Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,738,431 | C→A | 100% | P90T (CCA→ACA) | yiaN → | 2,3‑diketo‑L‑gulonate TRAP transporter large permease protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,738,431 | 0 | C | A | 98.9% | 631.9 / ‑1.8 | 195 | P90T (CCA→ACA) | yiaN | 2,3‑diketo‑L‑gulonate TRAP transporter large permease protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base A (105/87); total (106/89) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.93e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
ATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGG > CP009273/3738287‑3738575 | aTCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAg > 1:3327023/1‑148 (MQ=255) tCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAgg < 2:2233682/148‑1 (MQ=255) tCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAgg > 2:3255286/1‑148 (MQ=255) cATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGc < 1:24044/148‑1 (MQ=255) cATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGc > 1:2323430/1‑148 (MQ=255) acaAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGTAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCgggctg > 1:721274/1‑148 (MQ=255) acaAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCgggctg > 1:290874/1‑148 (MQ=255) caAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGGTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCGTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGTAACTGGTGGGGCCTAAAACAGGCgggctgg > 1:3266908/1‑148 (MQ=255) aaaCGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTGTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCgggctggg > 1:1011757/1‑148 (MQ=255) aaaCGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCgggctggg > 1:1011884/1‑148 (MQ=255) aaCGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCgggctgggc < 2:2585832/148‑1 (MQ=255) cGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTGTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTa > 1:2722640/1‑148 (MQ=255) cGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTa > 2:1996453/1‑148 (MQ=255) cTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACg < 2:3119556/148‑1 (MQ=255) cTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACg < 2:2803958/148‑1 (MQ=255) cTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACg < 1:274863/148‑1 (MQ=255) gTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCg > 2:2009208/1‑148 (MQ=255) cGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTg > 2:1159057/1‑148 (MQ=255) ggAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGc < 2:313915/148‑1 (MQ=255) aTAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGc < 2:2881088/148‑1 (MQ=255) aTAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGc < 2:1130850/148‑1 (MQ=255) aTAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGc > 1:2461821/1‑148 (MQ=255) tAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCt < 2:1853445/148‑1 (MQ=255) aGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTa > 1:2040491/1‑148 (MQ=255) aGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTa > 2:2049991/1‑148 (MQ=255) aGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTa > 2:3197320/1‑148 (MQ=255) gCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTAt > 1:1437267/1‑148 (MQ=255) gCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTAt < 2:23318/148‑1 (MQ=255) gCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTAt < 2:23251/148‑1 (MQ=255) cTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATg < 1:3362525/148‑1 (MQ=255) tctcCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGAt < 1:1111179/148‑1 (MQ=255) tctcCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGAt < 1:2861789/148‑1 (MQ=255) tcCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTa < 1:1141597/148‑1 (MQ=255) cccTGCTGGCGATTCCGTTCTTTTTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTTACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACATGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTAt > 1:2077298/1‑148 (MQ=255) cccTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTTTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTAt < 2:293645/148‑1 (MQ=255) tgGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGTTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAg < 2:2951808/148‑1 (MQ=255) tgGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAg < 1:954925/148‑1 (MQ=255) tgGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAg < 2:3081668/148‑1 (MQ=255) tgGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAg < 2:2951472/148‑1 (MQ=255) ggCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGc < 1:2712440/148‑1 (MQ=255) gCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGcc < 1:764751/148‑1 (MQ=255) cGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCt < 2:1792626/148‑1 (MQ=255) tCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCt < 1:2342696/148‑1 (MQ=255) tCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCt > 1:37318/1‑148 (MQ=255) gTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGt < 1:3032876/148‑1 (MQ=255) ttCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGtt < 1:1846101/148‑1 (MQ=255) ttCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCAGGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGtt < 2:2384918/148‑1 (MQ=255) tCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTc > 1:1659482/1‑148 (MQ=255) ttGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGc < 1:3420423/148‑1 (MQ=255) cTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTg < 2:1893717/148‑1 (MQ=255) cTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTg > 1:3124066/1‑148 (MQ=255) gCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGGTCTGCCGTTGCgg > 2:3435087/1‑148 (MQ=255) ggTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCAGGTTCTGCCGTTGCGGATa < 2:52879/148‑1 (MQ=255) tGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATAcc > 2:1605271/1‑148 (MQ=255) gAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATAccg > 2:103172/1‑148 (MQ=255) gAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAACTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATAccg > 2:720470/1‑148 (MQ=255) aaaTCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATAccgc > 1:1963972/1‑148 (MQ=255) aaaTCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATAccgc > 2:132484/1‑148 (MQ=255) aaTCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATAccgcc > 1:1414883/1‑148 (MQ=255) aTCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATAccgccg > 1:304588/1‑148 (MQ=255) tCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATAccgccgc > 2:671658/1‑148 (MQ=255) aTGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATAccgctgccg > 1:238523/1‑148 (MQ=255) aTGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATAccgccgccg > 1:237861/1‑148 (MQ=255) aTGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATAccgccgccg < 1:1809348/148‑1 (MQ=255) aTGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATAccgccgccg > 2:2989994/1‑148 (MQ=255) tGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGt > 2:1786720/1‑148 (MQ=255) tGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGt > 1:2431315/1‑148 (MQ=255) tGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGt < 1:824493/148‑1 (MQ=255) tGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGt > 1:67732/1‑148 (MQ=255) aTGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGc > 2:1527774/1‑148 (MQ=255) aTGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGc > 2:2810620/1‑148 (MQ=255) ggcggcTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGctc > 2:23519/1‑148 (MQ=255) gcTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACt > 1:641011/1‑148 (MQ=255) gcTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACt > 2:208663/1‑148 (MQ=255) cTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTg < 1:2303084/148‑1 (MQ=255) cTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTg < 1:537348/148‑1 (MQ=255) aaaaCGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCg < 1:1302450/148‑1 (MQ=255) aaaCGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCga < 2:291632/148‑1 (MQ=255) aaaCGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCga < 2:290874/148‑1 (MQ=255) aCGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCgatg < 2:927089/148‑1 (MQ=255) cGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCgatga > 2:1457875/1‑148 (MQ=255) cGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCgatga < 1:3043529/148‑1 (MQ=255) gCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCgatgat < 2:789335/148‑1 (MQ=255) ttgttgACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATgcg > 1:2014676/1‑148 (MQ=255) aCCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAgcgc > 2:3297641/1‑148 (MQ=255) cGATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGACGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATTCCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTa < 1:3228433/148‑1 (MQ=255) gATGAAACTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTAt < 1:3435087/148‑1 (MQ=255) aaaCTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCgg < 1:1688821/148‑1 (MQ=255) aCTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTc > 2:2601697/1‑148 (MQ=255) aCTGGTGGGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTc < 1:2278644/148‑1 (MQ=255) ggtggGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAAc < 1:906054/148‑1 (MQ=255) gggggggCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAAc < 1:1928083/145‑1 (MQ=255) gtggGGCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAAcc > 1:790805/1‑148 (MQ=255) gggCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCggg > 2:27391/1‑148 (MQ=255) gggCATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCggg < 2:429489/148‑1 (MQ=255) cATAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGggcgg > 1:3256681/1‑148 (MQ=255) aTAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGggcggc > 2:2843064/1‑148 (MQ=255) tAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGgcggcg > 1:3225139/1‑148 (MQ=255) tAAAACAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGgcggcg > 1:1534881/1‑148 (MQ=255) aaaaCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGcggcgg < 1:2367382/148‑1 (MQ=255) | ATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGCGGGCGGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGG > CP009273/3738287‑3738575 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |