| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 235,019 | C→A | 24.3% | V69L (GTA→TTA) | ykfM ← | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 235,019 | 0 | C | A | 24.3% | 394.8 / 34.7 | 225 | V69L (GTA→TTA) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (77/86); new base A (24/38); total (101/124) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
ATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAA > CP009273/234872‑235165 | tCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTCGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACa < 2:851871/148‑1 (MQ=255) ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGGGAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACAt < 1:2731459/148‑1 (MQ=255) cTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATg < 1:722101/148‑1 (MQ=255) tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGa > 2:2640858/1‑148 (MQ=255) tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAat < 2:3313659/148‑1 (MQ=255) tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAat < 2:1572297/148‑1 (MQ=255) gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAata < 2:1349986/148‑1 (MQ=255) gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAata < 2:3097234/148‑1 (MQ=255) aaaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTTAGAATGATTTTATTATAGTTAGTAAAA‑TTAAATTAATAttt > 1:1968190/1‑148 (MQ=255) aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaa > 2:1464420/1‑148 (MQ=255) aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTTTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑ATAAATGTATATTTaa > 1:2363329/1‑148 (MQ=255) aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGGTTAAGAATGATTTTATTATAGTTATTAAAA‑TTAAAATAAAATTTaaa > 1:2230518/1‑148 (MQ=255) aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACGACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaaa < 2:3101097/148‑1 (MQ=255) ggAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaaaa < 1:794985/148‑1 (MQ=255) gAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTaaaaa > 2:263380/1‑148 (MQ=255) gAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTaaaaa > 2:2035264/1‑148 (MQ=255) tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAATAATTATTTTTTTATAGTAATTAAAA‑ATAAATGAATATTTAAAAATGaa > 1:75545/1‑148 (MQ=255) tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTTAGAAATATTTTATTATAGTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAATGaa > 1:1616621/1‑148 (MQ=255) aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:1939226/148‑1 (MQ=255) aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:1788078/148‑1 (MQ=255) aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:2068896/148‑1 (MQ=255) aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 2:2763918/148‑1 (MQ=255) aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:750415/148‑1 (MQ=255) ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaaa < 2:1108274/148‑1 (MQ=255) aaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTGAGCTGTATTGTTTTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGa < 2:827480/148‑1 (MQ=255) gTGCTATTACTATAGTTATTATTAAAAATATAAGTGTTAGTTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGTTTTTATTATCGTAATTAAAT‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAt < 2:2102995/148‑1 (MQ=255) gCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGa > 2:56462/1‑148 (MQ=255) tACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCg > 1:3491071/1‑148 (MQ=255) tACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGTTTAAGAATTATTTTTTTTTATTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGaaaaac > 1:632535/1‑145 (MQ=255) cGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGaa > 2:1454207/1‑148 (MQ=255) gATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAAACGAAg > 1:3439170/1‑148 (MQ=255) aTAGCTATTATTAAAAATATAAGATTTAGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAACAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGc < 2:1961415/148‑1 (MQ=255) tAGATATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTTTTTTTTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGca < 2:1426249/148‑1 (MQ=255) gCTTTTAGTAAAAATATATGTGTTAGCTGTTTTGTTTTGTGTGTGGCTATATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGATTTTTTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGcaca < 1:276953/148‑1 (MQ=255) aTTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAAAAATAATTTAATATCCTAACTAAAA‑AAACAATAAAAATTAAAAAATAAAAAGAAAATAAACACAAACACAGaa > 1:3040618/1‑148 (MQ=255) ttattaAAAATATATGAGTTTGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGAATACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAAt < 2:3366924/148‑1 (MQ=255) ttAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTTAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGaaa > 1:1714698/1‑147 (MQ=255) tAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTTTTTTAGAATTATTTTTTTTTAGTTAGTAAAA‑TTAAATTAATAATTTAAAATGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACACaaac > 1:3285728/1‑146 (MQ=255) tAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATAGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGAAATGAAACCCAAGCACACAATc > 1:1849148/1‑148 (MQ=255) attAAAAATATAAGAGTTAGCTTTTTTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACATTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCa < 2:1404346/146‑1 (MQ=255) ataaaaaaTATAAGATTTTGCTTTTTTGTTTTGTATGTGGCGAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCa < 2:2381652/145‑1 (MQ=255) ttAAAAATATAAGTTTTAGTTGTTTTTTTTTGTCTGGGGCGAAATTTACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCTTAATTAAAT‑TTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 2:61450/147‑1 (MQ=255) ttAAAAATATAAGATTTCGCTGTTTTTTTTTGTGTGTGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTATTATTTTTTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTAATTGAATTTTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 1:1108969/147‑1 (MQ=255) ttAAAAATATAAGAGTTAGCTTTATTGTTTTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTATCGTAATTAAAT‑TTACATGAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 2:783541/147‑1 (MQ=255) gTAAAATTATATGATTTTGATGTATTGTTATGTCTGTGGATAAATTGAATACATTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAT‑TTACATGAATTTTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 2:2817885/148‑1 (MQ=255) tAAAATTATAAGTTTTAGCTTTTTTTTTTTGTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTTTTATCTTAATTAAAT‑TTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc < 2:2970416/148‑1 (MQ=255) aaaaaTATTAGATTTAGCTTTTTTTTTTTGTCTGTGGCTAATTTTAATACTTTCTTTTTTTTTTTTAAAATTTTTTTTTTTATCTTAATTAAAA‑TTAAATCAATATTAAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 1:2465478/148‑1 (MQ=255) aaaTATACGCGTTCGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTAAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAtt < 1:875524/148‑1 (MQ=255) atatAATCGTTAGCTTTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTAGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtct < 2:3454182/148‑1 (MQ=255) atatAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGAAATGAAACCGAAGCACAGAAACAACAAtct > 1:1169338/1‑148 (MQ=255) atatAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTACAAGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGAATCAACATtct > 2:716003/1‑148 (MQ=255) atgagTTTGGTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCaa < 2:1293368/146‑1 (MQ=255) agagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGAATCAACAATATCCAAt > 1:2878156/1‑148 (MQ=255) aGCTTTTTTTTTTTGTCTGTGGCGAATTTTACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaaa < 2:1614102/148‑1 (MQ=255) ttGTATTGTTATGTATGTGGCTAATTTTAATACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTAAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAat < 2:3457926/147‑1 (MQ=255) cTGTTTTGTTTTGACTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAat < 2:2869640/148‑1 (MQ=255) gttttGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat < 2:2928290/145‑1 (MQ=255) aTTTTTATGTCTGTGTAGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt < 2:3486249/148‑1 (MQ=255) tGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTGAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAACCCCAGCACCGAATAAACATTCTCCAATAATAAAAAAtttac > 1:2253714/1‑146 (MQ=255) gTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCg > 2:427674/1‑148 (MQ=255) tttgtgtgtgGCTAAATTGACTACATTCGTTTTTTTGATTAATATTGATTTTATTATCTTAATTAAAT‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTg < 2:758765/146‑1 (MQ=255) ttttgtgtgGCTAATTTTAATACCTTTTTTTTTTTTTTTAATATTTATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TAAATTTAATTTTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg < 1:2818954/143‑1 (MQ=255) ttGTCTGTGGATAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATATTTTTTTTTTTATATTAATTAAAA‑TTAAATTATTATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg < 1:988397/147‑1 (MQ=255) gtgGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 2:1011639/148‑1 (MQ=255) cGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 2:1263220/148‑1 (MQ=255) agAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 2:2024182/147‑1 (MQ=255) aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCCAAGCACAGAATCAACAATATACAATCAAAAAAAATTTACGGGGAGCATTTtattat > 1:574978/1‑148 (MQ=255) aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGAGCATTTtattat > 2:2919101/1‑148 (MQ=255) aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAATAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCAAATAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGAGCATTTtattat > 2:2224706/1‑148 (MQ=255) ttGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTg > 2:1683659/1‑148 (MQ=255) cccTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGAAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAAtata < 2:3246507/147‑1 (MQ=255) ccTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATag < 2:1314530/148‑1 (MQ=255) ttttttttATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGACACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 2:1169338/148‑1 (MQ=255) tttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt > 2:516622/1‑148 (MQ=255) tttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 2:2333509/148‑1 (MQ=255) ttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTa > 2:2571364/1‑148 (MQ=255) ttttttATTAATAATTATTTTATTATC‑TAAATAAAATTTAAATTAATATTAAAAAAGAAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTaa < 1:1524820/148‑1 (MQ=255) ttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAAc > 1:2563878/1‑148 (MQ=255) tttaTTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTc < 1:3347759/145‑1 (MQ=255) ttGATTAAGAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAT‑TTACATGAATTTTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTc < 2:3511489/148‑1 (MQ=255) gATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCg > 1:754051/1‑148 (MQ=255) aTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCgg > 1:2565402/1‑148 (MQ=255) ttAATAATTATTTTTTTTTCTTAATTAAAT‑TTAAATGAATATTTAAAAAGCAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt < 1:366627/148‑1 (MQ=255) ttAAGATTTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt < 1:2296686/148‑1 (MQ=255) aaTGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaaa > 1:1386963/1‑148 (MQ=255) tGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc > 2:2265995/1‑148 (MQ=255) tttttATTATCTTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACaa < 1:1315924/147‑1 (MQ=255) tttATTATCTTAATTAAAT‑TTAATTTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaag < 1:1700166/148‑1 (MQ=255) attttCTTAATTAAAT‑TTAAATTAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaagaag < 1:3380238/148‑1 (MQ=255) ttatCTTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGc < 1:3157211/148‑1 (MQ=255) tatCTTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCa < 1:524057/148‑1 (MQ=255) tatCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCa > 1:1880475/1‑148 (MQ=255) atCTTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAt < 2:3291626/148‑1 (MQ=255) atCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAt > 1:2660882/1‑148 (MQ=255) cGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTg > 1:2789550/1‑148 (MQ=255) gtaaAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGc > 2:2072559/1‑148 (MQ=255) taaAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCa > 2:1140512/1‑148 (MQ=255) aaa‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAGGAAGCATTGAATGCAgg < 2:788291/148‑1 (MQ=255) a‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGa > 1:458497/1‑148 (MQ=255) ttACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGaa > 2:871979/1‑148 (MQ=255) | ATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCAGGGAAAA > CP009273/234872‑235165 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |