Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,837,532 | C→A | 100% | P70Q (CCG→CAG) | ade → | cryptic adenine deaminase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,837,532 | 0 | C | A | 99.1% | 739.7 / ‑1.9 | 228 | P70Q (CCG→CAG) | ade | cryptic adenine deaminase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base A (110/116); total (112/116) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.40e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
CCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGA > CP009273/3837388‑3837676 | ccGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGc < 1:2491635/148‑1 (MQ=255) cGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCt < 2:1773364/148‑1 (MQ=255) tttCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCttt > 2:2112402/1‑148 (MQ=255) ccGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTTGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAg > 2:1148676/1‑148 (MQ=255) tGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCgg > 1:2381284/1‑148 (MQ=255) aCGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGa > 2:461675/1‑148 (MQ=255) aCGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGa > 2:1551315/1‑148 (MQ=255) cTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATTGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGc > 1:900179/1‑148 (MQ=255) cTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGc > 2:2372041/1‑148 (MQ=255) cTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGc > 2:1495321/1‑148 (MQ=255) tGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCt < 1:3411132/148‑1 (MQ=255) tGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCt < 1:2049393/148‑1 (MQ=255) tGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCt < 2:1812680/148‑1 (MQ=255) ttGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTcg < 2:2538884/148‑1 (MQ=255) tGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGCGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTcgc > 1:413077/1‑148 (MQ=255) ttatattatTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCa < 1:2247384/148‑1 (MQ=255) ttatattatTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCa < 1:2615020/148‑1 (MQ=255) ttattGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAAcggc < 1:115091/148‑1 (MQ=255) tGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTg < 1:532870/148‑1 (MQ=255) gATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGc < 2:2100951/148‑1 (MQ=255) aTAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGcc > 2:2432931/1‑148 (MQ=255) aTGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAgg > 2:911988/1‑148 (MQ=255) aTGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAgg > 2:890435/1‑148 (MQ=255) gTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGt < 1:695351/148‑1 (MQ=255) gTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGt > 2:1933079/1‑148 (MQ=255) gTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGt > 2:3158774/1‑148 (MQ=255) ttCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGa < 2:964592/148‑1 (MQ=255) ttCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGa > 1:2695828/1‑148 (MQ=255) cGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCt < 2:404794/148‑1 (MQ=255) cGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCt < 1:543691/148‑1 (MQ=255) ccTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCAc > 2:1375098/1‑148 (MQ=255) gATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTGACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTg < 2:1898483/148‑1 (MQ=255) aTCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGc < 1:3487034/148‑1 (MQ=255) aTCAATGGCGGAGAAATTTACTGCCCAATTTTGATTAAAGGACGTTACATTGACGGTGTTGGCGCATAATACACTGATGATCAGGCTTTGCAGCTGATAGATGCTCGCGGAGCAACTGCGGTCACAGGGTTTATTGATGCTCACCTGc > 2:1498474/1‑148 (MQ=255) tCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTAAAATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTGTGCTGCGGATTGATGCTCGCGGCGCACCGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCa > 2:1487120/1‑148 (MQ=255) cAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCat < 1:2707505/148‑1 (MQ=255) aTGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCatat < 2:1422114/148‑1 (MQ=255) aTGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCatat < 1:1867043/148‑1 (MQ=255) gCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGa > 1:1096052/1‑148 (MQ=255) gCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGa > 1:2781943/1‑148 (MQ=255) gagaAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATc > 2:322708/1‑148 (MQ=255) gagaAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATc > 1:730226/1‑148 (MQ=255) agaAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATcc > 2:258199/1‑148 (MQ=255) aaaTTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAg > 1:3449127/1‑148 (MQ=255) aaaTTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCAGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAg < 2:2769438/148‑1 (MQ=255) aaTTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGc < 2:64594/148‑1 (MQ=255) aTTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATAAACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTAGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCa > 1:1935338/1‑148 (MQ=255) ttCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCatg < 1:2101589/148‑1 (MQ=255) gtCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCatg < 2:3430435/147‑1 (MQ=255) tCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCatga < 1:69085/148‑1 (MQ=255) tCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCatga < 1:1058797/148‑1 (MQ=255) cGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCatgatg < 2:3120847/148‑1 (MQ=255) cGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCatgatg < 1:95246/148‑1 (MQ=255) cGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCatgatg > 2:2223472/1‑148 (MQ=255) 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aaTTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCg > 2:2702493/1‑148 (MQ=255) aTTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCgg > 2:19470/1‑148 (MQ=255) tgtgATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTc > 1:1422374/1‑148 (MQ=255) gtgATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCa < 1:2210317/148‑1 (MQ=255) gtgATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCa < 1:1033219/148‑1 (MQ=255) ttAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCCGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACttt > 2:1045660/1‑148 (MQ=255) ttAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACttt > 2:2971649/1‑148 (MQ=255) tAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACtttt < 1:3263698/148‑1 (MQ=255) tAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACtttt > 2:1274075/1‑148 (MQ=255) aaaGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTg < 2:535505/148‑1 (MQ=255) 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tACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTa > 2:2050817/1‑148 (MQ=255) tACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTa < 1:19470/148‑1 (MQ=255) aCATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTAc < 2:2910245/148‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCt > 1:2585536/1‑148 (MQ=255) tGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTg < 1:1478184/148‑1 (MQ=255) tGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTg > 2:837113/1‑148 (MQ=255) tGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTg < 1:1533945/148‑1 (MQ=255) tGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTg > 1:1367612/1‑148 (MQ=255) gtgtTGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCcgcg < 1:1283633/148‑1 (MQ=255) tGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGc < 2:2236886/148‑1 (MQ=255) tGGCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGc < 2:2236674/148‑1 (MQ=255) ggCGCAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGcc < 1:3238457/148‑1 (MQ=255) gcAGAATACACTGATGCTCAGGATTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTga < 1:1380734/148‑1 (MQ=255) cAGAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTgac > 2:2017477/1‑148 (MQ=255) gAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTgacga < 1:2471150/148‑1 (MQ=255) gAATACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTgacga < 1:1628621/148‑1 (MQ=255) aaTACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTgacgac > 1:2856592/1‑148 (MQ=255) tACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCg < 2:1871311/148‑1 (MQ=255) tACACTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCg < 2:95443/148‑1 (MQ=255) cacTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGtt > 1:3319091/1‑148 (MQ=255) cTGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTAt > 1:2443079/1‑148 (MQ=255) tGATGCTGAGGCTTTGCAGCGGTTTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATTTTGAATCCAGCTTGTTGACGCCGGTCACTTTTGAATCCGCTACCCTTCCGCGCGGCCTGACGACCGTTAtt < 1:3404401/148‑1 (MQ=255) tGATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTAtt < 2:3097217/148‑1 (MQ=255) gATGCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTAttt > 2:3400614/1‑148 (MQ=255) gCTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCg < 1:1844179/148‑1 (MQ=255) cTCAGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGa > 2:72388/1‑148 (MQ=255) | CCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGACCTGATCAATGGCGGAGAAATTTCCGGCCCAATTGTGATTAAAGGACGTTACATTGCCGGTGTTGGCGCAGAATACACTGATGCTCCGGCTTTGCAGCGGATTGATGCTCGCGGCGCAACGGCGGTGCCAGGGTTTATTGATGCTCACCTGCATATTGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGA > CP009273/3837388‑3837676 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |