| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,894,388 | C→A | 94.3% | V146V (GTC→GTA) | yqcE → | MFS transporter family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,894,388 | 0 | C | A | 94.3% | 605.4 / 26.3 | 212 | V146V (GTC→GTA) | yqcE | MFS transporter family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/9); new base A (94/106); total (97/115) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.09e-01 | |||||||||||
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
GTGGGTAATGCTCTGTATTCAGATCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTCGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCTGTGCTGGTTTTTTGTTAGCGAT > CP009273/2894244‑2894532 | tgGGTAATGCTCTGTATTCAGATCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGgtg > 2:1531784/1‑148 (MQ=255) gggTAATGCTCTGTATTCAGATCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGgtgt > 1:1957786/1‑148 (MQ=255) ggTAATGCTCTGTATTCAGATCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTa > 1:553307/1‑148 (MQ=255) aaTGCTCTGTATTCAGATCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATg < 2:1161414/148‑1 (MQ=255) tGCTCTGTATTCAGATCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTc > 2:874563/1‑148 (MQ=255) tctGTATTCAGATCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCt > 2:945007/1‑148 (MQ=255) tctGTATTCAGATCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCt > 2:2535268/1‑148 (MQ=255) tATTCAGATCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCg > 1:3176502/1‑148 (MQ=255) aTTCAGATCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTCGGTGTAATGTCGCTGGCgg > 2:1069925/1‑148 (MQ=255) ttCAGATCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGgt > 2:1504066/1‑148 (MQ=255) cAGATCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGgtgt < 1:2683218/148‑1 (MQ=255) gATCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGttt > 1:1262084/1‑148 (MQ=255) aTCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTCGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTa < 1:1092504/148‑1 (MQ=255) aTCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTa > 2:1790656/1‑148 (MQ=255) aTCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTa > 1:156879/1‑148 (MQ=255) tCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTAc > 1:53123/1‑148 (MQ=255) tCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTAc > 2:1658747/1‑148 (MQ=255) tCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTAc < 1:3441009/148‑1 (MQ=255) cGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATAGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGATGGCGGTGTTTAcc > 2:466700/1‑148 (MQ=255) gATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTc < 1:1845935/148‑1 (MQ=255) gATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTc < 1:580400/148‑1 (MQ=255) gATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTc < 2:1632734/148‑1 (MQ=255) aTAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATAATAGCGAGCAAGGGACAATTATGGGCTGGATTGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCt > 1:696019/1‑148 (MQ=255) tAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCtt < 2:2083739/148‑1 (MQ=255) tAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCtt > 1:3305534/1‑148 (MQ=255) tAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCtt < 2:627961/148‑1 (MQ=255) aaCGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCttt < 2:2140220/148‑1 (MQ=255) acgacgATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCtttt > 2:2346003/1‑148 (MQ=255) acgacgATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCtttt > 1:215236/1‑148 (MQ=255) cgacgaTTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTtc < 2:2407783/148‑1 (MQ=255) gaTTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGc < 2:3482790/148‑1 (MQ=255) ttttAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCtt < 1:2906117/148‑1 (MQ=255) ttttAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCtt < 2:80797/148‑1 (MQ=255) ttAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTg < 1:889106/148‑1 (MQ=255) gCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTATCGCTTTGCACCg > 1:973280/1‑148 (MQ=255) tgtgGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGa > 2:3110965/1‑148 (MQ=255) tCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTCGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACa < 2:2877862/148‑1 (MQ=255) tgtCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCAc < 1:2842321/148‑1 (MQ=255) tgtCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCAc < 1:1128848/148‑1 (MQ=255) cGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAg > 1:1467308/1‑148 (MQ=255) gATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGc < 2:1044562/148‑1 (MQ=255) tAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTg < 2:1054248/148‑1 (MQ=255) aGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTCGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGaaa < 1:361014/148‑1 (MQ=255) aGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGaaa > 2:1376691/1‑148 (MQ=255) gCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGaaaa > 1:1972102/1‑148 (MQ=255) tGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACg < 1:136046/148‑1 (MQ=255) gCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACgg < 1:3216151/148‑1 (MQ=255) tCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTCGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGtaa < 2:2916147/148‑3 (MQ=255) gTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCAtt < 2:2856132/148‑1 (MQ=255) tGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTat > 1:353352/1‑148 (MQ=255) tGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTat > 2:2226758/1‑148 (MQ=255) tGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTat > 1:2534983/1‑148 (MQ=255) gCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTatc < 1:1825346/148‑1 (MQ=255) ttGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTCGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTatcat < 2:1704464/148‑1 (MQ=255) ttGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTatcat > 1:1493401/1‑148 (MQ=255) tGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTatcatc > 2:1983723/1‑148 (MQ=255) tGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTatcatc > 2:1807374/1‑148 (MQ=255) ggCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCt < 1:2591070/148‑1 (MQ=255) gCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCta > 1:2526161/1‑148 (MQ=255) tCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAgt > 2:2011268/1‑148 (MQ=255) aGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTgg > 1:3043917/1‑148 (MQ=255) aGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTgg < 2:2798883/148‑1 (MQ=255) gCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTTGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGt < 2:1577348/148‑1 (MQ=255) gCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGt < 2:14180/148‑1 (MQ=255) aGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTa > 1:1625147/1‑148 (MQ=255) gCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTAc < 1:20229/148‑1 (MQ=255) cAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACa > 1:240837/1‑148 (MQ=255) cAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACa < 1:1068506/148‑1 (MQ=255) aaGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTCGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACAt < 1:95421/148‑1 (MQ=255) aGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATc < 2:2954662/148‑1 (MQ=255) aGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATc > 2:1272070/1‑148 (MQ=255) aGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATc > 2:3021048/1‑148 (MQ=255) aGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGGAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATc < 2:915556/148‑1 (MQ=255) gAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCttg < 1:2991030/148‑1 (MQ=255) gAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCttg < 1:3327710/148‑1 (MQ=255) aaaaTTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCAACGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACTGTCATTATCATCTATAGTGTTTTGTACATCttgt > 2:1094919/1‑148 (MQ=255) aaTTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCttgttg < 2:2528492/148‑1 (MQ=255) ttATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTggg > 2:3274992/1‑148 (MQ=255) gggCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGAtt < 2:1370808/148‑1 (MQ=255) gggCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGAtt < 1:1531784/148‑1 (MQ=255) gggCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGAtt < 1:2201178/148‑1 (MQ=255) gggCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGAtt < 1:1678468/148‑1 (MQ=255) cTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCtg < 1:1045898/148‑1 (MQ=255) cTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCtg < 1:3487410/148‑1 (MQ=255) ggatgtaAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCtgtg < 2:2088472/148‑1 (MQ=255) ggatgtaAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCtgtg < 2:315857/148‑1 (MQ=255) tatggaAGGGCTGCGCGGCGTATGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATATTGTGGTTTACATCTTGTTGGGTATTCTGTGc < 2:646187/147‑1 (MQ=255) gatggaAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCTGTGc < 2:773549/148‑1 (MQ=255) gatggaAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCTGTGc < 2:2994494/148‑1 (MQ=255) atggaAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCTGTGCt > 2:1908191/1‑148 (MQ=255) gaAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCTGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCTGTGCTGGt < 1:1796010/148‑1 (MQ=255) gaAGGGCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCTGTGCTGGt < 1:1504696/148‑1 (MQ=255) gggCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCTGTGCTGGtttt < 2:3337253/148‑1 (MQ=255) gggCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCTGTGCTGGtttt < 1:1376691/148‑1 (MQ=255) gggCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCTGTGCTGGtttt < 1:1830919/148‑1 (MQ=255) ggCTGCGCGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCTGTGCTGGttttt > 2:2765696/1‑148 (MQ=255) gcgcGGCGTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCTGTGCTGGTTTTTTGtt < 2:3107100/148‑1 (MQ=255) ggcgTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCTGTGCTGGTTTTTTGTTAGCg < 2:2645283/148‑1 (MQ=255) gcgTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCTGTGCTGGTTTTTTGTTAGCGa < 1:1327054/148‑1 (MQ=255) gcgTAGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCTGTGCTGGTTTTTTGTTAGCGa < 1:1747322/148‑1 (MQ=255) | GTGGGTAATGCTCTGTATTCAGATCGCCTTTGCGATAACGACGATTTTAATGCTGTGGTCGGTGTCGATTAAAGCTGCATCGTTGCTTGGCGATCATAGCGAGCAAGGGAAAATTATGGGCTGGATGGAAGGGCTGCGCGGCGTCGGTGTAATGTCGCTGGCGGTGTTTACCATGTGGGTCTTTTCTCGCTTTGCACCGGATGACAGCACCAGCCTGAAAACGGTCATTATCATCTATAGTGTGGTTTACATCTTGTTGGGGATTCTGTGCTGGTTTTTTGTTAGCGAT > CP009273/2894244‑2894532 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |