| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,519,657 | G→T | 100% | intergenic (‑149/‑171) | nudE ← / → yrfF | adenosine nucleotide hydrolase; substrates include Ap3A, Ap2A, ADP‑ribose, NADH/inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,519,657 | 0 | G | T | 100.0% | 762.1 / ‑6.7 | 233 | intergenic (‑149/‑171) | nudE/yrfF | adenosine nucleotide hydrolase; substrates include Ap3A, Ap2A, ADP‑ribose, NADH/inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (131/101); total (132/101) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
GGGATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGC > CP009273/3519512‑3519799 | gggATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGa > 1:3086758/1‑148 (MQ=255)gggATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGa > 2:3295909/1‑148 (MQ=255)gggATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGa < 1:1553800/148‑1 (MQ=255) ggATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGaa < 2:885002/148‑1 (MQ=255) ggATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGaa > 2:1018690/1‑148 (MQ=255) ggATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGaa > 1:2372309/1‑148 (MQ=255) gATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAATTTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAAt > 2:2229829/1‑148 (MQ=255) cTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTg > 2:1278600/1‑148 (MQ=255) cTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTg > 2:1721224/1‑148 (MQ=255) tATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGc < 2:547867/148‑1 (MQ=255) aTGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCt > 1:2903163/1‑148 (MQ=255) gCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGa < 2:1030256/148‑1 (MQ=255) gCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGa > 2:3034100/1‑148 (MQ=255) tgtgAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGata > 1:1556401/1‑148 (MQ=255) gtgAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGatat > 1:2411840/1‑148 (MQ=255) gtgAAATCAGCGGTTATTGTGAGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGAATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATTAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGatat < 1:2156246/148‑1 (MQ=255) aaaTCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTcc > 2:2143307/1‑148 (MQ=255) aTCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGc > 1:3515783/1‑148 (MQ=255) aTCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGc > 1:3515724/1‑148 (MQ=255) tCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGcc < 1:2792714/148‑1 (MQ=255) aGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCtt < 2:1310010/148‑1 (MQ=255) gtttATTGTTCTATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCag < 2:1556401/146‑1 (MQ=255) ttATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCagag < 1:2192585/148‑1 (MQ=255) ttATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCagag < 1:3327210/148‑1 (MQ=255) ttATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCagag < 1:1040022/148‑1 (MQ=255) aTTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCGGATATTCCGCCTTCAGAggg > 1:3310524/1‑148 (MQ=255) ttGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGt > 1:2215804/1‑148 (MQ=255) ttGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGt < 1:1819135/148‑1 (MQ=255) ttGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGt < 1:393938/148‑1 (MQ=255) ttGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGt > 1:447666/1‑148 (MQ=255) tgtgCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGtt < 2:1594391/148‑1 (MQ=255) gCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGc > 1:1420006/1‑148 (MQ=255) gCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGc < 2:1228503/148‑1 (MQ=255) tatCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATg > 1:3452515/1‑148 (MQ=255) tCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGAt > 1:1140987/1‑148 (MQ=255) tCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGAt < 1:1262532/148‑1 (MQ=255) tCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGAt < 2:751910/148‑1 (MQ=255) gACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAg > 2:2436090/1‑148 (MQ=255) cTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTa > 1:727552/1‑148 (MQ=255) tttCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTAc > 1:2637481/1‑148 (MQ=255) cGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACtgt < 1:1325678/148‑1 (MQ=255) ggCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACtgtg < 2:3480271/148‑1 (MQ=255) aTGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGAtgt > 2:2572881/1‑148 (MQ=255) tgAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCt < 2:2841624/148‑1 (MQ=255) tgAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCt > 2:47953/1‑148 (MQ=255) gAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCtt > 2:2485597/1‑148 (MQ=255) aaTTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGTATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTGACTGTGATGTGCTTa > 2:1824874/1‑148 (MQ=255) aTTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTaa < 2:3086800/148‑1 (MQ=255) ttGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAat > 2:1300355/1‑148 (MQ=255) aTGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAatgatg < 1:377368/148‑1 (MQ=255) aTGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAatgatg < 2:301252/148‑1 (MQ=255) aTGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAatgatg > 2:1037611/1‑148 (MQ=255) ttATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTc > 1:2872039/1‑148 (MQ=255) tATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCa > 1:3376859/1‑148 (MQ=255) tACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGtt > 1:3091988/1‑148 (MQ=255) aCATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTa > 2:3282316/1‑148 (MQ=255) ttATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACt > 2:412957/1‑148 (MQ=255) ttAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTg > 2:3025232/1‑148 (MQ=255) ttAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTg < 2:2966448/148‑1 (MQ=255) ttAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTg < 2:432425/148‑1 (MQ=255) taataaATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGc > 1:828522/1‑148 (MQ=255) taataaATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGc > 1:3372231/1‑148 (MQ=255) taataaATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGc > 2:3419463/1‑148 (MQ=255) taataaATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGc > 1:1633555/1‑148 (MQ=255) taataaATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGc > 2:1989610/1‑148 (MQ=255) taataaATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGc < 1:1291955/148‑1 (MQ=255) taaataaTCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGa > 2:2348637/1‑148 (MQ=255) aaataaTCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATCTTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGAt > 2:2736420/1‑148 (MQ=255) aaataaTCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGAt > 2:1833805/1‑148 (MQ=255) aaataaTCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGAt < 1:3408935/148‑1 (MQ=255) taatCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGc < 1:3100885/148‑1 (MQ=255) aatCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGcc > 2:267840/1‑148 (MQ=255) cGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAAc > 2:2210798/1‑148 (MQ=255) cGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAAc > 1:3047837/1‑148 (MQ=255) tcaaatcaaaTTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAg < 2:115703/148‑1 (MQ=255) tcaaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCTCCTTCAGAGGGTTTGCTATTATCAGCTGTTACTGTGATGTGATAAATGATGCTAAAGTTAAACTCAACTCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCa > 2:2085305/1‑148 (MQ=255) caaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTTCTTAATGATGATAAAGTTAAACTCCACCATTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCAt > 2:2020616/1‑148 (MQ=255) aaatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATg < 2:3376859/148‑1 (MQ=255) aatTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGt < 1:2701211/148‑1 (MQ=255) ttAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTAt < 1:2860185/148‑1 (MQ=255) tAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTAtt < 1:559442/148‑1 (MQ=255) aaGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATtgtg > 1:102044/1‑148 (MQ=255) aGTCAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTgtgt < 1:694986/148‑1 (MQ=255) cAATAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCg > 1:2955481/1‑148 (MQ=255) tAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGTCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTg < 1:2142658/148‑1 (MQ=255) tAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTg > 2:1123371/1‑148 (MQ=255) tAGGTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTg > 1:2614333/1‑148 (MQ=255) ggTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCg < 1:2179935/148‑1 (MQ=255) gTTGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGa > 1:2635704/1‑148 (MQ=255) ttGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCTGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGAc > 2:3294038/1‑148 (MQ=255) tGAAATAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACt < 1:492655/148‑1 (MQ=255) aTAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGAcc > 2:1840544/1‑148 (MQ=255) aTAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGAcc < 2:448055/148‑1 (MQ=255) tAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCa < 2:3037402/148‑1 (MQ=255) tAACTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCa < 2:763060/148‑1 (MQ=255) aCTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACg > 1:594007/1‑148 (MQ=255) aCTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACg > 1:330152/1‑148 (MQ=255) aCTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACg > 1:102585/1‑148 (MQ=255) cTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGc < 1:196033/148‑1 (MQ=255) cTCCATGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGc < 1:1721224/148‑1 (MQ=255) | GGGATCTATGCTGTGAAATCAGCGGTTATTGTGCGATATCGGACACGCTTTCGGCAATGTGAATTGCATGTTATTTACATTTATGTAACTTAATAAATAATCGTCCTCAAATCAAATTAAAAGTCAATAGGTTGAAATAACTCCAGGAATTTGCTGATATTCCGCCTTCAGAGGGTTTGCTATGATCAGCGGTTACTGTGATGTGCTTAATGATGCTCAAGTTAAACTCCACGCTTGCCGATAGCCAACCGCAGAATCATGTATTGTGTCCGGTGCGACTGACCACGC > CP009273/3519512‑3519799 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |