑148 (MQ=255) aCAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCgttg < 1:2725022/148‑1 (MQ=255) aCAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAGTCgttg > 2:179904/1‑148 (MQ=255) | AATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCG‑TTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTG > CP009273/2463776‑2464066 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |