Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 3,786,682 | C→A | 9.8% | C121F (TGT→TTT) | yibB ← | YibB family protein, function unknown |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 3,786,682 | 0 | C | A | 9.8% | 570.0 / 8.5 | 216 | C121F (TGT→TTT) | yibB | YibB family protein, function unknown |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (89/98); new base A (7/22); total (96/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.59e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
TTACTTTCATCAAATGGGAAATCCCAAATTTTCAATCCTCGAGTTACATTTGGCTTATGGCAATAGCCAAAATCTATCCACGCAACAAGAGGCGTTTTCACTAAGCCCATGTTGATAGCTTTATTTACAAAATAGGCCTTAAGGTTACATACCAAAACATACTCTGGTGACCAGTACTCTGGGTTTTTTAATTGTCGAGGCTCAAGTCTATTTGTAAACGACTCATCTTTTTGAATTTTTTCGATACGACTTCTGATATATCTAAATTTCTTTTTTATATCGATAACGATAACCG > CP009273/3786535‑3786829 | tACTTTCATCAAATGGGAAATCCCAAATTTTCAATCCTCGAGTTACATTTGGCTTATGGCAATAGCCAAAATCTATCCACGCAACAAGAGGCGTTTTCACTAACCCCAAGTTGATAGCTTTATTTAAAAAATAGTCCATAAGGTTACa > 1:2466895/1‑148 (MQ=255) aCTTTCATCAATTGTGAAATCCCAAATTTTCAATCCTCGAGTTACATTTGGCTTATGGCAATAGCCAAAATCTATCCACGCAACAAGAGGCGTTTTCACTAAGCCCATGTTGATAGCTTTATTTACAAAATAGGCCTTAAGGTTACAt < 2:2276083/148‑1 (MQ=255) catcaAATGGGAAATCCCAAATTTTCAATCCTCGAGTTACATTTGGCTTATGGCAATAGCCAAAATCTATCCACGCAACAAGAGGCGTTTTCACTAAGCCCATGTTGATAGCTTTATTTACAAAATAGGCCTTAAGGTTACATACCaa < 2:1843524/148‑1 (MQ=255) tcaAATGGGAAATCCCAAATTTTCAATCCTCGAGTTACATTTGGCTTATGGCAATAGCCAAAATCTATCCACGCAACAAGAGGCGTTTTCACTAAGCCCATGTTGATAGCTTTATTTACAAAATAGGCCTTAAGGTTACATACCaaaa < 1:295568/148‑1 (MQ=255) caAATGGGAAATCCCAAATTTTCAATCCTCGAGTTACATTTGGCTTATGGCAATAGCCAAAATCTATCCACGCAACAAGAGGCGTGTTCACTAAGCCCATGTTGATAGCTTTATTTACAAAATAGGCCTTAAGGTTACATACCAAAAc > 1:3045639/1‑148 (MQ=255) aaTGGGAAATCCCAAATTTTCAATCCTCGAGTTACATTTGGCTTATGGCAATAGCCAAAATCTATCCACGCAACAAGAGGCGTTTTCACTAAGCCCATGTTGATAGCTTTATTTACAAAATAGGCCTTAATGTTACATACCAAAACAt > 1:1074664/1‑148 (MQ=255) gggAAATCCCAAATTTTCAATCCTCGAGTTACATTTGGCTTATGGCAATAGCCAAAATCTATCCACGCAACAAGAGGCGTTTTCACTAAGCCCATGTTGATAGCTTTATTTACAAAATAGGCCTTAAGGTTACATACCAAAACATAct < 1:87715/148‑1 (MQ=255) gggAAATCCCAAATTTTCAATCCTCGAGTTACATTTGGCTTATGGCAATAGCCAAAATCTATCCACGCAACAAGAGGCGTTTTCACTAAGCCCATGTTGATAGCTTTATTTACAAAATAGGCCTTAAGGTTACATACCAAAACATAct > 2:3223988/1‑148 (MQ=255) 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cTCGAGTTACATTTGGCTTATGGCAATAGCCAAAATCTATCCACGCAACAAGAGGCGTTTTCACTAAGCCCATGTTGATAGCTTTATTTACAAAATAGGCCTTAAGGTTACATACCAAAACATACTCTGGTGACCAGTACTCTGGGtt < 1:3384994/148‑1 (MQ=255) tCGAGTTACATTTGGCTTATGGCAATAGCCAAAATCTATCCACGCAACAAGAGGCGTTTTCACTAAGCCCATGTTGATAGCTTTATTTACAAAATAGGCCTTAAGGTTACATACCAAAACATACTCTGGTGACCAGTACTCTGGGttt < 2:1519945/148‑1 (MQ=255) gTTACATTTGGCTTATGGCAATAGCCAAAATCTATCCACGCAACAAGAGGCGTTTTGACTAAGCCCATGTTTATAGCTTTATTTACAAAATATGCCTTAAGGTTACATACCAAAACATACTCGGGTGTCCAGTACTCTGGGGTTTTTa > 1:1864144/1‑148 (MQ=255) ttACATTTGGCTTATGGCAATAGCCAAAATCTATCCACGCAACAAGAGGCGTTTTCACTAAGCCCATGTTGATAGCTTTATTTACAAAATAGGCCTTAAGGTTACATACCAAAACATACTCTGGTGACCAGTACTCTGGGTTTTTTaa < 2:2453608/148‑1 (MQ=255) ttACATTTGGCTTATGGCAATAGCCAAAATCTATCCACGCAACAAGAGGCGTTTTCACTAAGCCCATGTTGATAGCTTTATTTACAAAATAGGCCTTAAGGTTACATACCAAAACATACTCTGGTGACCAGTACTCTGGGTTTTTTaa > 2:3259560/1‑148 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |