Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,212,264 | G→T | 70.4% | H58N (CAC→AAC) | aer ← | fused signal transducer for aerotaxis sensory component/methyl accepting chemotaxis component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,212,264 | 0 | G | T | 70.4% | 309.0 / 268.8 | 277 | H58N (CAC→AAC) | aer | fused signal transducer for aerotaxis sensory component/methyl accepting chemotaxis component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/49); new base T (102/93); total (135/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.67e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
CCTCGCGCACCATCGGTACCGCATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGC > CP009273/3212120‑3212409 | tCGCGCACCATCGGTACCGCATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCa > 2:448697/1‑148 (MQ=255) cgcACCATCGGTACCGCATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCa < 1:1740173/148‑1 (MQ=255) cACCATCGGTACCGCATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCAtg < 2:2536142/148‑1 (MQ=255) aCCATCGGTACCGCATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCAtgt > 2:2918060/1‑148 (MQ=255) aCCATCGGTACCGCATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCAtgt > 2:954463/1‑148 (MQ=255) cATCGGTACCGCATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCAtgttg > 2:1185201/1‑148 (MQ=255) cGGTACCGCATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGc > 1:463124/1‑148 (MQ=255) cGGTACCGCATGGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGc < 2:603748/148‑1 (MQ=255) gTACCGCATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCgg < 2:346238/148‑1 (MQ=255) gTACCGCATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCgg < 2:1359831/148‑1 (MQ=255) gTACCGCATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCgg < 2:342248/148‑1 (MQ=255) tACCGCATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGc < 1:633122/148‑1 (MQ=255) aCCGCATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCt > 1:703934/1‑148 (MQ=255) aCCGCATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCt < 1:1954088/148‑1 (MQ=255) cATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGccc > 2:2745335/1‑148 (MQ=255) cATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGccc < 1:2255800/148‑1 (MQ=255) aTTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCCGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCt < 1:2441339/148‑1 (MQ=255) gCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTa < 2:229025/148‑1 (MQ=255) gCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTa > 1:490928/1‑148 (MQ=255) cccGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTaa < 1:1732129/148‑1 (MQ=255) cGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAAct < 1:118288/148‑1 (MQ=255) cGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAAct > 2:2689123/1‑148 (MQ=255) ataatGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAg > 2:1939530/1‑148 (MQ=255) ataatGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAg < 2:3353746/148‑1 (MQ=255) taatGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAgg > 2:8309/1‑148 (MQ=255) aatGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGt > 2:3135105/1‑148 (MQ=255) atGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGta < 1:2137257/148‑1 (MQ=255) atGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGta < 1:1699538/148‑1 (MQ=255) atGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGta < 1:371453/148‑1 (MQ=255) tGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGtat > 1:2524634/1‑148 (MQ=255) ggTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGtata > 2:1397188/1‑148 (MQ=255) gTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACAAATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCAGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGAAAGGTATAg > 1:2884831/1‑148 (MQ=255) cACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGcc > 1:1017926/1‑148 (MQ=255) aCCATTTTTGCGGCTATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCg < 2:2121815/148‑1 (MQ=255) ttttGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCAc > 2:743574/1‑148 (MQ=255) tttGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCAcc < 2:31983/148‑1 (MQ=255) gcgATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGGTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTCTAGCCGCTCACCTGcaca > 2:637560/1‑148 (MQ=255) gATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACaaa < 1:1243488/148‑1 (MQ=255) ttttCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAgt > 2:2237923/1‑148 (MQ=255) ttttCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAgt < 1:2646780/148‑1 (MQ=255) tttCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAgtg < 1:1848373/148‑1 (MQ=255) cACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCa < 1:762828/148‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCAt > 2:1120756/1‑148 (MQ=255) aCGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCAt < 1:1278193/148‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCAt < 1:2326108/148‑1 (MQ=255) cGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCAtt > 1:1564993/1‑148 (MQ=255) gATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCACACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTa < 1:1982794/148‑1 (MQ=255) aTGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAg < 1:1188772/148‑1 (MQ=255) tGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGc > 2:581527/1‑148 (MQ=255) tGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGc > 2:739863/1‑148 (MQ=255) gCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCa < 1:2135399/148‑1 (MQ=255) gCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCa < 2:1437927/148‑1 (MQ=255) ccGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCAt > 1:1830338/1‑148 (MQ=255) cGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATg > 2:822264/1‑148 (MQ=255) cGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATACGTGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATg < 1:1008160/148‑1 (MQ=255) gCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGa < 1:3135124/148‑1 (MQ=255) cTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAg < 2:1880814/148‑1 (MQ=255) tCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGt < 1:3408274/148‑1 (MQ=255) ccAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGTCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTg > 1:2782691/1‑148 (MQ=255) aGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGat > 1:84165/1‑148 (MQ=255) aGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGat < 2:1985336/148‑1 (MQ=255) gggCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGata > 2:234320/1‑148 (MQ=255) gggCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGata < 2:3329022/148‑1 (MQ=255) ggCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCAACAGTGagat > 2:2058514/1‑148 (MQ=255) 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cccTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCtt < 2:2658611/148‑1 (MQ=255) cccTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCtt < 2:2824288/148‑1 (MQ=255) ttttttCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGc > 1:879451/1‑148 (MQ=255) ttttCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAg > 2:1472853/1‑148 (MQ=255) cAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCg < 1:297597/148‑1 (MQ=255) 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ccACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGAc > 1:2775124/1‑148 (MQ=255) cacaTATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACa < 2:1710025/148‑1 (MQ=255) caTATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATc > 1:1553255/1‑148 (MQ=255) tatCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCag > 1:732028/1‑148 (MQ=255) atCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCaga < 1:1987593/148‑1 (MQ=255) 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gCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCgg > 1:531019/1‑148 (MQ=255) cATATCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCggg > 2:1782105/1‑148 (MQ=255) tCCGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATAGTCCGCCAGCGGGGTAt < 1:2689142/148‑1 (MQ=255) ccGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTAtt < 1:2613775/148‑1 (MQ=255) ccGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTAtt > 2:685890/1‑148 (MQ=255) cGGGTTACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTAttt < 2:1523100/148‑1 (MQ=255) | CCTCGCGCACCATCGGTACCGCATTGGCCCGCACCCAATAATGGTCACCATTTTTGCGGCGATTTTTCACGATGCCGCTCCAGGGCTCCCCTTTTTTCAGGGTGAACCACATATCCGCAAACGCCGCTTTTGGCATATCCGGGTGACGCACCATGTTGTGCGGCTGCCCTTGTAACTCTTGCAAGGTATAGCCGCTCACCTGCACAAAAGTGTCATTAGCATGAGTGATATAGCTTTGCAGATCGGTAGTGGACATCAGAGTGGTATCGTCCGCCAGCGGGGTATTTTGC > CP009273/3212120‑3212409 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |