Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,888,274 | C→A | 100% | P88Q (CCG→CAG) | chrR → | chromate reductase, Class I, flavoprotein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,888,274 | 0 | C | A | 98.6% | 690.9 / 0.8 | 233 | P88Q (CCG→CAG) | chrR | chromate reductase, Class I, flavoprotein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/2); new base A (128/100); total (130/103) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
TTACCATCCATTGCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTT > CP009273/3888129‑3888418 | ttACCATCCATTGCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAgg > 2:3144876/1‑148 (MQ=255) aCCATCCATTGCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGt > 1:1837326/1‑148 (MQ=255) aCCATCCATTGCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCAAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGAAGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTAAAGGGt > 2:2634911/1‑148 (MQ=255) atccatTGCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTggg < 2:834147/148‑1 (MQ=255) atccatTGCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTggg < 2:636777/148‑1 (MQ=255) atccatTGCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTggg < 2:561124/148‑1 (MQ=255) tccatTGCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGGAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGc > 1:2161509/1‑148 (MQ=255) tccatTGCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGTTCCGTCAGGCTGACGTTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGc < 2:2963977/148‑1 (MQ=255) catTGCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGATGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTg > 1:2429563/1‑148 (MQ=255) atTGCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGa > 1:1336391/1‑148 (MQ=255) atTGCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGa > 1:1336434/1‑148 (MQ=255) tGCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGaaa > 1:1976687/1‑148 (MQ=255) gCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGaaaa < 2:3196863/148‑1 (MQ=255) gCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGaaaa < 2:2557097/148‑1 (MQ=255) cGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAAt < 1:1641562/148‑1 (MQ=255) gACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATg > 1:1871870/1‑148 (MQ=255) gACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATg > 1:3324453/1‑148 (MQ=255) cagtCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGcc < 1:2047107/145‑1 (MQ=255) aTTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCa < 2:1478074/148‑1 (MQ=255) tCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATc > 1:2307178/1‑148 (MQ=255) ccTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGa > 1:1665344/1‑148 (MQ=255) ccTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGa < 2:1365772/148‑1 (MQ=255) cTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGAc < 1:1397799/148‑1 (MQ=255) cTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTAATCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGAc > 2:2286409/1‑148 (MQ=255) ttGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACt > 1:9788/1‑148 (MQ=255) tGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCtt > 1:2516016/1‑148 (MQ=255) aCGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTc > 1:2143922/1‑148 (MQ=255) tGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATCCCATCGACTGGCTTTCCCGc < 2:2125349/148‑1 (MQ=255) gACGTACAGCAGTAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGTAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGcc < 1:2597060/148‑1 (MQ=255) gACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGcc > 1:554455/1‑148 (MQ=255) aCGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCt > 1:2567809/1‑148 (MQ=255) ccgcagGAAGAAGGTTGTCCAGCACCGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGAGGGTGTGGTGATCGTCACGCCGTAATATAACTACACGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCgg < 1:2221996/146‑1 (MQ=255) cagcagGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGACTATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCgg > 2:2404189/1‑148 (MQ=255) cagcagGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCgg > 2:2404136/1‑148 (MQ=255) cagGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATc > 1:641814/1‑148 (MQ=255) agtaagaagGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCTGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGTAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCa < 1:1058865/145‑1 (MQ=255) ggAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCaa > 2:3420125/1‑148 (MQ=255) gcagaagGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAAc > 2:1513863/3‑148 (MQ=255) gaagaaGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAAc > 1:2962893/1‑148 (MQ=255) aagaagGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAAcc > 1:3424414/1‑148 (MQ=255) aagaagGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAAcc > 1:923130/1‑148 (MQ=255) aagGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCt > 1:97920/1‑148 (MQ=255) ggTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTgg > 1:1211235/1‑148 (MQ=255) ttCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCCGGCTGACGGTGTGGTGATCGGCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCgg > 1:435450/1‑148 (MQ=255) cAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAAcc > 2:1960914/1‑148 (MQ=255) cAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAAcc > 1:1105371/1‑148 (MQ=255) aCGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTTGGTTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGTTGGGCTGAAAAATGCAATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCgg < 2:640286/148‑1 (MQ=255) aCGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCgg > 2:2098117/1‑148 (MQ=255) aCGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCgg > 2:2345152/1‑148 (MQ=255) aCGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCgg < 2:138494/148‑1 (MQ=255) ggTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTa < 2:2224073/148‑1 (MQ=255) gTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTAt > 2:380972/1‑148 (MQ=255) gTTGAAGCTCTGGCGGAACAGAGCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTAt < 2:2289259/148‑1 (MQ=255) ttGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTCAACCGGTAtt > 1:3075961/1‑148 (MQ=255) aaGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGAt < 2:3475399/148‑1 (MQ=255) aGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGAtt > 2:2562721/1‑148 (MQ=255) ctctGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCa > 1:3360923/1‑148 (MQ=255) tctGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAg < 2:1715817/148‑1 (MQ=255) attgCGGAACAGATACGTCAGGCTGACGGTGTTGTGATCGTCACGCCGGAATATAAATACTCGGTACAGGGTGGGATGAAAAATGCCATCGACTGTCTTTCACGCCTGCAGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGTTATTGATTCAGa > 2:1617087/4‑148 (MQ=255) ggCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGAcc < 2:1976672/148‑1 (MQ=255) gCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCa > 2:513482/1‑148 (MQ=255) gCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCa < 2:1722638/148‑1 (MQ=255) gCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCa > 1:911096/1‑148 (MQ=255) cAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCaa < 2:2209542/148‑1 (MQ=255) cAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCaa < 2:1279982/148‑1 (MQ=255) gATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATg > 1:746925/1‑148 (MQ=255) aTCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATgg > 1:3026477/1‑148 (MQ=255) ccGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGc > 2:1611493/1‑148 (MQ=255) tCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTg > 1:2397729/1‑148 (MQ=255) cAGGCTGACGGTGGGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACGACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGa < 1:94128/148‑1 (MQ=255) aGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTCAACCGGTATGGAGTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGag > 1:2496260/1‑147 (MQ=255) ggCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGAtt < 2:3112194/148‑1 (MQ=255) tgtgGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGgcgcg < 1:1236876/148‑1 (MQ=255) gATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGt > 2:2812245/1‑148 (MQ=255) 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tCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCa > 2:1996995/1‑148 (MQ=255) gacccGCCGGAATATAACTACGCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGt < 1:300211/144‑1 (MQ=255) gTCACGCCGTAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGt < 1:1545757/148‑1 (MQ=255) cACGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTAt < 2:1409967/148‑1 (MQ=255) cGCCGGAATATAACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCa < 2:1336434/148‑1 (MQ=255) 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ataACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCa < 1:3351103/148‑1 (MQ=255) taACTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAg < 2:3324453/148‑1 (MQ=255) aaCTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGa < 2:3307551/148‑1 (MQ=255) aaCTACTCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGa < 2:609210/148‑1 (MQ=255) actactCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGAt < 2:1306968/148‑1 (MQ=255) actactCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGAt > 1:2014203/1‑148 (MQ=255) ctactCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGAtt < 2:2567809/148‑1 (MQ=255) ctCGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTg > 2:1221927/1‑148 (MQ=255) cGGTACAGGGTGGGTTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGt > 1:3230633/1‑148 (MQ=255) cGGTACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGt > 1:2241808/1‑148 (MQ=255) tACAGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGtttt < 2:1105371/148‑1 (MQ=255) | TTACCATCCATTGCCGACATTCCCTTGTATGACGCTGACGTACAGCAGGAAGAAGGTTTTCCAGCAACGGTTGAAGCTCTGGCGGAACAGATCCGTCAGGCTGACGGTGTGGTGATCGTCACGCCGGAATATAACTACTCGGTACCGGGTGGGCTGAAAAATGCCATCGACTGGCTTTCCCGCCTGCCGGATCAACCGCTGGCCGGTAAACCGGTATTGATTCAGACCAGCTCAATGGGCGTGATTGGCGGCGCGCGCTGTCAGTATCACCTGCGCCAGATTCTGGTTTT > CP009273/3888129‑3888418 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |