| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 235,005 | C→A | 11.8% | T73T (ACG→ACT) ‡ | ykfM ← | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 235,005 | 0 | C | A | 11.8% | 475.1 / 9.7 | 219 | T73T (ACG→ACT) ‡ | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (60/119); new base A (34/3); total (96/123) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.09e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
ATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTG > CP009273/234858‑235152 | gTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaa < 1:605192/148‑1 (MQ=255) aTTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaagt < 1:1413754/148‑1 (MQ=255) aTTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaagt > 1:1031621/1‑148 (MQ=255) tGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAgtaagtaa > 2:2781311/1‑148 (MQ=255) gACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaa < 2:1566573/148‑1 (MQ=255) gACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaa < 2:1396/148‑1 (MQ=255) aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaaa > 2:3380238/1‑148 (MQ=255) aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaaa < 2:238564/148‑1 (MQ=255) atatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAA‑tt > 1:2911560/1‑148 (MQ=255) atCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAc > 2:1427763/1‑148 (MQ=255) ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACAt < 1:134994/148‑1 (MQ=255) tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGTATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGa > 2:2639635/1‑148 (MQ=255) gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAata < 1:2804216/148‑1 (MQ=255) gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAata < 2:3097234/148‑1 (MQ=255) cAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑ATACATGAATAtt > 2:713516/1‑148 (MQ=255) aaaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTTAGAATGATTTTATTATAGTTAGTAAAA‑TTAAATTAATAttt > 1:1968190/1‑148 (MQ=255) aaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATATTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTa > 2:2665612/1‑148 (MQ=255) aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaa > 2:366627/1‑148 (MQ=255) aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaa > 2:1464211/1‑148 (MQ=255) aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACGACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaaa < 2:3101097/148‑1 (MQ=255) ggAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaaaa < 1:794985/148‑1 (MQ=255) gAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTaaaaa > 2:263380/1‑148 (MQ=255) gAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTaaaaa > 2:2035264/1‑148 (MQ=255) aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATA‑TTAAAAAgg < 2:802997/148‑1 (MQ=255) tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTTAGAAATATTTTATTATAGTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAATGaa > 1:1616621/1‑148 (MQ=255) tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaa > 2:3481817/1‑148 (MQ=255) aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:2507719/148‑1 (MQ=255) aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:1939226/148‑1 (MQ=255) aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:1788078/148‑1 (MQ=255) aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:1717223/148‑1 (MQ=255) aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTTAAAATGaaa > 1:1300462/1‑148 (MQ=255) ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaaa < 2:1108274/148‑1 (MQ=255) aGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGAc > 2:3499782/1‑148 (MQ=255) gTGCTATTACTATAGTTATTATTAAAAATATAAGTGTTAGTTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGTTTTTATTATCGTAATTAAAT‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAt < 2:2102995/148‑1 (MQ=255) tATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTATGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGaaa < 2:1734352/148‑1 (MQ=255) tACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAAATATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTAAAATAATATTTAAAAATGAAAAACACAATAAAccc > 1:2404752/1‑147 (MQ=255) tACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGTTTAAGAATTATTTTTTTTTATTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGaaaaac > 1:632535/1‑145 (MQ=255) aCGATAGATATTATTAAAAATATATGAGTTATTTTTATTGTTTTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGTTTAATAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGa < 2:1352670/148‑1 (MQ=255) ctaTAGATATTATAAAAAATATAATTTTTCGCTTTTTTTTTATGTCTGTGGCTAAATTTACTACATTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTAAATTAATTTTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGaa < 1:1152749/146‑1 (MQ=255) aTAGCTATTATTAAAAATATAAGATTTAGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAACAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGc < 2:1961415/148‑1 (MQ=255) aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAAACGAAGc > 1:2333509/1‑148 (MQ=255) ttttttattaAAAATATTATTTTTAGTTTTTTTTTTTTTTGTGTGGCAATTTTTACTACCTTTTTTTTTTTTTTTAATATTTTTTTTTTTATGTTATTTAAAT‑TTAATTTAATTTTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGcaca < 1:3295797/144‑1 (MQ=255) aTTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAAAAATAATTTAATATCCTAACTAAAA‑AAACAATAAAAATTAAAAAATAAAAAGAAAATAAACACAAACACAGaa > 1:3040618/1‑148 (MQ=255) ttattaAAAATATATGTGTTAGATTTATTTTTATGTCTGTGGAGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAAt < 2:3366245/148‑1 (MQ=255) tAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATAGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGAAATGAAACCCAAGCACACAATc > 1:1849148/1‑148 (MQ=255) ttAAAAATATAAGAGTTAGCTTTATTGTTTTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTATCGTAATTAAAT‑TTACATGAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 2:783541/147‑1 (MQ=255) tAAAATTATAAGTTTTAGCTTTTTTTTTTTGTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTTTTATCTTAATTAAAT‑TTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc < 2:2970416/148‑1 (MQ=255) tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑ATAAATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAACCCAAGCACAGAAACaaa > 2:1315924/1‑147 (MQ=255) tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc > 2:749434/1‑148 (MQ=255) aaaTATACGCGTTCGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTAAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAtt < 1:875524/148‑1 (MQ=255) atatAATCGTTAGCTTTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTAGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtct < 2:3454182/148‑1 (MQ=255) atatAATAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtct < 2:528120/148‑1 (MQ=255) tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGAAATGAAAACGAAGCACAGAAACAAAATtctc > 1:3457068/1‑148 (MQ=255) taAGAGTTAGCTGTTTTTTTATGTCGGTGGCGAAATGGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAACAATTTTTTTTTTATCTTATGTANAA‑TTAAATCAATATTTAAAAAGTANAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCa < 1:211449/148‑1 (MQ=255) taAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAATGAAAAAGACATTAAACCCAAGCACAGAAAAAACAtaaacca > 1:3437078/1‑142 (MQ=255) ttAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATa > 2:2298247/1‑148 (MQ=255) ttAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTACATGTATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTATCCAAACATa > 1:759501/1‑148 (MQ=255) aGCTTTTTTTTTTTGTCTGTGGCGAATTTTACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaaa < 2:1614102/148‑1 (MQ=255) cTGTTTTGTTTTGACTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAat < 2:2869640/148‑1 (MQ=255) cTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATGATTTTATTATAGTTAGTAAAA‑TTAAAATAAAATTTAAAAAGTAAAACCACAAGAAAACCAACAACAAAAAAAACAATCAACAATCaaaaaaa > 1:2763442/1‑147 (MQ=255) aTTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt < 2:867200/148‑1 (MQ=255) tttttATGTCTGTGGCTAAATTTACTACCTTGGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTTTTATCTTATGTAAAA‑TTAATTTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTc < 2:1306505/145‑1 (MQ=255) tGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATTAAAACGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATAATAAAATAtttaa > 2:2830288/1‑146 (MQ=255) tATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTg > 2:573037/1‑148 (MQ=255) ttttgtgtgGCTAATTTTAATACCTTTTTTTTTTTTTTTAATATTTATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TAAATTTAATTTTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg < 1:2818954/143‑1 (MQ=255) ttGTCTGTGGATAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATATTTTTTTTTTTATATTAATTAAAA‑TTAAATTATTATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg < 1:988397/147‑1 (MQ=255) cTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAACCACAAAAAAAACATTATCACATCATAAAATAATTACGTGGAGCa > 1:2255066/1‑148 (MQ=255) ttgggCTAATTTTACTACCTTCTTTTTTTTTATAAATAATTTTTTTTTTATCTTAATAAAAT‑TTACTTTAATATTTAAAAAGAAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAt < 1:723735/145‑1 (MQ=255) gtgGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 2:1011639/148‑1 (MQ=255) cGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 2:1263220/148‑1 (MQ=255) agAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 2:2024182/147‑1 (MQ=255) aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGAGCATTTtattat > 2:2919101/1‑148 (MQ=255) aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGAGCATTTtattat > 2:1168042/1‑148 (MQ=255) ttGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTg > 2:1683658/1‑148 (MQ=255) cccTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGAAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAAtata < 2:3246507/147‑1 (MQ=255) tcttttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 2:454333/145‑1 (MQ=255) ttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTa > 2:2571364/1‑148 (MQ=255) ttttttATTAATAATTATTTTATTATC‑TAAATAAAATTTAAATTAATATTAAAAAAGAAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTaa < 1:1524820/148‑1 (MQ=255) ttttTATAAAGAATTATTTTTTTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAAc < 2:330512/148‑1 (MQ=255) ttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAAc > 1:2563878/1‑148 (MQ=255) tttaTTAATATTGATTTTTTTATCTTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAATCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTc < 1:3349797/145‑1 (MQ=255) tttaTTAATAATGATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTc < 2:834505/145‑1 (MQ=255) gATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCg > 1:754039/1‑148 (MQ=255) gATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCg > 1:754056/1‑148 (MQ=255) aTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCgg > 1:2565402/1‑148 (MQ=255) ttAATAATGTTTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt < 1:1999893/148‑1 (MQ=255) ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt > 2:2340985/1‑148 (MQ=255) tAAGAATGATTTTTTTATCTTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa < 2:117283/148‑1 (MQ=255) aGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaa > 1:467245/1‑148 (MQ=255) tGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc > 2:2265995/1‑148 (MQ=255) tttATTATCTTAATTAAAT‑TTAATTTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaag < 1:1700166/148‑1 (MQ=255) tttATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaag > 2:2077332/1‑148 (MQ=255) ttatCTTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGc < 1:3157211/148‑1 (MQ=255) tatCTTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCa < 1:524057/148‑1 (MQ=255) tatCGTAATTAATA‑TTAATTGAATTTTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCa < 1:3499782/148‑1 (MQ=255) tatCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCa > 1:1880475/1‑148 (MQ=255) atCTTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAt < 2:1551665/148‑1 (MQ=255) atCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAt > 1:2660882/1‑148 (MQ=255) cGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTg > 1:2788156/1‑148 (MQ=255) cGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTg > 1:2247752/1‑148 (MQ=255) | ATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTG > CP009273/234858‑235152 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |