Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 2,913,502 | C→A | 93.4% | D202Y (GAT→TAT) | gudX ← | glucarate dehydratase‑related protein, substrate unknown |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 2,913,502 | 0 | C | A | 93.4% | 505.6 / 25.9 | 182 | D202Y (GAT→TAT) | gudX | glucarate dehydratase‑related protein, substrate unknown |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/8); new base A (99/71); total (103/79) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.31e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 |
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
CCTTTGCATAAAGAAATGGCTTCATCAAGCAGCCATGCACCGTTGGGATCAACGGTAATCCGCGCATCCGGGAAGCGTTTCTTCAATGCACGAACAGTGTCGATTTCTTGCTCGCCAGGTAACACGCCGCCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCGTAGCGATCCTGTGAGGCTTCCGCCAGACGCACAACGGCTTCGCTGTTCATTGCTTTCTGATGCCGCAACTGATACCACTCATGGTTGCCCGGCGTATTTTCCACATAAGGAAGATCGGTTTTGGTCCGATCACCGAT > CP009273/2913357‑2913649 | ccTTTGCATAAAGAAATGGCTTCATCAAGCAGCCATGCACCGTTGGGATCAACGGTAATCCGCGCATCCGGGAAGCGTTTCTTCAATGCACGAACAGTGTCGATTTCTTGCTCGCCAGGTAACACGCCGCCCTTAAGTTTGAAATAtt > 1:2435962/1‑148 (MQ=255) cTTTGCATAAAGAAATGGCTTCATCAAGCAGCCATGCACCGTTGGGATCAACGGTAATCCGCGCATCCGGGAAGCGTTTCTTCAATGCACGAACAGTGTCGATTTCTTGCTCGCCAGGTAACACGCCGCCCTTAAGTTTGAAATAttt > 1:1450346/1‑148 (MQ=255) cTTTGCATAAAGAAATGGCTTCATCAAGCAGCCATGCACCGTTGGGATCAACGGTAATCCGCGCATCCGGGAAGCGTTTCTTCAATGCACGAACAGTGTCGATTTCTTGCTCGCCAGGTAACACGCCGCCCTTAAGTTTGAAATAttt > 1:1766656/1‑148 (MQ=255) cATAAAGAAATGGCTTCATCAAGCAGCCATGCACCGTTGGGATCAACGGTAATCCGCGCATCCGGGAAGCGTTTCTTCAATGCACGAACAGTGTCGATTTCTTGCTCGCCAGGTAACACGCCGCCCTTAAGTTTGAAATATTTAAAGc > 1:565810/1‑148 (MQ=255) aTAAAGAAATGGCTTCATCAAGCAGCCATGCACCGTTGGGATCAACGGTAATCCGCGCATCCGGGAAGCGTTTCTTCAATGCACGAACAGTGTCGATTTCTTGCTCGCCAGGTAACACGGCGCCCTTTAGTTTGTAATATTTaattca > 1:1260770/1‑144 (MQ=255) aaaGAAATGGCTTCATCAAGCAGCCATGCACCGTTGGGATCAACGGTAATCCGCGCATCCGGGAAGCGTTTCTTCAATGCACGAACAGTGTCGATTTCTTGCTCGCCAGGTAACACGCCGCCCTTAAGTTTGAAATATTTAAAGCCGt > 1:3497515/1‑148 (MQ=255) aaaGAAATGGCTTCATCAAGCAGCCATGCACCGTTGGGATCAACGGTAATCCGCGCATCCGGGAAGCGTTTCTTCAATGCACGAACAGTGTCGATTTCTTGCTCGCCAGGTAACACGCCGCCCTTAAGTTTGAAATATTTAAAGCCGt > 2:1614006/1‑148 (MQ=255) aaaGAAATGGCTTCATCAAGCAGCCATGCACCGTTGGGATCAACGGTAATCCGCGCATCCGGGAAGCGTTTCTTCAATGCACGAACAGTGTCGATTTCTTGCTCGCCAGGTAACACGCCGCCCTTAAGTTTGAAATATTTAAAGCCGt > 2:1940004/1‑148 (MQ=255) aaGAAATGGCTTCATCAAGCAGCCATGCACCGTTGGGATCAACGGTAATCCGCGCATCCGGGAAGCGTTTCTTCAATGCACGAACAGTGTCGATTTCTTGCTCGCCAGGTAACACGCCGCCCTTAAGTTTGAAATATTTAAAGCCGTa > 2:2082158/1‑148 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |