| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,373,441 | 0 | A | C | 70.9% | 455.6 / 162.1 | 230 | intergenic (‑85/‑109) | yhcM/yhcB | putative AFG1‑like family P‑loop ATPase/DUF1043 family inner membrane‑anchored protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/30); new base C (85/78); total (122/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 | |||||||||||
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |